Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HDE1

Protein Details
Accession A0A1A0HDE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-129DEKAGRAPKKVKRQKSQIAKVYNSKTAVKEKNRARRRARDLRLKAQLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-123RRAARRAGEPVADEKAGRAPKKVKRQKSQIAKVYNSKTAVKEKNRARRRARDLR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSETGQLQNQPTKHETGAIGATLSPASFPCHFCGRAFSRKGTYGRHLDSKKGDAQHPAGQVEALRSGVVRRAARRAGEPVADEKAGRAPKKVKRQKSQIAKVYNSKTAVKEKNRARRRARDLRLKAQLQAHEWYIGMLSGPQGLAQGPAGRAENASLEAGKQAHRSQGLESGPERSQKSGQKSDAEIYGARYAYAVASNVPPSQWPQKNGYPGDAEFGATVGQLTALAGMAPYNRSAPGPQYFQGLGPQSGGGAAAQDSTGAAALEQVFAWHAHWAQLGPSTKRALWQAECDRALRTHLHGASLCQISGAAAVVREKTRQLCEQYSQGAFLDSILTDSGPETP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.29
4 0.29
5 0.24
6 0.21
7 0.17
8 0.17
9 0.13
10 0.12
11 0.09
12 0.08
13 0.12
14 0.14
15 0.16
16 0.19
17 0.25
18 0.27
19 0.27
20 0.35
21 0.38
22 0.45
23 0.47
24 0.48
25 0.48
26 0.53
27 0.57
28 0.55
29 0.56
30 0.55
31 0.56
32 0.6
33 0.57
34 0.56
35 0.57
36 0.55
37 0.54
38 0.5
39 0.48
40 0.45
41 0.48
42 0.47
43 0.46
44 0.41
45 0.35
46 0.3
47 0.28
48 0.23
49 0.19
50 0.13
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.13
55 0.19
56 0.21
57 0.23
58 0.29
59 0.33
60 0.35
61 0.37
62 0.38
63 0.35
64 0.33
65 0.32
66 0.28
67 0.28
68 0.26
69 0.23
70 0.19
71 0.22
72 0.26
73 0.25
74 0.27
75 0.33
76 0.41
77 0.53
78 0.62
79 0.66
80 0.7
81 0.79
82 0.83
83 0.86
84 0.87
85 0.85
86 0.82
87 0.77
88 0.75
89 0.69
90 0.64
91 0.55
92 0.48
93 0.44
94 0.45
95 0.49
96 0.47
97 0.52
98 0.56
99 0.64
100 0.7
101 0.76
102 0.76
103 0.78
104 0.81
105 0.83
106 0.83
107 0.84
108 0.82
109 0.81
110 0.81
111 0.72
112 0.66
113 0.6
114 0.54
115 0.45
116 0.4
117 0.32
118 0.24
119 0.22
120 0.18
121 0.13
122 0.1
123 0.07
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.22
161 0.22
162 0.18
163 0.23
164 0.26
165 0.32
166 0.35
167 0.36
168 0.35
169 0.36
170 0.35
171 0.31
172 0.27
173 0.21
174 0.17
175 0.17
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.07
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.11
190 0.2
191 0.23
192 0.25
193 0.3
194 0.34
195 0.41
196 0.41
197 0.4
198 0.34
199 0.3
200 0.29
201 0.24
202 0.2
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.13
225 0.17
226 0.2
227 0.2
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.26
232 0.24
233 0.2
234 0.17
235 0.16
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.07
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.17
265 0.22
266 0.22
267 0.26
268 0.28
269 0.27
270 0.3
271 0.33
272 0.33
273 0.31
274 0.38
275 0.41
276 0.46
277 0.47
278 0.45
279 0.43
280 0.38
281 0.38
282 0.31
283 0.28
284 0.29
285 0.28
286 0.31
287 0.29
288 0.3
289 0.34
290 0.32
291 0.28
292 0.19
293 0.18
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.12
301 0.14
302 0.16
303 0.2
304 0.24
305 0.29
306 0.35
307 0.4
308 0.42
309 0.46
310 0.49
311 0.51
312 0.48
313 0.44
314 0.37
315 0.32
316 0.26
317 0.21
318 0.17
319 0.11
320 0.11
321 0.09
322 0.09
323 0.08