Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HHJ5

Protein Details
Accession A0A1A0HHJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1053-1077FTGQYLKKNDPKKPGKFLNFQKISAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR003395  RecF/RecN/SMC_N  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF02463  SMC_N  
Amino Acid Sequences MTTNLHAKRRKINPGLAQESNEDAYSKFKPGNLISLRIWNFTTYSYGEFHLSPSLNMIIGPNGTGKSTFVAAVCLGLGGKVDLIKRKSTDMMIKSGEKEATIEIAIKNFPGERVIVIERKIILKQIKSLWKINGTLVDIVRVREIVNKFNVQLDNLCHFLPQERVVEFASLSPEKLLLETERTVGDTTLLKKHKQLIELDERWVDLTKDVLVSEEKLEMLRGDVEKFEVEAQKYQEFEEKNNQINCHKKLLPYAKLQDMKDKLQNLRIEREAAKKALQDFAGKVKPLATLMSTVNEQLAHATENHNKINTKLKEIKAEFDLQARKAENMALNFSASQNDIESLKSRTELQKKELEKSVHEKEDICRKLQSMEPLDLSQLQEFTVKRQTKHEEKSLIVEELDTVHLSLSRLKREAHSSELIYRDDRKKLESNDRLEILKQRSSRYRRELMDNAYEAHSLLRKEKTPDLKYFEAPVVCCKVTDRRYAKYFEKVIDNNSLFAFFFDHEMNYQKASKLLPRNLNVPMRVVSGSLPQQPMSLSELKRLGFDGYLSEFFTGPDAVLKGLNQRSFLHCIPVSLNPIGPDVMETLLKPAKNGKTLFRRFIVGDDLFVINQSKYGSRQIFYLTEVIANAQIMGEEGLSEDVRREIQERLVRQRDELKDMQEKIMSLETEKSKFQDQILKVDEEMSQLDLEVRSLRKKQEAKLRLEANISHLEGRIRHLTTSTTQDHSEQIRTKEAKLLELYVNYSAATEKVVNINKEMVSQTINFKRAELVKQQLENKELNLTSLLKEVEQRQVDLREIYRSAKAKCDEYKKGEAAEEVRRQVLTPEEREIVKNLVQKYMDEDNLNEQFVVRKIEQLEDDLTVLADVDRGSLDLLKLKRADLDAAEKRLPELAAQRDRIKNQVDEISVPWEKELSSIVDKISRAFQKRFVTVASDGQVELKKLERFRDWKLEILVKFRENAELKVLDNQSQSGGERAVSTIFFIMSLQGLTSAPIRIVDEINQGMDPKNEKMAHKYLVDTACKNGQSQYFLVTPKLLTGLYYHPDMTVHCIFTGQYLKKNDPKKPGKFLNFQKISAATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.73
4 0.66
5 0.58
6 0.53
7 0.45
8 0.36
9 0.27
10 0.19
11 0.21
12 0.21
13 0.22
14 0.21
15 0.22
16 0.28
17 0.29
18 0.39
19 0.38
20 0.41
21 0.4
22 0.47
23 0.47
24 0.43
25 0.42
26 0.33
27 0.3
28 0.26
29 0.27
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.22
39 0.19
40 0.2
41 0.2
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.09
68 0.12
69 0.19
70 0.23
71 0.28
72 0.29
73 0.33
74 0.35
75 0.39
76 0.44
77 0.4
78 0.44
79 0.44
80 0.46
81 0.44
82 0.45
83 0.4
84 0.31
85 0.28
86 0.23
87 0.2
88 0.17
89 0.17
90 0.14
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.16
101 0.2
102 0.22
103 0.23
104 0.25
105 0.26
106 0.27
107 0.28
108 0.3
109 0.31
110 0.3
111 0.34
112 0.4
113 0.47
114 0.5
115 0.54
116 0.53
117 0.52
118 0.51
119 0.48
120 0.45
121 0.38
122 0.37
123 0.32
124 0.31
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.2
129 0.18
130 0.21
131 0.23
132 0.24
133 0.28
134 0.3
135 0.3
136 0.35
137 0.36
138 0.3
139 0.31
140 0.3
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.2
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.21
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.18
