FuNGI

A0A1A0HGE9

Protein Details

Accession

A0A1A0HGE9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
513-536	PALGGPKKARGKLRRKKGAMTDTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
517-530	GPKKARGKLRRKKG

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 8.5, cyto_nucl 6, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MRAKSTIIPKSHITFSLSPSHRNSTSHSRPGYVLVTFLQEIRVPVSSCYRESHLPELVPFPRISPSSHFSQSVIVTVSHRSHSQSVSFSQSAVVLAQSHFSQYVLALIVSPNPPNQSWFSQSVLVLTSVLFHTHHKSQPTKPSQPFPVKPDLLSQSQALPINRILRRRAALCASRDAHRSHLPPAHLSPTPRKTLHMGRKFDKKAAKTYSVVHRAHDDALYFDNDAPQHVLVEVPDRPKHGQKGPARTPGKTPPAPPLAALDARVRERGARTAAPQNPRANEGLAALYGVLYDDSSYDYMQHLRPLGQAPDSVFIAAGAAGGPAKPRRTIDDLVRDALPSQTTRAVAHDELESIPRELQGLNPDMDPRVREVLEALEDDAYVEHGPGAGDDVFADLLQSGPADEGLDAGDYDEWDMDNYQDAGYSDAGDSDGSAGFGDPALAPAPVVLDIPYGAGEAPADAGLAGVVDNAWERAFQRFQKAQKDRPNAWDSDDDFDDDDDAAGEAPDTLGELPALGGPKKARGKLRRKKGAMTDTSAFSMSSSALFRSEGLTLLDDRFEQLAKTFEHAEDDAPRAEFSMAEERGDLEDMLDDFLDNYELGSGGRKLVKKDPRIDAMKAAAASVSRGKAAQGRQKDARPAAPAPDSAALDAAFGHMALE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.45
4	0.43
5	0.44
6	0.45
7	0.5
8	0.46
9	0.45
10	0.48
11	0.48
12	0.55
13	0.58
14	0.56
15	0.51
16	0.5
17	0.52
18	0.48
19	0.38
20	0.3
21	0.22
22	0.23
23	0.21
24	0.2
25	0.18
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.19
30	0.17
31	0.18
32	0.26
33	0.28
34	0.29
35	0.31
36	0.33
37	0.35
38	0.39
39	0.42
40	0.39
41	0.37
42	0.36
43	0.39
44	0.37
45	0.35
46	0.3
47	0.26
48	0.26
49	0.26
50	0.28
51	0.27
52	0.29
53	0.33
54	0.36
55	0.36
56	0.32
57	0.34
58	0.32
59	0.28
60	0.25
61	0.2
62	0.18
63	0.21
64	0.23
65	0.21
66	0.22
67	0.24
68	0.25
69	0.27
70	0.29
71	0.28
72	0.29
73	0.34
74	0.33
75	0.29
76	0.26
77	0.24
78	0.21
79	0.17
80	0.15
81	0.09
82	0.09
83	0.11
84	0.1
85	0.11
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.08
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.11
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.16
100	0.17
101	0.2
102	0.24
103	0.24
104	0.28
105	0.29
106	0.3
107	0.29
108	0.29
109	0.27
110	0.24
111	0.2
112	0.15
113	0.12
114	0.11
115	0.09
116	0.1
117	0.1
118	0.11
119	0.15
120	0.21
121	0.25
122	0.31
123	0.37
124	0.43
125	0.53
126	0.6
127	0.65
128	0.65
129	0.68
130	0.71
131	0.75
132	0.73
133	0.68
134	0.68
135	0.59
136	0.54
137	0.53
138	0.48
139	0.41
140	0.37
141	0.32
142	0.24
143	0.27
144	0.3
145	0.24
146	0.22
147	0.23
148	0.29
149	0.32
150	0.34
151	0.33
152	0.35
153	0.38
154	0.38
155	0.39
156	0.38
157	0.41
158	0.39
159	0.44
160	0.41
161	0.41
162	0.42
163	0.39
164	0.37
165	0.37
166	0.36
167	0.34
168	0.37
169	0.35
170	0.35
171	0.36
172	0.35
173	0.32
174	0.34
175	0.37
176	0.38
177	0.42
178	0.4
179	0.39
180	0.4
181	0.48
182	0.55
183	0.55
184	0.56
185	0.56
186	0.65
187	0.66
188	0.67
189	0.64
190	0.56
191	0.56
192	0.56
193	0.55
194	0.47
195	0.5
196	0.53
197	0.55
198	0.52
199	0.44
200	0.4
201	0.37
202	0.36
203	0.31
204	0.22
205	0.14
206	0.15
207	0.15
208	0.13
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.1
215	0.09
216	0.08
217	0.09
218	0.06
