Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HDB5

Protein Details
Accession A0A1A0HDB5    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-91SEPVEAPKKRKSLKKKRGDDDENEABasic
329-353MTSEGKKPRKLRISRAKNNAKPSVIHydrophilic
359-379DNMKKTQKPKARLTDDQKTKIHydrophilic
413-446IKGLKSAQGRVKKPRITKRSTLFKQDRKKFENLHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-83PKKRKSLKKKR
333-350GKKPRKLRISRAKNNAKP
362-389KKTQKPKARLTDDQKTKIGRAKKLLGKA
413-434IKGLKSAQGRVKKPRITKRSTL
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAFSSLFSGAKVDETVNDLLNKSLGPVGRQDVRPRTVVEVPEETASTDKTSGSQAEGAVAKPVDASEPVEAPKKRKSLKKKRGDDDENEALEAEYYAKVTGEPESSAEEEQKVEAAGSDQEAPESSATKTPADRKLSVAKSVDLKEVELQKAERTVFVGNVSNKVISSKTTYKDFKKILRNIGSVESIRFRSIAFDEALPRKVAFARKNLHDSRDTLNAYVVYKEKEASLKAPERLNATVFDHNHIRVDHVAHPSPKDNKRTIFVGNLDFEEKEESLWRYFNSKVDDDVESVRVVRDAKTNMGKGFALVQFKDTLSVNKALLLNDKPMTSEGKKPRKLRISRAKNNAKPSVISPNHFDNMKKTQKPKARLTDDQKTKIGRAKKLLGKADRSSAGQMVAEGSRASKGQTIAGIKGLKSAQGRVKKPRITKRSTLFKQDRKKFENLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.17
4 0.18
5 0.2
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.14
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.18
15 0.23
16 0.3
17 0.34
18 0.42
19 0.46
20 0.48
21 0.49
22 0.47
23 0.47
24 0.46
25 0.44
26 0.41
27 0.36
28 0.35
29 0.33
30 0.31
31 0.26
32 0.22
33 0.21
34 0.17
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.18
44 0.19
45 0.18
46 0.19
47 0.18
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.11
55 0.13
56 0.15
57 0.23
58 0.26
59 0.29
60 0.35
61 0.42
62 0.48
63 0.56
64 0.65
65 0.69
66 0.77
67 0.84
68 0.86
69 0.87
70 0.9
71 0.88
72 0.83
73 0.8
74 0.77
75 0.67
76 0.56
77 0.47
78 0.36
79 0.28
80 0.22
81 0.15
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.13
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.14
116 0.15
117 0.19
118 0.25
119 0.32
120 0.36
121 0.36
122 0.37
123 0.44
124 0.45
125 0.47
126 0.41
127 0.36
128 0.36
129 0.36
130 0.36
131 0.27
132 0.26
133 0.25
134 0.27
135 0.26
136 0.22
137 0.21
138 0.19
139 0.22
140 0.21
141 0.17
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.18
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.17
153 0.15
154 0.11
155 0.17
156 0.2
157 0.22
158 0.29
159 0.34
160 0.37
161 0.45
162 0.48
163 0.49
164 0.54
165 0.57
166 0.59
167 0.59
168 0.56
169 0.5
170 0.48
171 0.43
172 0.33
173 0.29
174 0.23
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.16
185 0.18
186 0.19
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.17
191 0.23
192 0.22
193 0.26
194 0.3
195 0.33
196 0.41
197 0.42
198 0.42
199 0.38
200 0.37
201 0.33
202 0.35
203 0.32
204 0.24
205 0.23
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.16
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.17
218 0.2
219 0.23
220 0.24
221 0.25
222 0.26
223 0.26
224 0.25
225 0.21
226 0.2
227 0.22
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.19
234 0.17
235 0.14
236 0.16
237 0.18
238 0.21
239 0.23
240 0.23
241 0.24
242 0.28
243 0.35
244 0.38
245 0.4
246 0.4
247 0.39
248 0.41
249 0.42
250 0.39
251 0.34
252 0.31
253 0.28
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.19
258 0.17
259 0.15
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.2
270 0.22
271 0.21
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.22
276 0.22
277 0.19
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.14
285 0.15
286 0.2
287 0.25
288 0.28
289 0.26
290 0.28
291 0.26
292 0.22
293 0.25
294 0.22
295 0.21
296 0.18
297 0.19
298 0.18
299 0.18
300 0.2
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.18
305 0.16
306 0.18
307 0.2
308 0.19
309 0.23
310 0.22
311 0.23
312 0.22
313 0.22
314 0.19
315 0.19
316 0.24
317 0.22
318 0.3
319 0.36
320 0.46
321 0.53
322 0.58
323 0.66
324 0.71
325 0.75
326 0.77
327 0.78
328 0.79
329 0.8
330 0.86
331 0.88
332 0.84
333 0.85
334 0.8
335 0.71
336 0.61
337 0.55
338 0.55
339 0.48
340 0.44
341 0.39
342 0.39
343 0.4
344 0.39
345 0.37
346 0.32
347 0.38
348 0.46
349 0.49
350 0.49
351 0.56
352 0.63
353 0.71
354 0.75
355 0.76
356 0.74
357 0.77
358 0.8
359 0.81
360 0.82
361 0.79
362 0.74
363 0.66
364 0.62
365 0.59
366 0.59
367 0.55
368 0.53
369 0.57
370 0.59
371 0.64
372 0.69
373 0.69
374 0.68
375 0.65
376 0.63
377 0.57
378 0.52
379 0.46
380 0.38
381 0.32
382 0.25
383 0.22
384 0.18
385 0.15
386 0.14
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.14
393 0.14
394 0.16
395 0.21
396 0.24
397 0.23
398 0.29
399 0.3
400 0.26
401 0.3
402 0.29
403 0.28
404 0.27
405 0.33
406 0.36
407 0.42
408 0.5
409 0.56
410 0.65
411 0.69
412 0.77
413 0.81
414 0.82
415 0.81
416 0.84
417 0.83
418 0.84
419 0.83
420 0.84
421 0.84
422 0.84
423 0.86
424 0.86
425 0.87
426 0.82