156 0.2
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.11
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.18
175 0.25
176 0.28
177 0.29
178 0.32
179 0.4
180 0.42
181 0.43
182 0.44
183 0.44
184 0.5
185 0.51
186 0.5
187 0.43
188 0.39
189 0.35
190 0.32
191 0.24
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.2
218 0.23
219 0.24
220 0.25
221 0.25
222 0.28
223 0.25
224 0.27
225 0.33
226 0.35
227 0.4
228 0.43
229 0.44
230 0.46
231 0.53
232 0.52
233 0.5
234 0.47
235 0.42
236 0.48
237 0.54
238 0.53
239 0.52
240 0.54
241 0.55
242 0.59
243 0.58
244 0.57
245 0.53
246 0.52
247 0.49
248 0.5
249 0.44
250 0.45
251 0.49
252 0.44
253 0.45
254 0.42
255 0.41
256 0.39
257 0.42
258 0.39
259 0.36
260 0.35
261 0.32
262 0.32
263 0.32
264 0.29
265 0.25
266 0.23
267 0.28
268 0.3
269 0.27
270 0.26
271 0.23
272 0.22
273 0.2
274 0.2
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.12
289 0.17
290 0.22
291 0.24
292 0.26
293 0.26
294 0.27
295 0.37
296 0.34
297 0.37
298 0.41
299 0.42
300 0.48
301 0.49
302 0.5
303 0.43
304 0.45
305 0.38
306 0.36
307 0.37
308 0.29
309 0.32
310 0.29
311 0.26
312 0.23
313 0.25
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.15
333 0.22
334 0.31
335 0.34
336 0.37
337 0.43
338 0.45
339 0.49
340 0.52
341 0.46
342 0.41
343 0.45
344 0.47
345 0.42
346 0.4
347 0.37
348 0.35
349 0.43
350 0.41
351 0.36
352 0.3
353 0.28
354 0.29
355 0.3
356 0.33
357 0.27
358 0.27
359 0.27
360 0.26
361 0.26
362 0.25
363 0.23
364 0.16
365 0.12
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.22
371 0.25
372 0.25
373 0.32
374 0.39
375 0.45
376 0.51
377 0.55
378 0.5
379 0.47
380 0.51
381 0.46
382 0.39
383 0.3
384 0.24
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.08
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.12
394 0.15
395 0.17
396 0.19
397 0.2
398 0.23
399 0.28
400 0.3
401 0.29
402 0.29
403 0.27
404 0.29
405 0.31
406 0.29
407 0.25
408 0.29
409 0.28
410 0.3
411 0.29
412 0.3
413 0.33
414 0.38
415 0.47
416 0.48
417 0.49
418 0.48
419 0.49
420 0.45
421 0.41
422 0.41
423 0.35
424 0.32
425 0.3
426 0.3
427 0.38
428 0.43
429 0.49
430 0.5
431 0.53
432 0.51
433 0.56
434 0.56
435 0.52
436 0.51
437 0.43
438 0.37
439 0.31
440 0.28
441 0.21
442 0.17
443 0.15
444 0.11
445 0.14
446 0.15
447 0.17
448 0.2
449 0.26
450 0.34
451 0.37
452 0.41
453 0.44
454 0.44
455 0.42
456 0.41
457 0.37
458 0.29
459 0.25
460 0.23
461 0.2
462 0.17
463 0.16
464 0.16
465 0.21
466 0.23
467 0.33
468 0.34
469 0.36
470 0.39
471 0.44
472 0.46
473 0.45
474 0.44
475 0.37
476 0.39
477 0.34
478 0.34
479 0.36
480 0.33
481 0.27
482 0.25
483 0.23
484 0.17
