Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HDR2

Protein Details
Accession A0A1A0HDR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-214TVAKQAPKIRKKSKKSSAVKKLRVTKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-209KQAPKIRKKSKKSSAVKKL
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.833, cyto 8, cyto_mito 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR003750  Put_MeTrfase  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF02598  Methyltrn_RNA_3  
Amino Acid Sequences MVSNLPTNSGEESTNPSNDVKISLCIPSSVISQSNASNLEHITHVAYQIAKAATIYNVVEIVTLEIPSKRDRQDKASDAKESQISLPGDNGNKKIKFNSVAEEKTQSDFQEQTNEGGNDTTDKNNENNALLLASLLQYFVTPKYLVKSVFRNSPHVKKFKYAEKLPTLTALPFMKNEGVRKAFKEGFTVAKQAPKIRKKSKKSSAVKKLRVTKYVNIGDSKLFELSGPEVPTNVRVTVDLKNKRVVSPESAYAMTACKASYGYHVRLAKTVTSVFTELSHADGYTESIFVNADNFFGDISEVHIPEKKNDWQGQILLVIGSLNDLEYVFNQESIDEIDSIAEMFDGQMIVPPGLRIEDAAFVSLAKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.25
4 0.24
5 0.24
6 0.25
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.12
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.11
41 0.13
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.16
55 0.21
56 0.25
57 0.32
58 0.36
59 0.42
60 0.5
61 0.56
62 0.6
63 0.6
64 0.59
65 0.52
66 0.52
67 0.47
68 0.39
69 0.32
70 0.3
71 0.26
72 0.22
73 0.22
74 0.22
75 0.25
76 0.27
77 0.3
78 0.32
79 0.33
80 0.34
81 0.35
82 0.36
83 0.37
84 0.35
85 0.39
86 0.38
87 0.39
88 0.39
89 0.41
90 0.37
91 0.34
92 0.33
93 0.27
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.21
100 0.25
101 0.24
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.12
109 0.14
110 0.15
111 0.17
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.13
132 0.15
133 0.17
134 0.23
135 0.25
136 0.31
137 0.33
138 0.38
139 0.41
140 0.48
141 0.53
142 0.53
143 0.51
144 0.5
145 0.53
146 0.53
147 0.56
148 0.51
149 0.51
150 0.5
151 0.5
152 0.45
153 0.42
154 0.35
155 0.26
156 0.25
157 0.19
158 0.14
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.16
164 0.17
165 0.2
166 0.21
167 0.22
168 0.26
169 0.26
170 0.25
171 0.26
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.25
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.25
180 0.32
181 0.36
182 0.44
183 0.51
184 0.6
185 0.66
186 0.75
187 0.8
188 0.82
189 0.84
190 0.85
191 0.86
192 0.87
193 0.86
194 0.82
195 0.82
196 0.76
197 0.73
198 0.67
199 0.6
200 0.58
201 0.55
202 0.5
203 0.41
204 0.38
205 0.32
206 0.29
207 0.25
208 0.16
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.13
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.19
225 0.28
226 0.32
227 0.33
228 0.39
229 0.4
230 0.4
231 0.42
232 0.38
233 0.34
234 0.31
235 0.31
236 0.28
237 0.27
238 0.26
239 0.22
240 0.2
241 0.15
242 0.12
243 0.09
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.14
248 0.19
249 0.21
250 0.28
251 0.31
252 0.31
253 0.33
254 0.34
255 0.28
256 0.25
257 0.24
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.05
286 0.08
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.17
291 0.18
292 0.21
293 0.27
294 0.29
295 0.35
296 0.39
297 0.42
298 0.41
299 0.42
300 0.4
301 0.35
302 0.29
303 0.2
304 0.16
305 0.12
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.06
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.1
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.14