Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HH25

Protein Details
Accession A0A1A0HH25    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
585-605RWGERDERRRRGPRHGQDRKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
577-607KFELHDKGRWGERDERRRRGPRHGQDRKLAA
Subcellular Location(s) plas 10, cyto 8, mito 3, nucl 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
Amino Acid Sequences MVSVTLLTSGAPRNACKATMLDFDGEIRVLADPGWDGLDPRDVLFLEKHLGAVDLMVLSQSTPEHIGAYVLLCVHFPMLMAAIPVYATVAVSQLARVATVEFYRARGVLGPVALALVEVGDVDEWLDKVVLVKYRQNMAMLENRLTVTAYNSGHTLGGAFWLLARRAERVVYAPSWNHLRDSFLNSAGFLSPSTGAPEPALVRPTALVTGAGVGSSMPHQRRAEKFLLLVDATLANGGAVLLPVAISGRFLELVHIVDEHLARLPGAAVPVYFLLYSGTKVLSYAGSLLDWMSAQLAKQHEAQAADARAYTQVPFEPAKVDLLLDPRELVRLPGPKIVFASGVDLAPGDLSAQAMQWLCQDEKLTLILTEKTPCGASDPVAARLYAQWHALAAQKNGGLPEDGVPVPLEQAVATDLWPAEEPLAGRELADFKARVAAARRQKLLAKVRDTKNKHILAAEDDSLSEDEPSSEDDAPEKPAAAESAAPSAAAAPLPAADVLPGHEVFVGDYISESLRTNKPIDIRVTVRMRPKQLMFPMPVSGKKRKVDDYGEVIDTKDFLLADDNSANNKLISESKRKFELHDKGRWGERDERRRRGPRHGQDRKLAASKNKLTPQEVLNNEVLQRNLDALFRPVKRVTPHDLGRPLPPLQLRCGLSFVDLAGRVDVRSLVMIVSVLRPQNVVLLPDASCSPGADPLMDGRRLLQAAFSKQTLEQKSSAASSAHLATSRFGALTAGLGGTPRSQSSEMAVRVTQPNVVEQIGGDGAGRLREFEVRLDEQLDALLVWQKLAGNHRITKVHGELGVYELQLTLNKQHADTLALSSQFILTPVSLVEDKLRQLPVLADSAGSGAGFGSGLAIGNVRLPELKKKLLALDMAAEFKGEGMLVVNDEVAIRKTTTGAYQGEDTGDLVLDGHIGPLYYRVRDCIKEMLAFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.27
4 0.27
5 0.27
6 0.3
7 0.31
8 0.27
9 0.25
10 0.26
11 0.25
12 0.22
13 0.17
14 0.12
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.17
30 0.19
31 0.19
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.15
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.15
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.16
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.06
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.08
116 0.11
117 0.16
118 0.19
119 0.24
120 0.28
121 0.32
122 0.34
123 0.34
124 0.31
125 0.3
126 0.35
127 0.33
128 0.31
129 0.28
130 0.26
131 0.25
132 0.24
133 0.2
134 0.15
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.21
158 0.2
159 0.23
160 0.22
161 0.25
162 0.29
163 0.29
164 0.29
165 0.25
166 0.28
167 0.27
168 0.32
169 0.31
170 0.28
171 0.28
172 0.25
173 0.26
174 0.22
175 0.19
176 0.13
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.14
204 0.14
205 0.21
206 0.23
207 0.31
208 0.35
209 0.41
210 0.43
211 0.38
212 0.38
213 0.33
214 0.34
215 0.27
216 0.23
217 0.17
218 0.13
219 0.11
220 0.09
221 0.07
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.17
287 0.18
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.2
292 0.18
293 0.16
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.08
299 0.08
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.18
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.19
326 0.14
327 0.15
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.08
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.15
365 0.17
366 0.19
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.14
373 0.13
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.14
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.15
423 0.21
424 0.28
425 0.32
426 0.33
427 0.32
428 0.34
429 0.4
430 0.45
431 0.45
432 0.43
433 0.48
434 0.53
435 0.61
436 0.63
437 0.62
438 0.63
439 0.58
440 0.52
441 0.44
442 0.39
443 0.32
444 0.3
445 0.24
446 0.15
447 0.13
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.07
452 0.05
453 0.04
454 0.05
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.04
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.06
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.06
500 0.09
501 0.11
502 0.14