485 0.16
486 0.14
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.1
497 0.12
498 0.12
499 0.18
500 0.23
501 0.29
502 0.33
503 0.34
504 0.37
505 0.41
506 0.43
507 0.37
508 0.32
509 0.26
510 0.21
511 0.2
512 0.17
513 0.12
514 0.12
515 0.14
516 0.15
517 0.15
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.14
522 0.15
523 0.18
524 0.15
525 0.17
526 0.2
527 0.2
528 0.2
529 0.19
530 0.16
531 0.11
532 0.11
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.09
541 0.07
542 0.05
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.1
549 0.14
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.19
554 0.24
555 0.24
556 0.23
557 0.2
558 0.2
559 0.2
560 0.21
561 0.21
562 0.16
563 0.17
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.11
568 0.09
569 0.06
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.16
578 0.18
579 0.23
580 0.25
581 0.29
582 0.38
583 0.42
584 0.46
585 0.41
586 0.4
587 0.35
588 0.35
589 0.33
590 0.22
591 0.18
592 0.16
593 0.15
594 0.13
595 0.13
596 0.13
597 0.07
598 0.08
599 0.08
600 0.07
601 0.09
602 0.16
603 0.17
604 0.16
605 0.17
606 0.19
607 0.19
608 0.2
609 0.19
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.1
614 0.08
615 0.07
616 0.06
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.08
632 0.08
633 0.15
634 0.2
635 0.23
636 0.32
637 0.38
638 0.38
639 0.38
640 0.45
641 0.41
642 0.43
643 0.41
644 0.37
645 0.36
646 0.37
647 0.37
648 0.3
649 0.27
650 0.22
651 0.23
652 0.18
653 0.12
654 0.16
655 0.18
656 0.19
657 0.19
658 0.19
659 0.19
660 0.21
661 0.22
662 0.26
663 0.24
664 0.29
665 0.32
666 0.31
667 0.28
668 0.28
669 0.26
670 0.19
671 0.18
672 0.12
673 0.08
674 0.08
675 0.09
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.1
680 0.14
681 0.17
682 0.2
683 0.27
684 0.32
685 0.38
686 0.46
687 0.53
688 0.55
689 0.6
690 0.6
691 0.54
692 0.51
693 0.45
694 0.39
695 0.34
696 0.28
697 0.21
698 0.19
699 0.18
700 0.17
701 0.2
702 0.2
703 0.18
704 0.17
705 0.17
706 0.19
707 0.2
708 0.26
709 0.25
710 0.22
711 0.23
712 0.24
713 0.26
714 0.27
715 0.3
716 0.28
717 0.27
718 0.33
719 0.34
720 0.33
721 0.35
722 0.33
723 0.31
724 0.27
725 0.28
726 0.22
727 0.21
728 0.22
729 0.17
730 0.17
731 0.13
732 0.12
733 0.09
734 0.08
735 0.08
736 0.07
737 0.08
738 0.14
739 0.18
740 0.18
741 0.19
742 0.22
743 0.2
744 0.22
745 0.21
746 0.16
747 0.14
748 0.15
749 0.21
750 0.24
751 0.28
752 0.26
753 0.25
754 0.28
755 0.3
756 0.33
757 0.32
758 0.33
759 0.35
760 0.4
761 0.45
762 0.44
763 0.44
764 0.41
765 0.35
766 0.33
767 0.28
768 0.23
769 0.2
770 0.18
771 0.15
772 0.17
773 0.17
774 0.13
775 0.16
776 0.18
777 0.23
778 0.23
779 0.23
