Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HHK0

Protein Details
Accession A0A1A0HHK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-265CSAACQSDAEKHKPRKKRRRANWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-264KHKPRKKRRRAN
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8.5, cyto_nucl 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MASVVKSSSSVYSTYISTVDHLPCDIVRSLWVVQACNLAADSERQKLHDLLRHVRPSHVHQQPDRQGFLHAYQELRLKIQRWNREAVAELESLGIQMKTHGAMLRRGVGLLRVTAQAPQAPEPRASSELLKLQLDEHYRENPLASQVEALQERVLHGLRNVVIKHVPGRSSGVKIILKLPKARDRGAAPGEPERYCFCHQPSFGDMIACDFAKCKNGEWFHYKCVGLLNRAEVSRYKTQKWYCSAACQSDAEKHKPRKKRRRANW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.14
4 0.15
5 0.19
6 0.18
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.18
13 0.13
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.2
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.15
28 0.17
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.24
33 0.27
34 0.31
35 0.32
36 0.35
37 0.37
38 0.46
39 0.51
40 0.5
41 0.5
42 0.48
43 0.5
44 0.54
45 0.53
46 0.51
47 0.47
48 0.56
49 0.61
50 0.62
51 0.57
52 0.47
53 0.43
54 0.38
55 0.37
56 0.32
57 0.25
58 0.21
59 0.21
60 0.25
61 0.23
62 0.24
63 0.24
64 0.21
65 0.26
66 0.33
67 0.4
68 0.39
69 0.43
70 0.41
71 0.39
72 0.39
73 0.35
74 0.3
75 0.21
76 0.18
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.08
88 0.09
89 0.12
90 0.14
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.17
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.17
118 0.14
119 0.13
120 0.16
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.15
155 0.19
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.24
160 0.23
161 0.23
162 0.29
163 0.29
164 0.3
165 0.31
166 0.36
167 0.38
168 0.41
169 0.42
170 0.39
171 0.37
172 0.41
173 0.42
174 0.38
175 0.33
176 0.35
177 0.37
178 0.33
179 0.33
180 0.28
181 0.29
182 0.3
183 0.31
184 0.29
185 0.32
186 0.32
187 0.34
188 0.35
189 0.33
190 0.31
191 0.27
192 0.24
193 0.19
194 0.2
195 0.16
196 0.13
197 0.1
198 0.11
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.24
203 0.27
204 0.33
205 0.39
206 0.42
207 0.41
208 0.46
209 0.44
210 0.36
211 0.4
212 0.38
213 0.34
214 0.33
215 0.33
216 0.31
217 0.31
218 0.32
219 0.27
220 0.3
221 0.36
222 0.39
223 0.39
224 0.45
225 0.51
226 0.58
227 0.6
228 0.62
229 0.55
230 0.59
231 0.61
232 0.56
233 0.53
234 0.47
235 0.44
236 0.45
237 0.49
238 0.48
239 0.52
240 0.58
241 0.64
242 0.72
243 0.81
244 0.84
245 0.88