Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HB78

Protein Details
Accession A0A1A0HB78    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-105RAKIDKIPKDKLKTKAKKKSARTSNVVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-98LRAKIDKIPKDKLKTKAKKKSA
227-229KKR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 11.833, cyto_nucl 10.166, mito 8, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035503  IOC4-like_PWWP  
IPR000313  PWWP_dom  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF00855  PWWP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50812  PWWP  
CDD cd05840  PWWP_ScIOC4-like  
Amino Acid Sequences MAPKPDKRPLFQPKDMVLAKMTGFPAWPSFVMPPDMVPEAILKAKKKTTNTCVIFIPDGDFNWMNEKSLEVLSPEKLRAKIDKIPKDKLKTKAKKKSARTSNVVEALVAASGLQFDAFMADLASAKAALDDGPDGADDGGRVSEEALPDADVLAEDADNSEGQKDETALDGHENGAHDDGAHDDGAHEDDANNDGAPKDGASKDGPHKDGLPAARDKAAVSEQPAPKKRAGSPRTKAMSESDRQHQLWLCRIKLQRSLIQRNQPVTPKDPKSFPPPSVDELLMARIILQKLADFPVTVDLLRDTKIHKVLKCIVKDGDLEYPDSFRLHEKCTELLEKWLCLIEGIKLGKAVKTESRVGSSAPEDSEISAIELKHTLDKSDAGKIGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.65
3 0.56
4 0.46
5 0.39
6 0.33
7 0.29
8 0.28
9 0.19
10 0.18
11 0.18
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.16
16 0.17
17 0.19
18 0.21
19 0.2
20 0.18
21 0.19
22 0.2
23 0.18
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.2
28 0.23
29 0.23
30 0.27
31 0.35
32 0.4
33 0.47
34 0.54
35 0.57
36 0.63
37 0.64
38 0.62
39 0.57
40 0.54
41 0.47
42 0.38
43 0.33
44 0.23
45 0.2
46 0.22
47 0.2
48 0.17
49 0.22
50 0.22
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.19
61 0.22
62 0.24
63 0.25
64 0.28
65 0.31
66 0.34
67 0.39
68 0.46
69 0.53
70 0.55
71 0.63
72 0.68
73 0.72
74 0.74
75 0.76
76 0.77
77 0.78
78 0.82
79 0.83
80 0.86
81 0.86
82 0.89
83 0.9
84 0.89
85 0.87
86 0.82
87 0.77
88 0.74
89 0.68
90 0.58
91 0.47
92 0.37
93 0.28
94 0.22
95 0.15
96 0.08
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.02
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.13
190 0.19
191 0.24
192 0.25
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.26
197 0.24
198 0.21
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.14
208 0.21
209 0.23
210 0.31
211 0.36
212 0.36
213 0.37
214 0.39
215 0.42
216 0.45
217 0.48
218 0.51
219 0.51
220 0.58
221 0.59
222 0.56
223 0.52
224 0.46
225 0.45
226 0.4
227 0.39
228 0.35
229 0.37
230 0.37
231 0.39
232 0.37
233 0.33
234 0.37
235 0.37
236 0.33
237 0.34
238 0.38
239 0.39
240 0.42
241 0.44
242 0.42
243 0.46
244 0.55
245 0.55
246 0.6
247 0.61
248 0.57
249 0.57
250 0.57
251 0.52
252 0.48
253 0.5
254 0.48
255 0.47
256 0.47
257 0.47
258 0.49
259 0.51
260 0.48
261 0.45
262 0.43
263 0.43
264 0.42
265 0.39
266 0.31
267 0.26
268 0.25
269 0.18
270 0.14
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.09
281 0.09
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.18
292 0.26
293 0.31
294 0.31
295 0.37
296 0.45
297 0.51
298 0.52
299 0.5
300 0.44
301 0.41
302 0.41
303 0.37
304 0.34
305 0.28
306 0.27
307 0.24
308 0.23
309 0.22
310 0.21
311 0.19
312 0.18
313 0.21
314 0.22
315 0.26
316 0.27
317 0.29
318 0.33
319 0.37
320 0.32
321 0.38
322 0.36
323 0.32
324 0.3
325 0.29
326 0.24
327 0.2
328 0.19
329 0.13
330 0.17
331 0.18
332 0.17
333 0.19
334 0.2
335 0.21
336 0.22
337 0.24
338 0.24
339 0.28
340 0.33
341 0.33
342 0.37
343 0.36
344 0.35
345 0.35
346 0.31
347 0.29
348 0.24
349 0.23
350 0.2
351 0.19
352 0.19
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.15
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.25
365 0.26
366 0.32