Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HDG1

Protein Details
Accession A0A1A0HDG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-437SASPAARRKRQRAQRTPRQRHTDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-382KKRVPAKAPGSAAKPRARPVR
420-428RRKRQRAQR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041083  AAA_lid_10  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR043151  BAH_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17872  AAA_lid_10  
CDD cd00009  AAA  
cd18139  HLD_clamp_RarA  
Amino Acid Sequences MAKRLKDMGDWRLVSDEPAERVSNPGTPTRRTRRGTAETPGATLRLVRESDGTSLSRGDCILVSGEPKKVPIDGDSYYAVVVDVSSSINTYVEVVVAPLVRPLEGGEEDESGEEGDGEGVIGKGGIEKEGNEKGEDEMGEDENGEDENGEDKEDGDEKVKRTQESTTLVEQGARHTEAQNTGDRGGNGTANATAAGKEYIAGKDKISGPQHIARSGPAAGSGATGNPGTGVGIDTPNIDTPGIDTPGIDTPGDNTPGAATLVSALPQLAASELLVAAEVGAVRLHDIVEKVQVLSAAQFGDMAPEAAEQNSVFMCRRATDRHVERVSAAFDFGAWRGLLARSPADAVQFLAEKTLVIVSPSKKRVPAKAPGSAAKPRARPVRRLYVVSSSDSDSLSSGSASSGSEDSGAELDGSASPAARRKRQRAQRTPRQRHTDAVQRVASVLLPHRRGFKVKAGTAPSSLPSLPSLGGQPGPGAQHDGADGAGRAFRELREKLHTLTRLALLPCREDQFAYVYTALEAAVQAEQGMCLYLSGQPGVGKTATVRETIGALHDSARQGYVREFDYCELNCLALLSPGAAYERLYEQVSGIKVTPANARLLLQEHFAQASADSTRRPLVVLVDELDQLVARGQDVLYNLFNWPTFAHSRLVVVAVANTMDLPERALSNKTASRLGLHRYAFKGYSEAELGVIIAHRLALLSEANKRTVAISPDAMRFACKKVALVSGDARRALAICRRAVEIAELDYLAATDTAHVPAAQQAYSVRISHIGRAIAETVNSPVAQVLASLPFAAKVFLATVLLCMRRSGRGDVPLGDVMDDMRHALALLTTSGSTHALRALAEDASYVSLFYGDGHGGAPHVRLRHVAHIVSDLADQGIIEQQNVASERLRAISLKVSESEIVPVISRDLDIAAML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.29
4 0.22
5 0.25
6 0.25
7 0.22
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.26
12 0.32
13 0.33
14 0.38
15 0.48
16 0.55
17 0.63
18 0.63
19 0.67
20 0.69
21 0.72
22 0.72
23 0.7
24 0.69
25 0.6
26 0.59
27 0.53
28 0.43
29 0.34
30 0.3
31 0.24
32 0.2
33 0.2
34 0.18
35 0.2
36 0.21
37 0.23
38 0.25
39 0.24
40 0.2
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.16
51 0.18
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.23
60 0.21
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.21
65 0.19
66 0.16
67 0.11
68 0.09
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.11
99 0.1
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.15
116 0.21
117 0.22
118 0.2
119 0.21
120 0.21
121 0.23
122 0.22
123 0.18
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.06
133 0.05
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.16
143 0.2
144 0.22
145 0.3
146 0.33
147 0.32
148 0.32
149 0.34
150 0.36
151 0.37
152 0.39
153 0.35
154 0.34
155 0.33
156 0.33
157 0.31
158 0.27
159 0.25
160 0.23
161 0.21
162 0.19
163 0.22
164 0.23
165 0.26
166 0.28
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.12
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.2
191 0.23
192 0.29
193 0.3
194 0.3
195 0.31
196 0.36
197 0.39
198 0.35
199 0.33
200 0.27
201 0.27
202 0.25
203 0.2
204 0.14
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.11
237 0.12
238 0.15
239 0.17
240 0.15
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.1
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.13
304 0.16
305 0.2
306 0.29
307 0.33
308 0.41
309 0.42
310 0.41
311 0.39
312 0.37
313 0.34
314 0.25
315 0.2
316 0.11
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.1
345 0.12
346 0.19
347 0.24
348 0.25
349 0.3
350 0.33
351 0.39
352 0.42
353 0.48
354 0.46
355 0.49
356 0.5
357 0.48
358 0.5
359 0.47
360 0.47
361 0.43
362 0.4
363 0.4
364 0.47
365 0.47
366 0.49
367 0.51
368 0.55
369 0.53
370 0.53
371 0.5
372 0.47
373 0.46
374 0.4
375 0.35
376 0.26
377 0.24
378 0.22
379 0.19
380 0.12
381 0.1
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.1
405 0.14
406 0.21
407 0.28
408 0.35
409 0.45
410 0.55
411 0.66
412 0.71
413 0.79
