Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HJK0

Protein Details
Accession A0A1A0HJK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-43LSIFENSRKPQRKAKKNRANVPYIHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-36RKPQRKAKKNR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MFSKKDLGSRKKTFPGLPLSIFENSRKPQRKAKKNRANVPYIHEDPEADVFINVKKFKPSKPAADQSEFEHLDKLLLVLDHETIAEAITELKTDAFPENISGLSNESKFLPPSLKDSTSLASLILGQDASLAQADATREKYKNQDFPLPKSKRDLKHRTKRLLGIVPRLLAGEEDLSIFYTFAHNQSRNLPHVTMSPAESFDLPWLQYTAGFYGLRRQNFVSQLIEAEHGELLRKSRNKTVVYWSPDMFCTYVLAPEIILRLVMEDMALSRDEAESLLRQTADFGSHVADGVELVDDLDFDELEILTRGISEPKKSGPHET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.6
4 0.55
5 0.49
6 0.45
7 0.42
8 0.41
9 0.37
10 0.36
11 0.35
12 0.43
13 0.5
14 0.51
15 0.58
16 0.67
17 0.75
18 0.79
19 0.86
20 0.86
21 0.88
22 0.93
23 0.9
24 0.87
25 0.79
26 0.75
27 0.72
28 0.64
29 0.57
30 0.47
31 0.39
32 0.34
33 0.32
34 0.26
35 0.18
36 0.15
37 0.12
38 0.15
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.26
43 0.3
44 0.34
45 0.43
46 0.47
47 0.5
48 0.58
49 0.66
50 0.65
51 0.67
52 0.64
53 0.57
54 0.59
55 0.51
56 0.42
57 0.34
58 0.26
59 0.22
60 0.2
61 0.17
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.19
100 0.23
101 0.23
102 0.23
103 0.24
104 0.23
105 0.21
106 0.2
107 0.15
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.1
124 0.14
125 0.14
126 0.16
127 0.24
128 0.28
129 0.33
130 0.35
131 0.41
132 0.4
133 0.46
134 0.55
135 0.51
136 0.47
137 0.48
138 0.53
139 0.51
140 0.59
141 0.63
142 0.63
143 0.71
144 0.79
145 0.78
146 0.75
147 0.71
148 0.66
149 0.62
150 0.54
151 0.49
152 0.42
153 0.36
154 0.32
155 0.28
156 0.22
157 0.15
158 0.12
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.09
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.23
174 0.26
175 0.27
176 0.29
177 0.27
178 0.22
179 0.23
180 0.24
181 0.19
182 0.17
183 0.15
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.18
201 0.23
202 0.23
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.29
207 0.32
208 0.25
209 0.2
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.15
214 0.13
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.16
221 0.21
222 0.23
223 0.3
224 0.38
225 0.39
226 0.42
227 0.49
228 0.51
229 0.53
230 0.53
231 0.47
232 0.42
233 0.4
234 0.38
235 0.29
236 0.2
237 0.16
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.14
297 0.18
298 0.21
299 0.25
300 0.31
301 0.39