Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HB50

Protein Details
Accession A0A1A0HB50    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-166LIRREHFKKRADNRDRSPSRBasic
174-199RTLHDSRSRHRDSRERKEGRDRPGDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-211KKRADNRDRSPSRLHGEGSSRTLHDSRSRHRDSRERKEGRDRPGDRRGHGRDSRSHRS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPGDLNLKKSWNPALMKNQKKVWEREQQALAELQSIKQRQKEIAQEREKEHMIRLQYGSDPSSMPTKDKLELNKLGWMYNDGPKTTADDGSGFREVDEDFLARSDEIQLLVRGNKAVQPAVGSRFEKVAAVGRLAPSALLSDDPLLLIRREHFKKRADNRDRSPSRLHGEGSSRTLHDSRSRHRDSRERKEGRDRPGDRRGHGRDSRSHRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.58
3 0.65
4 0.67
5 0.67
6 0.69
7 0.72
8 0.71
9 0.69
10 0.69
11 0.64
12 0.66
13 0.64
14 0.56
15 0.51
16 0.46
17 0.37
18 0.31
19 0.27
20 0.21
21 0.23
22 0.26
23 0.28
24 0.3
25 0.33
26 0.32
27 0.37
28 0.46
29 0.48
30 0.55
31 0.59
32 0.6
33 0.6
34 0.62
35 0.58
36 0.49
37 0.42
38 0.36
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.23
45 0.22
46 0.19
47 0.17
48 0.14
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.2
54 0.22
55 0.26
56 0.29
57 0.31
58 0.35
59 0.35
60 0.35
61 0.33
62 0.31
63 0.27
64 0.26
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.18
69 0.19
70 0.18
71 0.21
72 0.19
73 0.17
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.16
78 0.17
79 0.14
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.14
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.16
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.1
136 0.18
137 0.23
138 0.3
139 0.36
140 0.42
141 0.52
142 0.61
143 0.7
144 0.72
145 0.76
146 0.77
147 0.82
148 0.79
149 0.73
150 0.69
151 0.64
152 0.59
153 0.52
154 0.46
155 0.39
156 0.41
157 0.4
158 0.37
159 0.33
160 0.29
161 0.3
162 0.29
163 0.28
164 0.31
165 0.34
166 0.4
167 0.48
168 0.55
169 0.57
170 0.64
171 0.71
172 0.74
173 0.78
174 0.8
175 0.77
176 0.77
177 0.83
178 0.82
179 0.81
180 0.81
181 0.76
182 0.73
183 0.76
184 0.75
185 0.68
186 0.7
187 0.68
188 0.67
189 0.68
190 0.65
191 0.65