414 0.82
415 0.87
416 0.9
417 0.89
418 0.87
419 0.78
420 0.7
421 0.63
422 0.62
423 0.54
424 0.49
425 0.4
426 0.32
427 0.3
428 0.27
429 0.23
430 0.15
431 0.15
432 0.15
433 0.17
434 0.18
435 0.22
436 0.23
437 0.25
438 0.27
439 0.3
440 0.31
441 0.31
442 0.35
443 0.34
444 0.34
445 0.33
446 0.31
447 0.25
448 0.2
449 0.18
450 0.13
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.12
478 0.13
479 0.16
480 0.2
481 0.22
482 0.23
483 0.28
484 0.29
485 0.24
486 0.25
487 0.24
488 0.22
489 0.21
490 0.22
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.18
495 0.16
496 0.13
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.12
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.06
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.09
526 0.08
527 0.06
528 0.06
529 0.11
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.12
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.16
556 0.14
557 0.12
558 0.12
559 0.11
560 0.07
561 0.07
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.13
581 0.16
582 0.14
583 0.15
584 0.15
585 0.15
586 0.15
587 0.16
588 0.15
589 0.14
590 0.14
591 0.13
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.12
607 0.13
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.12
612 0.12
613 0.09
614 0.07
615 0.07
616 0.05
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.07
621 0.08
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.1
630 0.12
631 0.13
632 0.15
633 0.16
634 0.15
635 0.16
636 0.16
637 0.16
638 0.12
639 0.1
640 0.09
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.07
651 0.08
652 0.1
653 0.12
654 0.16
655 0.19
656 0.2
657 0.22
658 0.21
659 0.23
660 0.25
661 0.28
662 0.3
663 0.29
664 0.31
665 0.31
666 0.34
667 0.32
668 0.29
669 0.26
670 0.2
671 0.21
672 0.17
673 0.15
674 0.12
675 0.11
676 0.11
677 0.09
678 0.08
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.05
686 0.06
687 0.09
688 0.16
689 0.18
690 0.19
691 0.19
692 0.2
693 0.2
694 0.22
695 0.23
696 0.19
697 0.21
698 0.23
699 0.25
700 0.27
701 0.25
702 0.24
703 0.23
704 0.22
705 0.23
706 0.2
707 0.19
708 0.2
709 0.26
710 0.25
711 0.26
712 0.3
713 0.31
714 0.34
715 0.33
716 0.3
717 0.25
718 0.24
719 0.24
720 0.24
721 0.24
722 0.23
723 0.24
724 0.26
725 0.26
726 0.26
727 0.25
728 0.2
729 0.17
730 0.15
731 0.13
732 0.12
733 0.11
734 0.1
735 0.08
736 0.07
737 0.04
738 0.05
739 0.06
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.11
745 0.13
746 0.12
747 0.11
748 0.11
749 0.14
750 0.17
751 0.17
752 0.14
753 0.18
754 0.19
755 0.22
756 0.25
757 0.23
758 0.21
759 0.22
760 0.24
761 0.19
762 0.18
763 0.16
764 0.14
765 0.14
766 0.13
767 0.12
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.08
785 0.07
786 0.09
787 0.13
788 0.15
789 0.15
790 0.15
791 0.17
792 0.21
793 0.24
794 0.28
795 0.29
796 0.33
797 0.36
798 0.36
799 0.39
800 0.36
801 0.33
802 0.28
803 0.22
804 0.16
805 0.14
806 0.13
807 0.09
808 0.07
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.09
819 0.11
820 0.11
821 0.11
822 0.12
823 0.12
824 0.12
825 0.13
826 0.14
827 0.12
828 0.12
829 0.11
830 0.1
831 0.11
832 0.11
833 0.09
834 0.07
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.09
839 0.07
840 0.08
841 0.08
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.12
846 0.13
847 0.15
848 0.16
849 0.2
850 0.23
851 0.31
852 0.35
853 0.34
854 0.32
855 0.33
856 0.32
857 0.29
858 0.26
859 0.18
860 0.13
861 0.12
862 0.1
863 0.08
864 0.12
865 0.11
866 0.11
867 0.11
868 0.11
869 0.15
870 0.17
871 0.18
872 0.15
873 0.16
874 0.17
875 0.19
876 0.2
877 0.17
878 0.18
879 0.24
880 0.25
881 0.26
882 0.26
883 0.27
884 0.27
885 0.27
886 0.27
887 0.21
888 0.19
889 0.16
890 0.16
891 0.14
892 0.14
893 0.13
894 0.11
895 0.1