Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0H5N8

Protein Details
Accession A0A1A0H5N8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-139VQSVRRNRKRGTKTGRANLKRRHLDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-135RRNRKRGTKTGRANLKRR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MYMKQISMPRVKKMSLDSNESFDDSGRQFLVRLFEDKKLGVTHAIRQRLGFDDSRLWKRFLARRLELIDTLDLSSKKASDQEDEIRRVAEVLRIEFRYDSQYFTDFDKLVRAAVQSVRRNRKRGTKTGRANLKRRHLDSESQSESSSTYTPSGPSSVNPEKNLFLSEISNLNTDGSDSLYDMSYSTSRVISSLDRARAAIDSIIRPTNIERKMSQSGIQLPPLLNVALAPHQLDNEKALLTLRLSLLWLMKRSKLCLSLASLHKNESLKIIGQSSITTVNALMLESSFSGLTHTSVEYLRDRLSLAGFQARFYRSLEPECPISGALDDETAVSTLETLVGCCVKDFGFDSVLYLIGEAFYFLILLEYPLVLRSSVHFRRVTDIPQAPGVFHRDFAKDQPVSLSNLAAVASELRSQAVSTSPSTDTHLTTTPVAPLTQDKKEKYLEVLPLPSNPEKERKQVKLKFLSSSLNFMFSIKNSAPPRFVEIVDNAKQAFRLNENQIYGLRNSKSGLVINTDLDLEQIFAHEQEIELEVFTQKFSPIPFSEITTAITPNPSSEDRSKIVLPLPLRQNVPPVLPSPIDRAHLPGYPRLPFLPKFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.52
3 0.57
4 0.51
5 0.5
6 0.51
7 0.48
8 0.4
9 0.3
10 0.3
11 0.22
12 0.23
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.19
17 0.25
18 0.22
19 0.27
20 0.27
21 0.3
22 0.33
23 0.33
24 0.33
25 0.29
26 0.28
27 0.3
28 0.29
29 0.34
30 0.38
31 0.44
32 0.42
33 0.41
34 0.42
35 0.39
36 0.41
37 0.35
38 0.3
39 0.33
40 0.4
41 0.48
42 0.48
43 0.46
44 0.44
45 0.51
46 0.55
47 0.54
48 0.56
49 0.51
50 0.55
51 0.58
52 0.58
53 0.51
54 0.46
55 0.39
56 0.3
57 0.27
58 0.25
59 0.21
60 0.18
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.26
68 0.35
69 0.41
70 0.45
71 0.44
72 0.4
73 0.37
74 0.34
75 0.29
76 0.24
77 0.19
78 0.19
79 0.23
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.25
84 0.28
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.23
89 0.23
90 0.25
91 0.28
92 0.22
93 0.21
94 0.23
95 0.21
96 0.19
97 0.2
98 0.17
99 0.16
100 0.22
101 0.3
102 0.34
103 0.43
104 0.54
105 0.59
106 0.65
107 0.68
108 0.73
109 0.73
110 0.76
111 0.76
112 0.75
113 0.78
114 0.82
115 0.86
116 0.85
117 0.85
118 0.84
119 0.84
120 0.82
121 0.75
122 0.73
123 0.67
124 0.66
125 0.63
126 0.63
127 0.57
128 0.49
129 0.46
130 0.38
131 0.35
132 0.28
133 0.23
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.21
143 0.28
144 0.32
145 0.33
146 0.34
147 0.33
148 0.34
149 0.34
150 0.26
151 0.19
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.16
179 0.21
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.23
184 0.21
185 0.21
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.22
195 0.23
196 0.25
197 0.23
198 0.28
199 0.32
200 0.32
201 0.33
202 0.28
203 0.32
204 0.32
205 0.32
206 0.28
207 0.24
208 0.23
209 0.21
210 0.17
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.12
235 0.15
236 0.15
237 0.19
238 0.2
239 0.22
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.21
244 0.23
245 0.26
246 0.29
247 0.32
248 0.3
249 0.28
250 0.31
251 0.29
252 0.26
253 0.21
254 0.18
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.15
297 0.15
298 0.15
299 0.17
300 0.19
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.13
309 0.12
310 0.09
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.06
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.07
360 0.15
361 0.18
362 0.24
363 0.25
364 0.26
365 0.3
366 0.32
367 0.33
368 0.33
369 0.32
370 0.28
371 0.3
372 0.29
373 0.25
374 0.25
375 0.28
376 0.19
377 0.18
378 0.19
379 0.18
380 0.2
381 0.22
382 0.28
383 0.23
384 0.23
385 0.25
386 0.24
387 0.24
388 0.24
389 0.21
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.1
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.19
410 0.2
411 0.18
412 0.19
413 0.2
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.15
420 0.13
421 0.18
422 0.21
423 0.27
424 0.33
425 0.33
426 0.36
427 0.39
428 0.39
429 0.37
430 0.38
431 0.35
432 0.32
433 0.35
434 0.32
435 0.31
436 0.35
437 0.34
438 0.31
439 0.29
440 0.34
441 0.33
442 0.41
443 0.48
444 0.52
445 0.6
446 0.64
447 0.71
448 0.72
449 0.72
450 0.67
451 0.61
452 0.6
453 0.5
454 0.49
455 0.4
456 0.33
457 0.29
458 0.26
459 0.25
460 0.18
461 0.23
462 0.17
463 0.25
464 0.26
465 0.28
466 0.3
467 0.3
468 0.36
469 0.32
470 0.33
471 0.28
472 0.29
473 0.34
474 0.34
475 0.34
476 0.28
477 0.26
478 0.26
479 0.24
480 0.23
481 0.2
482 0.24
483 0.28
484 0.33
485 0.33
486 0.35
487 0.35
488 0.35
489 0.32
490 0.32
491 0.27
492 0.23
493 0.23
494 0.23
495 0.24
496 0.24
497 0.23
498 0.22
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.2
503 0.17
504 0.15
505 0.13
506 0.09
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.09
524 0.11
525 0.12
526 0.17
527 0.17
528 0.21
529 0.22
530 0.25
531 0.27
532 0.26
533 0.28
534 0.23
535 0.23
536 0.2
537 0.21
538 0.18
539 0.16
540 0.2
541 0.2
542 0.24
543 0.27
544 0.32
545 0.32
546 0.36
547 0.36
548 0.34
549 0.36
550 0.35
551 0.33
552 0.36
553 0.4
554 0.42
555 0.43
556 0.41
557 0.44
558 0.41
559 0.42
560 0.36
561 0.31
562 0.31
563 0.3
564 0.3
565 0.31
566 0.32
567 0.32
568 0.3
569 0.32
570 0.31
571 0.33
572 0.34
573 0.35
574 0.36
575 0.36
576 0.38
577 0.37
578 0.4
579 0.38
580 0.43
581 0.46