Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HHT0

Protein Details
Accession A0A1A0HHT0    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-98ATPAKHSKKPFDRHSRTGKTBasic
190-213VEPSATKKSKQKSQKEKKFLDFNAHydrophilic
221-242KFSNDRKPGFKGKKSNAPNSKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-97PAKARKNKKAPTGNDAALKNKTNNKSTPGPSATPAKHSKKPFDRHSRTGK
229-234GFKGKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSFENKNLYALLGNDVEDDTVPAPMPKEITKATTSSKKADVPPPSADPAKARKNKKAPTGNDAALKNKTNNKSTPGPSATPAKHSKKPFDRHSRTGKTDSKKQVKQAWGDDKKELEDESRAEADAAAELAAEAEENPSGPAAKSLQDYLAELREKEAALGGARVVRKANEGAEAKWTAAEKIEKEQASYVEPSATKKSKQKSQKEKKFLDFNAVFADETPKFSNDRKPGFKGKKSNAPNSKVVKKEQNFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.13
13 0.13
14 0.17
15 0.18
16 0.22
17 0.24
18 0.26
19 0.32
20 0.38
21 0.4
22 0.4
23 0.43
24 0.44
25 0.48
26 0.52
27 0.52
28 0.48
29 0.49
30 0.49
31 0.49
32 0.45
33 0.41
34 0.39
35 0.41
36 0.46
37 0.49
38 0.52
39 0.58
40 0.66
41 0.72
42 0.76
43 0.78
44 0.72
45 0.71
46 0.71
47 0.65
48 0.61
49 0.55
50 0.49
51 0.44
52 0.42
53 0.39
54 0.4
55 0.42
56 0.41
57 0.42
58 0.43
59 0.46
60 0.47
61 0.5
62 0.46
63 0.42
64 0.4
65 0.45
66 0.4
67 0.39
68 0.45
69 0.44
70 0.47
71 0.5
72 0.57
73 0.58
74 0.66
75 0.7
76 0.72
77 0.74
78 0.75
79 0.81
80 0.79
81 0.74
82 0.73
83 0.71
84 0.66
85 0.67
86 0.69
87 0.68
88 0.64
89 0.66
90 0.65
91 0.62
92 0.61
93 0.6
94 0.61
95 0.57
96 0.56
97 0.51
98 0.45
99 0.4
100 0.36
101 0.28
102 0.19
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.13
165 0.15
166 0.17
167 0.14
168 0.18
169 0.25
170 0.23
171 0.24
172 0.25
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.2
177 0.16
178 0.17
179 0.19
180 0.25
181 0.28
182 0.3
183 0.36
184 0.44
185 0.49
186 0.59
187 0.67
188 0.71
189 0.79
190 0.84
191 0.88
192 0.88
193 0.87
194 0.86
195 0.76
196 0.75
197 0.64
198 0.54
199 0.48
200 0.41
201 0.33
202 0.24
203 0.29
204 0.19
205 0.22
206 0.23
207 0.2
208 0.22
209 0.25
210 0.34
211 0.38
212 0.47
213 0.5
214 0.55
215 0.64
216 0.71
217 0.77
218 0.78
219 0.78
220 0.79
221 0.81
222 0.85
223 0.83
224 0.79
225 0.79
226 0.77
227 0.78
228 0.73
229 0.72
230 0.72
231 0.66
232 0.7