780 0.24
781 0.26
782 0.27
783 0.27
784 0.26
785 0.22
786 0.23
787 0.24
788 0.26
789 0.29
790 0.29
791 0.33
792 0.34
793 0.37
794 0.43
795 0.49
796 0.51
797 0.53
798 0.59
799 0.54
800 0.53
801 0.47
802 0.42
803 0.38
804 0.39
805 0.38
806 0.32
807 0.31
808 0.3
809 0.29
810 0.28
811 0.31
812 0.28
813 0.25
814 0.27
815 0.29
816 0.3
817 0.31
818 0.31
819 0.27
820 0.26
821 0.28
822 0.25
823 0.28
824 0.27
825 0.26
826 0.29
827 0.31
828 0.29
829 0.25
830 0.25
831 0.27
832 0.28
833 0.28
834 0.22
835 0.18
836 0.18
837 0.19
838 0.23
839 0.16
840 0.18
841 0.19
842 0.22
843 0.23
844 0.23
845 0.23
846 0.18
847 0.19
848 0.15
849 0.13
850 0.1
851 0.09
852 0.07
853 0.06
854 0.05
855 0.05
856 0.05
857 0.05
858 0.06
859 0.07
860 0.07
861 0.13
862 0.14
863 0.18
864 0.19
865 0.19
866 0.21
867 0.22
868 0.23
869 0.2
870 0.29
871 0.3
872 0.34
873 0.35
874 0.33
875 0.32
876 0.32
877 0.29
878 0.22
879 0.23
880 0.28
881 0.33
882 0.38
883 0.45
884 0.48
885 0.5
886 0.54
887 0.51
888 0.44
889 0.41
890 0.42
891 0.36
892 0.32
893 0.32
894 0.33
895 0.3
896 0.28
897 0.24
898 0.19
899 0.17
900 0.16
901 0.17
902 0.14
903 0.16
904 0.17
905 0.18
906 0.22
907 0.22
908 0.23
909 0.29
910 0.31
911 0.34
912 0.36
913 0.43
914 0.45
915 0.48
916 0.48
917 0.42
918 0.39
919 0.35
920 0.37
921 0.31
922 0.25
923 0.23
924 0.25
925 0.25
926 0.21
927 0.2
928 0.21
929 0.24
930 0.26
931 0.31
932 0.36
933 0.4
934 0.46
935 0.55
936 0.52
937 0.53
938 0.55
939 0.57
940 0.51
941 0.52
942 0.5
943 0.41
944 0.41
945 0.36
946 0.39
947 0.34
948 0.33
949 0.32
950 0.29
951 0.28
952 0.34
953 0.35
954 0.31
955 0.3
956 0.28
957 0.24
958 0.24
959 0.24
960 0.18
961 0.17
962 0.14
963 0.13
964 0.13
965 0.13
966 0.12
967 0.12
968 0.1
969 0.1
970 0.09
971 0.08
972 0.08
973 0.08
974 0.08
975 0.07
976 0.07
977 0.07
978 0.08
979 0.1
980 0.09
981 0.09
982 0.1
983 0.12
984 0.13
985 0.14
986 0.16
987 0.2
988 0.2
989 0.21
990 0.2
991 0.2
992 0.2
993 0.22
994 0.23
995 0.2
996 0.27
997 0.3
998 0.32
999 0.38
1000 0.43
1001 0.44
1002 0.43
1003 0.43
1004 0.42
1005 0.45
1006 0.47
1007 0.42
1008 0.4
1009 0.41
1010 0.4
1011 0.39
1012 0.37
1013 0.34
1014 0.33
1015 0.32
1016 0.32
1017 0.3
1018 0.3
1019 0.31
1020 0.28
1021 0.24
1022 0.21
1023 0.22
1024 0.17
1025 0.14
1026 0.15
1027 0.19
1028 0.2
1029 0.22
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.21
1033 0.21
1034 0.25
1035 0.24
1036 0.22
1037 0.2
1038 0.2
1039 0.2
1040 0.24
1041 0.32
1042 0.29
1043 0.32
1044 0.37
1045 0.45
1046 0.52
1047 0.61
1048 0.64
1049 0.66
1050 0.73
1051 0.74
1052 0.79
1053 0.82
1054 0.83
1055 0.84
1056 0.86
1057 0.87
1058 0.81
1059 0.73
1060 0.68