Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HJR2

Protein Details
Accession A0A1A0HJR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKRRVKKRTHQGPNPEEVAKBasic
353-378NVDAKQAKKDAKKARKLARKNGESATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-372KALEKKHQIKFKEKAERRAVQKANVDAKQAKKDAKKARKLARK
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 14, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRVKKRTHQGPNPEEVAKIPKSMVLALGASLKNRSLAQLVKDFRLVMEPHTAIKLRERKANKLKDFVVMSGPLSVSDLFVFKQSQTSGNVSLRVAKMPKGPSLQFKVNSYSLMKDVRRILKHPKSAGRASAAFKQPPLLVMNGFSRKVREMENHEKLMITIFQNLFPPIQPQKTRVGSIQRVLLINKMENGEIEMRHYAISTKLVEESRNIKKLINSHHNKTKSLPNLTKHTDISDLVLDPYAVGGLTSDSEVEDDAVVEIQNTQEHSLKKKAVEEPPASATRKRAIKLQELGPRINMSLVKIEEAILGSSKTIYHANIHKLKEEEKALEKKHQIKFKEKAERRAVQKANVDAKQAKKDAKKARKLARKNGESATQDSGDEDNSGDSDNEPQINPSDYDNDSDLFSDVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.8
3 0.7
4 0.59
5 0.51
6 0.48
7 0.39
8 0.33
9 0.25
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.21
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.21
27 0.25
28 0.32
29 0.35
30 0.35
31 0.37
32 0.35
33 0.31
34 0.32
35 0.28
36 0.22
37 0.26
38 0.24
39 0.24
40 0.28
41 0.29
42 0.24
43 0.33
44 0.39
45 0.36
46 0.44
47 0.47
48 0.54
49 0.64
50 0.73
51 0.7
52 0.68
53 0.66
54 0.64
55 0.61
56 0.52
57 0.45
58 0.35
59 0.3
60 0.24
61 0.22
62 0.15
63 0.15
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.14
73 0.14
74 0.17
75 0.19
76 0.22
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.26
81 0.3
82 0.28
83 0.29
84 0.27
85 0.24
86 0.28
87 0.29
88 0.34
89 0.34
90 0.36
91 0.39
92 0.44
93 0.48
94 0.44
95 0.44
96 0.44
97 0.39
98 0.4
99 0.33
100 0.29
101 0.25
102 0.29
103 0.27
104 0.27
105 0.33
106 0.38
107 0.4
108 0.42
109 0.49
110 0.51
111 0.58
112 0.6
113 0.61
114 0.59
115 0.59
116 0.58
117 0.52
118 0.47
119 0.43
120 0.43
121 0.41
122 0.35
123 0.32
124 0.32
125 0.27
126 0.25
127 0.24
128 0.17
129 0.12
130 0.14
131 0.19
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.22
140 0.28
141 0.38
142 0.43
143 0.43
144 0.41
145 0.4
146 0.37
147 0.32
148 0.25
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.17
158 0.16
159 0.21
160 0.22
161 0.24
162 0.31
163 0.33
164 0.34
165 0.33
166 0.37
167 0.35
168 0.35
169 0.35
170 0.29
171 0.28
172 0.27
173 0.25
174 0.19
175 0.16
176 0.16
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.14
197 0.2
198 0.23
199 0.26
200 0.26
201 0.25
202 0.26
203 0.31
204 0.37
205 0.41
206 0.41
207 0.43
208 0.51
209 0.53
210 0.52
211 0.5
212 0.49
213 0.45
214 0.48
215 0.47
216 0.44
217 0.48
218 0.51
219 0.51
220 0.43
221 0.38
222 0.31
223 0.26
224 0.23
225 0.17
226 0.14
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.12
256 0.14
257 0.18
258 0.24
259 0.26
260 0.27
261 0.33
262 0.38
263 0.4
264 0.47
265 0.45
266 0.43
267 0.45
268 0.48
269 0.44
270 0.39
271 0.36
272 0.34
273 0.37
274 0.35
275 0.36
276 0.36
277 0.42
278 0.46
279 0.5
280 0.51
281 0.49
282 0.49
283 0.45
284 0.41
285 0.32
286 0.29
287 0.22
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.15
306 0.21
307 0.3
308 0.36
309 0.38
310 0.4
311 0.41
312 0.42
313 0.42
314 0.4
315 0.36
316 0.37
317 0.44
318 0.43
319 0.49
320 0.54
321 0.58
322 0.61
323 0.64
324 0.61
325 0.63
326 0.68
327 0.7
328 0.74
329 0.72
330 0.75
331 0.77
332 0.79
333 0.76
334 0.78
335 0.72
336 0.68
337 0.67
338 0.65
339 0.64
340 0.58
341 0.58
342 0.54
343 0.56
344 0.56
345 0.56
346 0.55
347 0.54
348 0.61
349 0.66
350 0.71
351 0.75
352 0.77
353 0.82
354 0.85
355 0.88
356 0.89
357 0.89
358 0.85
359 0.8
360 0.75
361 0.73
362 0.66
363 0.6
364 0.54
365 0.44
366 0.38
367 0.34
368 0.3
369 0.22
370 0.19
371 0.16
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.13
378 0.16
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.2
383 0.23
384 0.24
385 0.22
386 0.24
387 0.23
388 0.26
389 0.26
390 0.24
391 0.22
392 0.21