Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HHP6

Protein Details
Accession A0A1A0HHP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-43EEKTVKPKTRSKVAKPSINRKKIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-41PKTRSKVAKPSINRKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015637  MUG/TDG  
IPR005122  Uracil-DNA_glycosylase-like  
IPR036895  Uracil-DNA_glycosylase-like_sf  
Gene Ontology GO:0000700  F:mismatch base pair DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03167  UDG  
CDD cd10028  UDG-F2_TDG_MUG  
Amino Acid Sequences MSNFKLRDVIHSYKYALNDEEKTVKPKTRSKVAKPSINRKKIDSKITDRYTKQDHDLKDLPPSVKPGLTLVFVGFNPGVESSKKQHHYAHPTNLFWKLFNALDILSVVLDIRNVSVLAHGKLISEIYCDGKSQARAEHDFKLLDLGIGFTDLVLRCTKQASELSLHEKAENVPRLLKEFEISQAPFIVFIGKGIWEVVCKYLVPKHRLNAHNFSWGLQKDLLVMLRFNTFCLHRPEVYVFPNTSGLVALMKYPQKLDLWQNLVADMRKIPDSENG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.34
4 0.32
5 0.31
6 0.32
7 0.36
8 0.35
9 0.37
10 0.39
11 0.43
12 0.46
13 0.51
14 0.55
15 0.59
16 0.66
17 0.71
18 0.77
19 0.79
20 0.82
21 0.83
22 0.86
23 0.86
24 0.86
25 0.78
26 0.74
27 0.75
28 0.72
29 0.73
30 0.7
31 0.67
32 0.69
33 0.73
34 0.75
35 0.66
36 0.65
37 0.63
38 0.57
39 0.56
40 0.52
41 0.47
42 0.47
43 0.49
44 0.44
45 0.44
46 0.45
47 0.4
48 0.34
49 0.37
50 0.31
51 0.27
52 0.26
53 0.21
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.14
68 0.15
69 0.24
70 0.27
71 0.3
72 0.35
73 0.42
74 0.51
75 0.56
76 0.62
77 0.58
78 0.56
79 0.56
80 0.54
81 0.47
82 0.37
83 0.3
84 0.23
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.06
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.16
130 0.12
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.03
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.15
149 0.18
150 0.23
151 0.24
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.24
157 0.25
158 0.21
159 0.21
160 0.21
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.17
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.15
189 0.23
190 0.28
191 0.32
192 0.37
193 0.45
194 0.51
195 0.56
196 0.58
197 0.53
198 0.55
199 0.51
200 0.46
201 0.44
202 0.38
203 0.34
204 0.28
205 0.25
206 0.18
207 0.2
208 0.21
209 0.15
210 0.15
211 0.13
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.21
218 0.28
219 0.31
220 0.27
221 0.31
222 0.35
223 0.37
224 0.38
225 0.38
226 0.31
227 0.29
228 0.3
229 0.27
230 0.22
231 0.18
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.14
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.2
241 0.21
242 0.26
243 0.32
244 0.35
245 0.37
246 0.39
247 0.39
248 0.38
249 0.4
250 0.36
251 0.3
252 0.23
253 0.21
254 0.2
255 0.2