Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HCJ2

Protein Details
Accession A0A1A0HCJ2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-66TTAASEPASKKKKSKKKKSTKGAGDSNGTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-58SKKKKSKKKKSTKG
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 8.333, mito_nucl 7.833, mito 7.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF07719  TPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MPESSFLARNKTAIVAAALASASAVGAYYYYAQSQATTAASEPASKKKKSKKKKSTKGAGDSNGTKANGETSKKDTTSAAEAKAPYPVNSQGFPEITEELIAKLSDLEKEEWALSLKKAGNDRYKAENFEDAITFYSAALQVKQDPVFYSNRSACYAALDKHEQVIEDATAAINIKRDYVKCILRRANSYEALEKYPESMLDLTALTIFGGFNSKSVEQSLEKVLQKHSLKIVEANLKNRVPELPSASTIGSFFGTYVPETAPEGISEESTGGDKFLFEALANIDANTVEGYENADSLLNQAVKAYNIDSLDKTSSEAATASIALEYLAAFKFMKNEPTEASALIDQAVALKPRPRTYIMRALINADKSSFTEALADFELAQKPDPENGDVYYHLGQLYYLTSDLDKAEENFKKAKQYNPENLYAYIQLACIIYKQGKFEESEKSFNEARLKFPTSPEILNYYGEILADHGDIQGAIKQYEIAARLQEALPNYSVGAVPLINKASLISREGPEQLPIAEELLTKACELDPKSEIARISLAQVKLQTDKPEEAVALFEEGSDLARTFEEKVQATSFAEATKMQLKIKADPVLSAKVREYLAASM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.12
6 0.1
7 0.09
8 0.07
9 0.06
10 0.04
11 0.04
12 0.03
13 0.03
14 0.04
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.14
27 0.14
28 0.19
29 0.22
30 0.3
31 0.37
32 0.41
33 0.5
34 0.57
35 0.68
36 0.74
37 0.83
38 0.84
39 0.88
40 0.94
41 0.96
42 0.96
43 0.95
44 0.94
45 0.92
46 0.86
47 0.82
48 0.74
49 0.67
50 0.61
51 0.5
52 0.41
53 0.31
54 0.32
55 0.3
56 0.31
57 0.31
58 0.32
59 0.38
60 0.38
61 0.4
62 0.35
63 0.32
64 0.37
65 0.37
66 0.33
67 0.31
68 0.32
69 0.31
70 0.36
71 0.33
72 0.26
73 0.26
74 0.3
75 0.28
76 0.28
77 0.3
78 0.28
79 0.27
80 0.27
81 0.25
82 0.2
83 0.17
84 0.17
85 0.15
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.15
95 0.14
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.18
100 0.17
101 0.14
102 0.19
103 0.21
104 0.24
105 0.29
106 0.36
107 0.42
108 0.45
109 0.48
110 0.51
111 0.52
112 0.51
113 0.48
114 0.45
115 0.37
116 0.35
117 0.31
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.16
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.19
134 0.21
135 0.22
136 0.27
137 0.26
138 0.28
139 0.29
140 0.29
141 0.26
142 0.27
143 0.29
144 0.24
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.26
149 0.27
150 0.22
151 0.19
152 0.18
153 0.13
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.14
164 0.15
165 0.19
166 0.25
167 0.32
168 0.34
169 0.42
170 0.47
171 0.47
172 0.52
173 0.52
174 0.52
175 0.48
176 0.46
177 0.43
178 0.38
179 0.36
180 0.32
181 0.27
182 0.22
183 0.19
184 0.16
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.12
206 0.15
207 0.17
208 0.21
209 0.22
210 0.24
211 0.24
212 0.3
213 0.3
214 0.3
215 0.31
216 0.27
217 0.26
218 0.26
219 0.3
220 0.3
221 0.32
222 0.33
223 0.35
224 0.34
225 0.33
226 0.31
227 0.28
228 0.21
229 0.2
230 0.22
231 0.19
232 0.19
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.09
320 0.1
321 0.14
322 0.14
323 0.16
324 0.16
325 0.19
326 0.19
327 0.16
328 0.17
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.12
339 0.14
340 0.16
341 0.19
342 0.22
343 0.26
344 0.32
345 0.41
346 0.4
347 0.41
348 0.39
349 0.39
350 0.38
351 0.34
352 0.28
353 0.19
354 0.17
355 0.14
356 0.17
357 0.13
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.09
365 0.11
366 0.13
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.16
379 0.14
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.17
396 0.19
397 0.22
398 0.25
399 0.26
400 0.34
401 0.37
402 0.42
403 0.43
404 0.5
405 0.57
406 0.57
407 0.61
408 0.54
409 0.52
410 0.47
411 0.38
412 0.3
413 0.21
414 0.16
415 0.12
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.12
421 0.13
422 0.15
423 0.16
424 0.17
425 0.2
426 0.22
427 0.29
428 0.29
429 0.33
430 0.32
431 0.36
432 0.35
433 0.37
434 0.43
435 0.34
436 0.34
437 0.36
438 0.39
439 0.36
440 0.36
441 0.38
442 0.33
443 0.33
444 0.31
445 0.29
446 0.26
447 0.25
448 0.23
449 0.18
450 0.16
451 0.14
452 0.12
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.12
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.1
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.11
491 0.14
492 0.15
493 0.17
494 0.18
495 0.18
496 0.21
497 0.24
498 0.24
499 0.23
500 0.22
501 0.18
502 0.16
503 0.15
504 0.13
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.15
514 0.17
515 0.2
516 0.2
517 0.23
518 0.24
519 0.27
520 0.26
521 0.23
522 0.24
523 0.2
524 0.22
525 0.25
526 0.24
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.29
531 0.32
532 0.34
533 0.32
534 0.33
535 0.33
536 0.32
537 0.3
538 0.26
539 0.23
540 0.18
541 0.15
542 0.13
543 0.11
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.13
553 0.17
554 0.22
555 0.22
556 0.25
557 0.26
558 0.27
559 0.27
560 0.26
561 0.24
562 0.18
563 0.18
564 0.15
565 0.17
566 0.21
567 0.23
568 0.23
569 0.27
570 0.29
571 0.34
572 0.4
573 0.43
574 0.37
575 0.39
576 0.41
577 0.46
578 0.45
579 0.42
580 0.36
581 0.34
582 0.34
583 0.31