Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HIT8

Protein Details
Accession A0A1A0HIT8    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-383NGVSTQSSDKDRKRQERKERKKKKDRKDKNKPKKDARFKPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-382DRKRQERKERKKKKDRKDKNKPKKDARFKP
Subcellular Location(s) extr 9, cyto 8, cyto_nucl 6.333, cyto_mito 6.333, nucl 3.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTAVLKQSWLPFLDSWALALQHFPLISNGSFVTSSSSGALALCALDGPTQPLQINKTAHEACVNAIDKIDQYTLASASADGIKVWDLRQSLNRPQLSLTNSRKLTFLSLGSNAGHWLAGGTELVGTDAELHLWDLKSPAHAVRLFVDSHHDDITAVTFHGSLPYLMSGSTDGYVNVYNLGEPDEDEALHQVINFASVHLCHFVQPNRISVLSHMETLAFWELNNTNYEAAEEPRPRVLGDVRAVWPDCEYVVDIHDAGYVSYGANLKLSLTLVPFDAKSEGFDASGSISLLPAHGEDVVRDVMFIPGTRGVLTCGEDGLVKAWELPSEVPSGLHAVGDALADNGVSTQSSDKDRKRQERKERKKKKDRKDKNKPKKDARFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.22
4 0.21
5 0.17
6 0.18
7 0.15
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.14
13 0.14
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.18
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.07
34 0.11
35 0.12
36 0.14
37 0.15
38 0.17
39 0.2
40 0.26
41 0.27
42 0.25
43 0.32
44 0.31
45 0.31
46 0.3
47 0.28
48 0.22
49 0.28
50 0.28
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.17
55 0.19
56 0.18
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.23
76 0.28
77 0.35
78 0.43
79 0.43
80 0.4
81 0.41
82 0.43
83 0.41
84 0.44
85 0.42
86 0.42
87 0.43
88 0.43
89 0.42
90 0.38
91 0.36
92 0.29
93 0.24
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.16
100 0.13
101 0.11
102 0.08
103 0.06
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.2
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.14
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.18
197 0.22
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.07
206 0.06
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.23
230 0.23
231 0.21
232 0.2
233 0.15
234 0.13
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.08
335 0.11
336 0.19
337 0.28
338 0.35
339 0.45
340 0.55
341 0.65
342 0.74
343 0.82
344 0.86
345 0.89
346 0.94
347 0.95
348 0.96
349 0.96
350 0.97
351 0.96
352 0.96
353 0.96
354 0.96
355 0.96
356 0.97
357 0.97
358 0.97
359 0.97
360 0.97
361 0.97
362 0.96
363 0.96