Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HHA4

Protein Details
Accession A0A1A0HHA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31SDGHKRKSKSPSLSNEHEPKRBasic
258-280EETAQKSKKKKSRSIKIDLCCFQHydrophilic
322-346FHEGKMCLKDRRKCLRHNGWFNLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-270SKKKKSR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037869  Spp1/CFP1  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MDGKHDFDLESDGHKRKSKSPSLSNEHEPKRPKLESDDWEKLEDIAKQYKKFVAAPKFSLNSEELFCVCRKPDSDGELMISCDGCEEWFHTKCMRIDPEYTQLLDKFFCKFCQWKGSGVTRWNRKCRMLGCLKPIRATEKSKYCSDECGEAFMLLKLSGSQVLTLSDLNFVVNYCGSYAELNSMGSTFPELPEVLLLDMEKLPELVQKVLTDNEEMQEKIQAQLEQNKAKTKYLSRVKEMVAIINEEILALAAPSHIEETAQKSKKKKSRSIKIDLCCFQCDLNTNLFQDLPKDKSIDTDVRVTFEEEITYAVEQYNAGPDFHEGKMCLKDRRKCLRHNGWFNLLSDRLWKRLEELQTTLDKLQKEKSVVLRNYSISVYERQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.5
4 0.59
5 0.63
6 0.65
7 0.69
8 0.74
9 0.76
10 0.8
11 0.81
12 0.81
13 0.77
14 0.74
15 0.71
16 0.67
17 0.67
18 0.63
19 0.57
20 0.55
21 0.59
22 0.58
23 0.62
24 0.64
25 0.57
26 0.56
27 0.53
28 0.45
29 0.39
30 0.35
31 0.3
32 0.31
33 0.35
34 0.35
35 0.37
36 0.4
37 0.4
38 0.42
39 0.46
40 0.47
41 0.47
42 0.5
43 0.54
44 0.53
45 0.5
46 0.48
47 0.4
48 0.32
49 0.28
50 0.25
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.23
59 0.28
60 0.3
61 0.33
62 0.31
63 0.33
64 0.3
65 0.29
66 0.23
67 0.17
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.09
74 0.15
75 0.17
76 0.19
77 0.21
78 0.26
79 0.28
80 0.34
81 0.36
82 0.33
83 0.35
84 0.37
85 0.41
86 0.38
87 0.36
88 0.31
89 0.27
90 0.25
91 0.23
92 0.2
93 0.18
94 0.17
95 0.18
96 0.2
97 0.23
98 0.26
99 0.35
100 0.35
101 0.36
102 0.41
103 0.46
104 0.47
105 0.51
106 0.55
107 0.56
108 0.63
109 0.66
110 0.65
111 0.61
112 0.62
113 0.56
114 0.57
115 0.57
116 0.54
117 0.56
118 0.59
119 0.57
120 0.54
121 0.53
122 0.49
123 0.45
124 0.45
125 0.44
126 0.44
127 0.47
128 0.47
129 0.49
130 0.44
131 0.43
132 0.39
133 0.37
134 0.28
135 0.27
136 0.24
137 0.2
138 0.2
139 0.16
140 0.14
141 0.08
142 0.08
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.21
211 0.26
212 0.28
213 0.3
214 0.35
215 0.35
216 0.35
217 0.37
218 0.34
219 0.38
220 0.43
221 0.46
222 0.45
223 0.47
224 0.46
225 0.48
226 0.44
227 0.38
228 0.29
229 0.25
230 0.2
231 0.16
232 0.15
233 0.09
234 0.08
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.13
247 0.23
248 0.29
249 0.33
250 0.39
251 0.49
252 0.55
253 0.64
254 0.67
255 0.68
256 0.74
257 0.79
258 0.83
259 0.83
260 0.82
261 0.82
262 0.77
263 0.69
264 0.59
265 0.5
266 0.4
267 0.32
268 0.29
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.21
273 0.21
274 0.21
275 0.19
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.22
281 0.21
282 0.23
283 0.29
284 0.29
285 0.27
286 0.31
287 0.3
288 0.3
289 0.31
290 0.3
291 0.25
292 0.21
293 0.18
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.15
308 0.19
309 0.19
310 0.21
311 0.17
312 0.2
313 0.28
314 0.32
315 0.39
316 0.44
317 0.52
318 0.6
319 0.7
320 0.74
321 0.75
322 0.81
323 0.83
324 0.85
325 0.87
326 0.83
327 0.8
328 0.76
329 0.68
330 0.63
331 0.53
332 0.42
333 0.41
334 0.37
335 0.33
336 0.31
337 0.3
338 0.29
339 0.35
340 0.41
341 0.37
342 0.38
343 0.38
344 0.41
345 0.43
346 0.42
347 0.39
348 0.34
349 0.32
350 0.35
351 0.36
352 0.36
353 0.39
354 0.45
355 0.52
356 0.54
357 0.57
358 0.56
359 0.52
360 0.51
361 0.45
362 0.39
363 0.31