Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HIZ4

Protein Details
Accession A0A1A0HIZ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
558-581AAAMRLKIKKFRKQRMGHRYPTPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
566-570KKFRK
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 10.333, cyto 9, cyto_nucl 5.833, extr 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKILKLPWLSHRAENKTLECYALDINSAGSKLASGGLDGKVKVWDLAQILQHADSSDTPGPAPERRAPLASMNRHNGVVTCVKFSPDGRFLASGSDDKIVLIWEKDEELAPRPKQFGETEPDAEHWTVRRRLVAHDNDVQDICWAPDALLLITVGLDRSIIIWHGATFERIKRYDLHQSMVKGVVFDPANKFFATASDDRSVRIFRYYKKPHGASAATHEFQMEQVVVDAFRKSPLTLYFRRMLWLPDGQHLAVPNATNGPVSSVVVINRGTWATDVSLIGHEAPCEVCAFAPVLFCVPGGDTHTTILATGGQDRTLAVWSTGLSKPLVVAHDIAQKPITDMAWTPDGQALFVSSLDGLITCVRFAPAELGEPVGADAIGLLLERYGGDDATVMPEGVDLLRLEGLARGRLLASGDNASTADLARLRVPPPRLGGATPRIDAGAAPAPAVVLTKTGRKRVAPTLISTYAGPAGPASHGLGALLPLRATAPLEVAFKISAKLSQTLYVLPKNGLQSAVHGRRLNIDMPAAGPGITDPDNDNEDMGFDAPNSALLQPLTAAAMRLKIKKFRKQRMGHRYPTPFKAVSDLPGILFSNQAIMNADLAKLVQADQVNVADTELVSTSSLDSVDESMYFRVIVAATTHELPGHDDSERPHSSHHSSHTRSIIEIRNGPPWPEDDEVLNTDPVQRTDFQDPTQVIVTCSDRAQLRSYALYFPFKIQHAVPVLLDRVLAYYVLISFEGTTQIIRANTGSYFLPCFELGANVVALRQKGRFFMVLTSLGQLFCWKFPALRSGRSRLEKVYSGVSVAPAVNAETFVPSAASQQDADARKDSKTQPAQVLVDNISALEIDEHDGLPIIVMQRTSCVYLYSVALMVWTKVLDPWYLLAYEKQELATMTVPTLNRQVFASVADLKLESIQRGEAGSYKFDETNSELKCSMRTRFEELAALSC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.56
4 0.53
5 0.46
6 0.37
7 0.32
8 0.27
9 0.21
10 0.19
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.12
23 0.15
24 0.19
25 0.19
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.21
34 0.22
35 0.22
36 0.23
37 0.23
38 0.23
39 0.19
40 0.19
41 0.15
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.21
47 0.24
48 0.26
49 0.32
50 0.32
51 0.35
52 0.37
53 0.4
54 0.39
55 0.45
56 0.5
57 0.53
58 0.55
59 0.55
60 0.54
61 0.52
62 0.51
63 0.42
64 0.37
65 0.36
66 0.29
67 0.27
68 0.26
69 0.27
70 0.29
71 0.3
72 0.33
73 0.29
74 0.3
75 0.29
76 0.29
77 0.28
78 0.29
79 0.3
80 0.23
81 0.21
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.19
96 0.27
97 0.29
98 0.32
99 0.34
100 0.34
101 0.36
102 0.36
103 0.36
104 0.35
105 0.37
106 0.37
107 0.36
108 0.37
109 0.36
110 0.34
111 0.3
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.31
116 0.34
117 0.32
118 0.39
119 0.47
120 0.49
121 0.48
122 0.5
123 0.5
124 0.49
125 0.47
126 0.41
127 0.31
128 0.25
129 0.19
130 0.13
131 0.11
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.15
155 0.19
156 0.25
157 0.26
158 0.28
159 0.28
160 0.33
161 0.42
162 0.41
163 0.41
164 0.39
165 0.39
166 0.4
167 0.4
168 0.35
169 0.25
170 0.23
171 0.23
172 0.2
173 0.21
174 0.23
175 0.23
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.18
180 0.19
181 0.22
182 0.19
183 0.21
184 0.25
185 0.25
186 0.25
187 0.28
188 0.28
189 0.22
190 0.28
191 0.28
192 0.3
193 0.4
194 0.48
195 0.55
196 0.63
197 0.64
198 0.59
199 0.62
200 0.57
201 0.49
202 0.49
203 0.47
204 0.38
205 0.36
206 0.33
207 0.26
208 0.23
209 0.22
210 0.14
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.18
223 0.24
224 0.28
225 0.33
226 0.36
227 0.35
228 0.37
229 0.35
230 0.3
231 0.27
232 0.29
233 0.25
234 0.25
235 0.27
236 0.25
237 0.25
238 0.24
239 0.21
240 0.17
241 0.15
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.1
317 0.1
318 0.12
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.18
324 0.18
325 0.18
326 0.16
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.1
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.06
362 0.05
363 0.03
364 0.03
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.03
373 0.04
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.1
413 0.11
414 0.15
415 0.17
416 0.18
417 0.2
418 0.21
419 0.21
420 0.2
421 0.23
422 0.25
423 0.25
424 0.23
425 0.21
426 0.18
427 0.17
428 0.16
429 0.14
430 0.12
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.12
441 0.15