219	0.1
220	0.12
221	0.15
222	0.16
223	0.19
224	0.22
225	0.26
226	0.32
227	0.34
228	0.4
229	0.42
230	0.52
231	0.55
232	0.63
233	0.61
234	0.56
235	0.56
236	0.55
237	0.57
238	0.49
239	0.44
240	0.41
241	0.42
242	0.41
243	0.37
244	0.31
245	0.26
246	0.23
247	0.23
248	0.19
249	0.17
250	0.18
251	0.19
252	0.17
253	0.15
254	0.16
255	0.18
256	0.19
257	0.18
258	0.2
259	0.28
260	0.33
261	0.36
262	0.41
263	0.41
264	0.39
265	0.39
266	0.37
267	0.29
268	0.23
269	0.2
270	0.14
271	0.1
272	0.09
273	0.06
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.02
279	0.02
280	0.03
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.09
287	0.09
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.05
310	0.07
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.14
315	0.2
316	0.23
317	0.27
318	0.34
319	0.34
320	0.35
321	0.34
322	0.3
323	0.25
324	0.23
325	0.18
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.13
333	0.12
334	0.13
335	0.12
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.11
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.11
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.04
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.04
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.02
453	0.02
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.04
458	0.05
459	0.06
460	0.1
461	0.15
462	0.17
463	0.26
464	0.32
465	0.38
466	0.48
467	0.55
468	0.6
469	0.66
470	0.72
471	0.68
472	0.71
473	0.69
474	0.59
475	0.56
476	0.52
477	0.44
478	0.4
479	0.36
480	0.28
481	0.24
482	0.23
483	0.2
484	0.13
485	0.11
486	0.07
487	0.07
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.06
501	0.08
502	0.08
503	0.11
504	0.11
505	0.2
506	0.26
507	0.31
508	0.4
509	0.48
510	0.6
511	0.67
512	0.78
513	0.8
514	0.79
515	0.81
516	0.81
517	0.81
518	0.75
519	0.71
520	0.63
521	0.54
522	0.51
523	0.44
524	0.34
525	0.24
526	0.19
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.12
536	0.11
537	0.11
538	0.12
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.12
543	0.13
544	0.13
545	0.12
546	0.11
547	0.11
548	0.14
549	0.14
550	0.17
551	0.18
552	0.17
553	0.21
554	0.21
555	0.22
556	0.21
557	0.23
558	0.22
559	0.21
560	0.2
561	0.17
562	0.17
563	0.15
564	0.15
565	0.22
566	0.2
567	0.2
568	0.2
569	0.2
570	0.21
571	0.22
572	0.18
573	0.09
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.1
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.09
582	0.07
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.09
588	0.1
589	0.13
590	0.19
591	0.22
592	0.26
593	0.35
594	0.45
595	0.5
596	0.58
597	0.62
598	0.66
599	0.68
600	0.67
601	0.63
602	0.57
603	0.52
604	0.43
605	0.36
606	0.27
607	0.22
608	0.22
609	0.21
610	0.19
611	0.16
612	0.16
613	0.18
614	0.23
615	0.31
616	0.38
617	0.41
618	0.49
619	0.55
620	0.61
621	0.68
622	0.67
623	0.64
624	0.61
625	0.55
626	0.53
627	0.5
628	0.44
629	0.39
630	0.38
631	0.33
632	0.28
633	0.26
634	0.2
635	0.16
636	0.16
637	0.13
638	0.08

A0A1A0HGE9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer