Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HK28

Protein Details
Accession A0A1A0HK28    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MIRTVKPKNARSKRALAKKEAKLVEHydrophilic
50-71MALKKPEAKKFSKKNDIRPFEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-20KPKNARSKRALAKKE
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTVKPKNARSKRALAKKEAKLVENTKQALFVPGGSGNKFLHDVMVDLMALKKPEAKKFSKKNDIRPFEDASGLEFFAEKNDCSLMVLSTHNKKRPNTLIFSRFFNHKVYDMIELSIQSDPKLFSDFRKVTFPVGLKPMFTFNGPAFDSHPVYQQIKSYFLDFYRGDETDLQDVAGLQYIIALSVGEIEDPNSLTLPLLHFRVYKLKTYKSGQKIPRVEVDEIGPRFDFKIGRRTTPAPDVEKSALSRPKQLQAKVKKNVTTDFMGDKVAKIHVGDQDLSKMQTRKMKGLKAKYDQVDEAEFDEEDYGVEESENKRQKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.84
3 0.83
4 0.83
5 0.81
6 0.82
7 0.77
8 0.69
9 0.67
10 0.65
11 0.63
12 0.61
13 0.56
14 0.47
15 0.44
16 0.41
17 0.36
18 0.3
19 0.22
20 0.17
21 0.18
22 0.2
23 0.2
24 0.22
25 0.19
26 0.21
27 0.22
28 0.19
29 0.16
30 0.14
31 0.14
32 0.11
33 0.12
34 0.1
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.16
41 0.2
42 0.28
43 0.35
44 0.41
45 0.5
46 0.6
47 0.7
48 0.75
49 0.78
50 0.81
51 0.85
52 0.84
53 0.79
54 0.73
55 0.68
56 0.58
57 0.54
58 0.42
59 0.34
60 0.28
61 0.23
62 0.18
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.1
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.09
75 0.12
76 0.16
77 0.25
78 0.31
79 0.36
80 0.41
81 0.42
82 0.49
83 0.55
84 0.56
85 0.54
86 0.56
87 0.59
88 0.55
89 0.58
90 0.52
91 0.46
92 0.42
93 0.37
94 0.3
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.19
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.22
114 0.23
115 0.24
116 0.28
117 0.28
118 0.26
119 0.3
120 0.29
121 0.22
122 0.25
123 0.23
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.1
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.15
138 0.18
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.2
143 0.18
144 0.19
145 0.19
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.19
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.14
158 0.14
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.03
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.02
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.2
191 0.22
192 0.27
193 0.31
194 0.34
195 0.38
196 0.43
197 0.51
198 0.51
199 0.58
200 0.57
201 0.62
202 0.63
203 0.6
204 0.61
205 0.57
206 0.5
207 0.41
208 0.38
209 0.35
210 0.31
211 0.3
212 0.23
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.2
217 0.15
218 0.25
219 0.26
220 0.3
221 0.34
222 0.37
223 0.39
224 0.42
225 0.46
226 0.41
227 0.39
228 0.4
229 0.37
230 0.37
231 0.34
232 0.34
233 0.36
234 0.32
235 0.39
236 0.38
237 0.45
238 0.49
239 0.54
240 0.56
241 0.6
242 0.69
243 0.7
244 0.73
245 0.7
246 0.67
247 0.64
248 0.58
249 0.51
250 0.44
251 0.37
252 0.31
253 0.29
254 0.26
255 0.23
256 0.2
257 0.18
258 0.16
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.2
263 0.21
264 0.2
265 0.24
266 0.24
267 0.25
268 0.28
269 0.26
270 0.28
271 0.35
272 0.37
273 0.43
274 0.49
275 0.56
276 0.6
277 0.67
278 0.72
279 0.73
280 0.78
281 0.73
282 0.7
283 0.63
284 0.57
285 0.49
286 0.4
287 0.34
288 0.27
289 0.22
290 0.17
291 0.16
292 0.13
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.11
299 0.14
300 0.24