Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HAM0

Protein Details
Accession A0A1A0HAM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-107EWIEKEYLRRRTRRINRQKKDEVKAESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-97RTRRINR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021386  SPP41_DUF3020  
Pfam View protein in Pfam  
PF11223  DUF3020  
Amino Acid Sequences MDVQLGRSSWASTRALEAHVLEAQTLGNPRDEPPGDLEGYLLIDSWREENAERNKHNDLRCRVLKRAALKFGEGSSDDKLEWIEKEYLRRRTRRINRQKKDEVKAESPPPSDESSSHHPVLVKRITETFNLVTECGHDEDPRGVFMAISSTVAVVASACAEELNITDSLAIFDLISLTLSSIFDQAMRSGASRKFLFLTKREDNQLTPTGAPEMTQEELFQKVSNLKNFNSSSVSTLDALRESQKRLGIDFLCSLDKRRKTSNETDMKDTGGQISESERDLFTSSSSVNSWSTTSGLKMPLYKTPGNVTDLELFKVDNSRREYVEPIPKITSPFISNKVGVEASSHQSSSLKKGGGLQRPGFSKPANRPNNIGFPTLYSTSFRLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.26
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.22
8 0.17
9 0.15
10 0.14
11 0.14
12 0.17
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.25
18 0.26
19 0.26
20 0.27
21 0.3
22 0.28
23 0.27
24 0.26
25 0.18
26 0.18
27 0.16
28 0.11
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.19
37 0.29
38 0.38
39 0.39
40 0.43
41 0.5
42 0.55
43 0.61
44 0.62
45 0.59
46 0.59
47 0.65
48 0.66
49 0.63
50 0.64
51 0.63
52 0.62
53 0.64
54 0.62
55 0.55
56 0.51
57 0.48
58 0.41
59 0.39
60 0.31
61 0.26
62 0.2
63 0.2
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.19
71 0.2
72 0.29
73 0.37
74 0.47
75 0.53
76 0.59
77 0.62
78 0.67
79 0.76
80 0.78
81 0.81
82 0.83
83 0.84
84 0.88
85 0.92
86 0.9
87 0.88
88 0.84
89 0.79
90 0.72
91 0.69
92 0.64
93 0.59
94 0.51
95 0.45
96 0.4
97 0.35
98 0.32
99 0.27
100 0.27
101 0.29
102 0.33
103 0.31
104 0.3
105 0.3
106 0.3
107 0.37
108 0.36
109 0.29
110 0.25
111 0.28
112 0.29
113 0.27
114 0.29
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.3
186 0.3
187 0.32
188 0.35
189 0.35
190 0.32
191 0.33
192 0.32
193 0.25
194 0.21
195 0.19
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.13
210 0.17
211 0.22
212 0.24
213 0.23
214 0.29
215 0.3
216 0.31
217 0.28
218 0.25
219 0.22
220 0.21
221 0.21
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.19
231 0.21
232 0.21
233 0.22
234 0.26
235 0.22
236 0.22
237 0.21
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.23
242 0.26
243 0.3
244 0.31
245 0.37
246 0.42
247 0.46
248 0.55
249 0.62
250 0.63
251 0.62
252 0.64
253 0.57
254 0.53
255 0.46
256 0.37
257 0.28
258 0.19
259 0.16
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.16
284 0.17
285 0.2
286 0.21
287 0.25
288 0.31
289 0.3
290 0.3
291 0.32
292 0.33
293 0.33
294 0.32
295 0.29
296 0.29
297 0.29
298 0.28
299 0.23
300 0.2
301 0.18
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.29
306 0.31
307 0.33
308 0.35
309 0.38
310 0.39
311 0.47
312 0.43
313 0.41
314 0.41
315 0.4
316 0.41
317 0.39
318 0.34
319 0.28
320 0.31
321 0.32
322 0.34
323 0.33
324 0.31
325 0.32
326 0.29
327 0.24
328 0.23
329 0.22
330 0.22
331 0.24
332 0.23
333 0.21
334 0.23
335 0.26
336 0.28
337 0.3
338 0.26
339 0.25
340 0.33
341 0.41
342 0.47
343 0.54
344 0.52
345 0.52
346 0.55
347 0.56
348 0.52
349 0.47
350 0.47
351 0.48
352 0.55
353 0.58
354 0.57
355 0.6
356 0.63
357 0.69
358 0.63
359 0.55
360 0.45
361 0.4
362 0.42
363 0.39
364 0.34
365 0.27