Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HFA9

Protein Details
Accession A0A1A0HFA9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-343LPVPKEQKLKKRGGRRFRKMKERFQMSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-338PKEQKLKKRGGRRFRKMKER
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 9.5, mito 5, nucl 4, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
IPR012976  NOSIC  
IPR027105  Prp31  
IPR019175  Prp31_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PF09785  Prp31_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MDALSALGALDTSGALGLSQVQALIPVIRADLEKYADLMETEYMDLVASIHQQDQSAEYRFLVQLSDLPVLVHDEMLALRRFVALRYQVVFPELELLVASPVDYCRVVLEIGQDLAGVRAHEPRLRQIVAADKVLTIVMAALQQFPQAFQLSPGDFAPIAAACHACLELSGFLQEISQFVAGKLGKYAPNVAQVVGPVATAQLLVSTGSLAQLAQTPACNLAALGVRELLSQHKARLAPWVRAPGYLYQSPLVAGLPPEIVRQALRVISAKVVLAARIDLSRSSPDGGMGRAYRDEIRRKIDQLLAPPELTAARALPVPKEQKLKKRGGRRFRKMKERFQMSDLRKAQNKMLFGTQEQTVMDGFGDEVGLGMSRQMDGVLVNRNTDARMSKAMVARLQQQKQRETLDTIVLAPVAEKRARAPDVPGKWGTMKRQRLDGEDRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.17
42 0.21
43 0.22
44 0.21
45 0.2
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.18
50 0.14
51 0.13
52 0.16
53 0.17
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.15
59 0.12
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.12
64 0.13
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.18
71 0.18
72 0.21
73 0.24
74 0.25
75 0.24
76 0.25
77 0.24
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.05
88 0.05
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.11
107 0.13
108 0.15
109 0.17
110 0.21
111 0.26
112 0.27
113 0.26
114 0.24
115 0.31
116 0.31
117 0.31
118 0.26
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.08
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.13
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.13
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.16
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.24
224 0.25
225 0.25
226 0.27
227 0.34
228 0.3
229 0.31
230 0.32
231 0.25
232 0.27
233 0.25
234 0.23
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.11
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.22
282 0.29
283 0.31
284 0.36
285 0.38
286 0.4
287 0.42
288 0.44
289 0.4
290 0.39
291 0.4
292 0.37
293 0.34
294 0.31
295 0.28
296 0.22
297 0.2
298 0.13
299 0.08
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.18
305 0.22
306 0.26
307 0.35
308 0.41
309 0.49
310 0.57
311 0.65
312 0.66
313 0.73
314 0.78
315 0.8
316 0.85
317 0.86
318 0.88
319 0.87
320 0.91
321 0.89
322 0.89
323 0.88
324 0.86
325 0.78
326 0.72
327 0.72
328 0.65
329 0.67
330 0.62
331 0.58
332 0.54
333 0.54
334 0.55
335 0.49
336 0.47
337 0.39
338 0.39
339 0.34
340 0.3
341 0.31
342 0.25
343 0.23
344 0.21
345 0.19
346 0.14
347 0.12
348 0.11
349 0.08
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.09
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.2
371 0.2
372 0.23
373 0.22
374 0.17
375 0.21
376 0.23
377 0.27
378 0.31
379 0.34
380 0.34
381 0.35
382 0.4
383 0.46
384 0.5
385 0.5
386 0.53
387 0.55
388 0.57
389 0.59
390 0.54
391 0.49
392 0.45
393 0.44
394 0.38
395 0.34
396 0.29
397 0.23
398 0.19
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.19
405 0.27
406 0.3
407 0.31
408 0.36
409 0.41
410 0.45
411 0.51
412 0.49
413 0.45
414 0.48
415 0.52
416 0.55
417 0.55
418 0.6
419 0.56
420 0.64
421 0.64
422 0.65