Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1A0HDP3

Protein Details
Accession A0A1A0HDP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-38RTSNGHKLKQHHVRRGRQEEGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-26KPSEERAQKGRTSNGHKLKQ
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, pero 4, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007209  RNaseL-inhib-like_metal-bd_dom  
IPR022968  Tsr3-like  
IPR007177  Tsr3_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0106388  F:18S rRNA aminocarboxypropyltransferase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04034  Ribo_biogen_C  
PF04068  RLI  
Amino Acid Sequences MGKGKNKPSEERAQKGRTSNGHKLKQHHVRRGRQEEGVVVRTDTDKFPVKLAMWDFDHCDPKRCLGKKLERLGYIRNLRVGMKFQGIVVSPNGTGVVCPDDREIVEQQGAAVVECSWARLDEVPFNKIGGKHERLLPYLVAANTVNYGRPWKLNCVEALAACFAIVGREGLAAELLQNFSWGPTFLDINRELLRVYQQCTDLALVERAQDEWMAKLEDEVRQRKQQSAEGDVWMMGNVNRQPMDGSDEGSADESADEDEDGDDGPGPDVRYDNLGNIIADSASEESEDASEDEPEDEYTAELDGDDVVYDKLGNIVSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.7
3 0.7
4 0.68
5 0.68
6 0.7
7 0.7
8 0.73
9 0.73
10 0.73
11 0.76
12 0.77
13 0.78
14 0.78
15 0.78
16 0.79
17 0.84
18 0.87
19 0.81
20 0.74
21 0.66
22 0.62
23 0.57
24 0.51
25 0.41
26 0.32
27 0.29
28 0.26
29 0.27
30 0.21
31 0.2
32 0.23
33 0.23
34 0.24
35 0.27
36 0.26
37 0.3
38 0.31
39 0.31
40 0.27
41 0.28
42 0.3
43 0.31
44 0.39
45 0.34
46 0.38
47 0.35
48 0.39
49 0.47
50 0.46
51 0.49
52 0.5
53 0.6
54 0.64
55 0.72
56 0.71
57 0.66
58 0.66
59 0.65
60 0.64
61 0.6
62 0.52
63 0.45
64 0.4
65 0.36
66 0.36
67 0.34
68 0.27
69 0.23
70 0.21
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.15
76 0.14
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.21
116 0.23
117 0.24
118 0.25
119 0.3
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.26
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.12
137 0.13
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.17
145 0.16
146 0.12
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.19
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.19
187 0.19
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.15
205 0.22
206 0.27
207 0.3
208 0.36
209 0.38
210 0.41
211 0.43
212 0.43
213 0.4
214 0.4
215 0.38
216 0.32
217 0.31
218 0.27
219 0.24
220 0.18
221 0.14
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.2
231 0.16
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.15
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.17
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.1