503 0.15
504 0.17
505 0.19
506 0.22
507 0.24
508 0.24
509 0.25
510 0.3
511 0.32
512 0.34
513 0.39
514 0.4
515 0.4
516 0.4
517 0.4
518 0.38
519 0.39
520 0.39
521 0.34
522 0.31
523 0.32
524 0.3
525 0.33
526 0.33
527 0.35
528 0.37
529 0.38
530 0.4
531 0.41
532 0.44
533 0.43
534 0.42
535 0.41
536 0.37
537 0.35
538 0.32
539 0.28
540 0.23
541 0.19
542 0.14
543 0.09
544 0.06
545 0.05
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.14
558 0.18
559 0.27
560 0.29
561 0.32
562 0.37
563 0.38
564 0.4
565 0.43
566 0.49
567 0.46
568 0.5
569 0.52
570 0.5
571 0.54
572 0.52
573 0.47
574 0.47
575 0.49
576 0.53
577 0.58
578 0.63
579 0.68
580 0.75
581 0.75
582 0.76
583 0.78
584 0.77
585 0.8
586 0.82
587 0.78
588 0.75
589 0.75
590 0.68
591 0.63
592 0.56
593 0.5
594 0.49
595 0.49
596 0.5
597 0.51
598 0.5
599 0.46
600 0.45
601 0.44
602 0.43
603 0.38
604 0.35
605 0.3
606 0.28
607 0.27
608 0.26
609 0.22
610 0.15
611 0.14
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.1
616 0.12
617 0.18
618 0.18
619 0.22
620 0.22
621 0.26
622 0.28
623 0.33
624 0.37
625 0.38
626 0.41
627 0.44
628 0.47
629 0.44
630 0.44
631 0.43
632 0.36
633 0.32
634 0.32
635 0.27
636 0.26
637 0.31
638 0.3
639 0.27
640 0.28
641 0.24
642 0.21
643 0.2
644 0.17
645 0.13
646 0.12
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.07
661 0.09
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.14
667 0.14
668 0.14
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.14
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.09
678 0.1
679 0.1
680 0.09
681 0.09
682 0.13
683 0.18
684 0.18
685 0.17
686 0.16
687 0.19
688 0.19
689 0.18
690 0.17
691 0.18
692 0.22
693 0.24
694 0.24
695 0.22
696 0.24
697 0.32
698 0.31
699 0.3
700 0.27
701 0.25
702 0.27
703 0.26
704 0.25
705 0.18
706 0.16
707 0.14
708 0.15
709 0.15
710 0.15
711 0.14
712 0.13
713 0.14
714 0.14
715 0.12
716 0.1
717 0.09
718 0.08
719 0.08
720 0.07
721 0.06
722 0.05
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.16
732 0.23
733 0.23
734 0.24
735 0.24
736 0.24
737 0.26
738 0.26
739 0.24
740 0.18
741 0.18
742 0.18
743 0.18
744 0.14
745 0.12
746 0.13
747 0.1
748 0.1
749 0.08
750 0.07
751 0.07
752 0.09
753 0.09
754 0.08
755 0.09
756 0.12
757 0.13
758 0.15
759 0.2
760 0.21
761 0.22
762 0.23
763 0.22
764 0.19
765 0.18
766 0.16
767 0.09
768 0.08
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.1
773 0.12
774 0.15
775 0.2
776 0.26
777 0.27
778 0.32
779 0.36
780 0.38
781 0.39
782 0.42
783 0.39
784 0.36
785 0.32
786 0.28
787 0.24
788 0.24
789 0.24
790 0.18
791 0.15
792 0.12
793 0.11
794 0.12
795 0.13
796 0.13
797 0.17
798 0.18
799 0.18
800 0.2
801 0.21
802 0.22
803 0.22
804 0.23
805 0.21
806 0.2
807 0.2
808 0.18
809 0.18
810 0.15
811 0.14
812 0.11
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.11
817 0.1
818 0.11
819 0.14
820 0.16
821 0.18
822 0.22
823 0.23
824 0.19
825 0.2
826 0.21
827 0.2
828 0.2
829 0.19
830 0.14
831 0.13
832 0.14
833 0.13
834 0.1
835 0.08
836 0.05
837 0.05
838 0.04
839 0.04
840 0.04
841 0.04
842 0.04
843 0.05
844 0.05
845 0.05
846 0.08
847 0.08
848 0.09
849 0.12
850 0.14
851 0.23
852 0.29
853 0.34
854 0.34
855 0.36
856 0.4
857 0.4
858 0.4
859 0.32
860 0.31
861 0.29
862 0.28
863 0.26
864 0.22
865 0.17
866 0.15
867 0.14
868 0.08
869 0.06
870 0.06
871 0.07
872 0.07
873 0.08
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.13
883 0.14
884 0.17
885 0.21
886 0.21
887 0.22
888 0.23
889 0.24
890 0.24
891 0.22
892 0.2
893 0.14
894 0.13
895 0.1
896 0.08
897 0.07
898 0.07
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.06
904 0.12
905 0.16
906 0.19
907 0.2
908 0.24
909 0.29
910 0.32
911 0.35
912 0.37
913 0.38