Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HKN9

Protein Details
Accession A0A1A0HKN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MGSKRKRNEKKKDFQKTKLKVGKTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-21KRKRNEKKKDFQKTKLKV
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 11.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSKRKRNEKKKDFQKTKLKVGKTLAKPDNYTDTSFTAKSISLPNQTISKKSGGNGDVSHSKGDVDITHQLLLMKHHLASTRKEVVNFVEAHLPSNTSMYKQILTMTISLVTDPSASVRDAFVSLLSACADKQAGFLELHMRTIVLFVHSAMTHIKSEVRGSSTKVLDVLVKKAPIPLVKGHFVKTLRSYFPLMAWTLSGDKKAISLAVNTSDTLGGISSKVRTNHLAVLERLLESSLFEPEINASSFSIDWTKCTAVHPQSSRFLLPSNPQAYTQLKLYVDDLPTNLDVKSTEAAEGSFALSDIDSVSTEDQETRRKITYDVFLLPLRKNLGNAVKEGGEFGKQANKCLGVLERFEKAYEASQEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.93
3 0.9
4 0.9
5 0.88
6 0.8
7 0.76
8 0.75
9 0.74
10 0.71
11 0.73
12 0.7
13 0.66
14 0.65
15 0.62
16 0.62
17 0.55
18 0.5
19 0.42
20 0.37
21 0.36
22 0.34
23 0.3
24 0.23
25 0.2
26 0.2
27 0.24
28 0.26
29 0.28
30 0.3
31 0.32
32 0.38
33 0.39
34 0.4
35 0.37
36 0.36
37 0.32
38 0.32
39 0.37
40 0.3
41 0.32
42 0.3
43 0.32
44 0.33
45 0.32
46 0.31
47 0.24
48 0.22
49 0.19
50 0.19
51 0.14
52 0.13
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.22
65 0.24
66 0.27
67 0.32
68 0.37
69 0.37
70 0.38
71 0.37
72 0.35
73 0.37
74 0.33
75 0.27
76 0.25
77 0.23
78 0.25
79 0.24
80 0.22
81 0.17
82 0.19
83 0.18
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.16
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.26
170 0.26
171 0.25
172 0.26
173 0.26
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.07
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.21
213 0.24
214 0.25
215 0.22
216 0.23
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.14
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.23
244 0.24
245 0.32
246 0.34
247 0.36
248 0.4
249 0.41
250 0.4
251 0.33
252 0.3
253 0.25
254 0.26
255 0.3
256 0.28
257 0.27
258 0.27
259 0.31
260 0.31
261 0.3
262 0.27
263 0.24
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.2
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.12
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.13
299 0.15
300 0.23
301 0.25
302 0.28
303 0.3
304 0.31
305 0.32
306 0.35
307 0.38
308 0.36
309 0.36
310 0.35
311 0.36
312 0.39
313 0.38
314 0.36
315 0.34
316 0.3
317 0.28
318 0.31
319 0.36
320 0.34
321 0.35
322 0.34
323 0.31
324 0.3
325 0.31
326 0.25
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.22
331 0.21
332 0.24
333 0.27
334 0.27
335 0.25
336 0.28
337 0.32
338 0.28
339 0.33
340 0.34
341 0.33
342 0.32
343 0.33
344 0.3
345 0.26
346 0.28