Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0H5J1

Protein Details
Accession A0A1A0H5J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-166EAFSKKKTPGAKGKKMRRWVNGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-161KKKTPGAKGKKMRR
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 15, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013822  Signal_recog_particl_SRP54_hlx  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF00448  SRP54  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
Amino Acid Sequences MSQSLIVFEPSGRVLYQQNNKISPFNDLIYSIVDESYTELERNFYTVNGGSSHKRFYCLKVKETWAAIYFDMVFTFDSEKIRHSLLDVLRTYSQLHEEDLEKMAKLIDFQFNNLVKLKVNFLVPENEPNGKLSPVAAEADTVAEAFSKKKTPGAKGKKMRRWVNGELVDVTADDKILDYSESRPSEDDAGFVRDDLKIDHETAFTRENDLVLINELHDVLGREEDEDSGEETTMTTSSKQGFLSKITSYFGSSADIKEVSKKFTDQLISKNIAPPTAKAIIDRIESKIASKTVTIPVFKQVLTDELTKILTPNVSTDLLYDIKKNKRDRPYVISVVGVNGVGKSTNLAKLAFWFLQNNMNVLICACDTFRSGAVEQLKVHVNNLQRLNSGSSSDSRIELFEKGYGGGDHVVTTAKLAIAYASSSKFDIVLIDTAGRTHSNAKLMAPLKKFGDAADPDRIIMVGEALVGTDSVEQATNFNNAFGNRRSLDFFIISKVDTVGDLVGAMINMVMATRVPILFVGTGQTYTDIKKLSVKRVVDMLTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.27
3 0.36
4 0.41
5 0.47
6 0.5
7 0.52
8 0.54
9 0.5
10 0.47
11 0.41
12 0.35
13 0.3
14 0.26
15 0.25
16 0.23
17 0.24
18 0.18
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.17
30 0.15
31 0.12
32 0.15
33 0.15
34 0.17
35 0.17
36 0.21
37 0.24
38 0.27
39 0.34
40 0.31
41 0.34
42 0.35
43 0.4
44 0.47
45 0.48
46 0.5
47 0.5
48 0.55
49 0.56
50 0.55
51 0.52
52 0.44
53 0.4
54 0.35
55 0.29
56 0.24
57 0.19
58 0.16
59 0.13
60 0.1
61 0.09
62 0.12
63 0.12
64 0.15
65 0.15
66 0.17
67 0.19
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.23
72 0.23
73 0.3
74 0.29
75 0.31
76 0.31
77 0.31
78 0.31
79 0.25
80 0.26
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.21
87 0.2
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.28
98 0.28
99 0.31
100 0.31
101 0.28
102 0.23
103 0.24
104 0.26
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.23
110 0.23
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.26
116 0.25
117 0.21
118 0.19
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.12
135 0.13
136 0.18
137 0.24
138 0.32
139 0.42
140 0.52
141 0.6
142 0.67
143 0.77
144 0.8
145 0.84
146 0.84
147 0.81
148 0.78
149 0.73
150 0.72
151 0.65
152 0.58
153 0.49
154 0.41
155 0.33
156 0.25
157 0.2
158 0.11
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.22
173 0.21
174 0.2
175 0.14
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.18
191 0.15
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.19
251 0.23
252 0.19
253 0.22
254 0.25
255 0.27
256 0.26
257 0.29
258 0.26
259 0.24
260 0.23
261 0.19
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.18
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.17
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.21
284 0.22
285 0.21
286 0.19
287 0.14
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.1
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.16
308 0.2
309 0.26
310 0.33
311 0.39
312 0.44
313 0.51
314 0.58
315 0.61
316 0.62
317 0.63
318 0.6
319 0.55
320 0.48
321 0.39
322 0.32
323 0.26
324 0.19
325 0.11
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.06
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.11
358 0.12
359 0.16
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.21
364 0.25
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.22
369 0.26
370 0.3
371 0.29
372 0.25
373 0.27
374 0.3
375 0.26
376 0.24
377 0.2
378 0.18
379 0.2
380 0.2
381 0.19
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.07
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.13
425 0.15
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.26
430 0.31
431 0.37
432 0.35
433 0.36
434 0.34
435 0.36
436 0.35
437 0.28
438 0.32
439 0.28
440 0.3
441 0.34
442 0.32
443 0.3
444 0.3
445 0.29
446 0.21
447 0.17
448 0.13
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.05
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.1
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.15
467 0.16
468 0.21
469 0.22
470 0.27
471 0.25
472 0.27
473 0.3
474 0.29
475 0.32
476 0.29
477 0.28
478 0.25
479 0.25
480 0.23
481 0.2
482 0.19
483 0.16
484 0.13
485 0.13
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.03
496 0.03
497 0.04
498 0.03
499 0.05
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.12
508 0.11
509 0.12
510 0.12
511 0.15
512 0.14
513 0.16
514 0.2
515 0.18
516 0.19
517 0.27
518 0.33
519 0.4
520 0.47
521 0.47
522 0.46
523 0.51