442 0.19
443 0.22
444 0.22
445 0.26
446 0.31
447 0.38
448 0.32
449 0.32
450 0.34
451 0.32
452 0.32
453 0.28
454 0.22
455 0.16
456 0.14
457 0.12
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.1
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.14
492 0.17
493 0.17
494 0.16
495 0.15
496 0.16
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.11
501 0.13
502 0.21
503 0.25
504 0.27
505 0.27
506 0.26
507 0.28
508 0.3
509 0.28
510 0.2
511 0.16
512 0.12
513 0.11
514 0.12
515 0.09
516 0.07
517 0.06
518 0.05
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.11
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.06
532 0.04
533 0.05
534 0.04
535 0.05
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.09
548 0.12
549 0.17
550 0.19
551 0.28
552 0.35
553 0.44
554 0.54
555 0.6
556 0.67
557 0.71
558 0.8
559 0.83
560 0.85
561 0.83
562 0.81
563 0.8
564 0.74
565 0.68
566 0.62
567 0.52
568 0.43
569 0.4
570 0.32
571 0.25
572 0.23
573 0.2
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.12
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.1
599 0.1
600 0.09
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.08
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.11
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.14
637 0.22
638 0.23
639 0.21
640 0.21
641 0.24
642 0.28
643 0.31
644 0.36
645 0.38
646 0.4
647 0.44
648 0.47
649 0.43
650 0.4
651 0.42
652 0.4
653 0.35
654 0.37
655 0.34
656 0.36
657 0.36
658 0.35
659 0.3
660 0.26
661 0.27
662 0.23
663 0.21
664 0.17
665 0.19
666 0.21
667 0.21
668 0.19
669 0.15
670 0.17
671 0.17
672 0.17
673 0.17
674 0.15
675 0.18
676 0.23
677 0.25
678 0.23
679 0.27
680 0.27
681 0.27
682 0.28
683 0.25
684 0.2
685 0.2
686 0.22
687 0.17
688 0.17
689 0.18
690 0.17
691 0.18
692 0.21
693 0.2
694 0.2
695 0.22
696 0.23
697 0.24
698 0.25
699 0.27
700 0.25
701 0.25
702 0.27
703 0.25
704 0.26
705 0.22
706 0.25
707 0.24
708 0.24
709 0.22
710 0.2
711 0.2
712 0.18
713 0.17
714 0.12
715 0.1
716 0.09
717 0.08
718 0.06
719 0.05
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.11
735 0.1
736 0.12
737 0.13
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.14
742 0.12
743 0.13
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.08
750 0.09
751 0.11
752 0.11
753 0.12
754 0.14
755 0.14
756 0.16
757 0.18
758 0.19
759 0.18
760 0.2
761 0.22
762 0.22
763 0.21
764 0.22
765 0.2
766 0.18
767 0.17
768 0.18
769 0.15
770 0.13
771 0.16
772 0.14
773 0.15
774 0.16
775 0.26
776 0.27
777 0.35
778 0.41
779 0.45
780 0.53
781 0.58
782 0.59
783 0.53
784 0.54
785 0.49
786 0.45
787 0.41
788 0.33
789 0.29
790 0.26
791 0.23
792 0.19
793 0.15
794 0.13
795 0.1
796 0.1
797 0.09
798 0.09
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.08
803 0.09
804 0.08
805 0.1
806 0.1
807 0.12
808 0.1
809 0.12
810 0.19
811 0.21
812 0.24
813 0.27
814 0.27
815 0.27
816 0.34
817 0.36
818 0.4
819 0.44
820 0.47
821 0.48
822 0.52
823 0.53
824 0.48
825 0.49
826 0.4
827 0.33
828 0.27
829 0.21
830 0.15
831 0.13
832 0.1
833 0.07
834 0.06
835 0.07
836 0.09
837 0.09
838 0.09
839 0.09
840 0.08
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.11
848 0.13
849 0.15
850 0.14
851 0.14
852 0.13
853 0.15
854 0.16
855 0.15
856 0.14
857 0.11
858 0.12
859 0.12
860 0.11
861 0.1
862 0.09
863 0.08
864 0.09
865 0.11
866 0.11
867 0.11
868 0.12
869 0.13
870 0.14
871 0.15
872 0.16
873 0.18
874 0.19
875 0.19
876 0.18
877 0.17
878 0.17
879 0.19
880 0.19
881 0.16
882 0.15
883 0.18
884 0.19
885 0.2
886 0.26
887 0.24
888 0.22
889 0.23
890 0.23
891 0.19
892 0.2
893 0.22
894 0.18
895 0.18
896 0.18
897 0.17
898 0.17
899 0.2
900 0.21
901 0.18
902 0.16
903 0.16
904 0.16
905 0.16
906 0.17
907 0.18
908 0.19
909 0.21
910 0.22
911 0.24
912 0.24
913 0.24
914 0.26
915 0.26
916 0.32
917 0.31
918 0.32
919 0.3
920 0.3
921 0.36
922 0.37
923 0.39
924 0.39
925 0.41
926 0.46
927 0.49
928 0.5
929 0.49