Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1A0HDG0

Protein Details
Accession A0A1A0HDG0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
512-534AETFKCHYCYKKHKLNEVSDAYFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 12, mito 6, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024964  CTLH/CRA  
IPR045098  Fyv10_fam  
Gene Ontology GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF10607  CTLH  
Amino Acid Sequences MSRILDTLTAEIAALDRAGAHSLDALVRESSLILLDLKELEADLEDHVARESQAARAGANTTARTLVDDHDMGGFAGRLERRAGAWHSASLGALKQYNGQLLRFVRSAGSGAGGAVDLDDAYAFPLALGSFPAQKAGQNGQAADGGNLPAFSGGNGGSVAPAAASHTQLMRSIVLHFVKTGHAALVAELLDDFRAGSALAPGLLARFLQLGDIVREIRENHDITRALAWFQEQGARGHGGHEPALFKFHMLQFVLLLAGHSQGGQAPSAGGAGAGLERAFAAYAYAKSHFPAHFKRHVDDIAPVLSLLLFPAAGDEDSTRHMAVLRQNVHRAFVQGCEAQSRRSRDTRFVAEMLEHFDTLHANGAFFDRLAHDFVQEFCKGLALSTESSLFQAVLAGHVNLPNFYKYSQLQQRLRRPAPPGPRDLPFSLSSKNQFLFDFHPIFICPVSKEQLMPLVSVATVADVDVRDRKRKQIFVSPHEVLVSPTNPVVVFGHCHHLALKESVRQLTKGGAETFKCHYCYKKHKLNEVSDAYFIDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.05
4 0.06
5 0.08
6 0.08
7 0.07
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.18
44 0.2
45 0.2
46 0.22
47 0.21
48 0.17
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.07
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.19
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.23
77 0.19
78 0.17
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.15
83 0.16
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.24
88 0.25
89 0.28
90 0.25
91 0.24
92 0.2
93 0.19
94 0.2
95 0.14
96 0.13
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.09
118 0.09
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.17
123 0.19
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.23
129 0.22
130 0.19
131 0.16
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.12
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.15
214 0.14
215 0.14
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.12
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.08
243 0.07
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.04
257 0.03
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.03
266 0.03
267 0.02
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.13
276 0.14
277 0.18
278 0.24
279 0.29
280 0.36
281 0.38
282 0.39
283 0.38
284 0.37
285 0.33
286 0.28
287 0.23
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.02
297 0.02
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.15
311 0.22
312 0.25
313 0.28
314 0.32
315 0.33
316 0.34
317 0.31
318 0.29
319 0.22
320 0.18
321 0.18
322 0.15
323 0.15
324 0.19
325 0.19
326 0.21
327 0.26
328 0.3
329 0.32
330 0.37
331 0.4
332 0.41
333 0.46
334 0.48
335 0.45
336 0.41
337 0.36
338 0.31
339 0.29
340 0.26
341 0.21
342 0.16
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.14
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.08
356 0.09
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.1
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.15
393 0.15
394 0.24
395 0.32
396 0.4
397 0.47
398 0.56
399 0.65
400 0.71
401 0.73
402 0.69
403 0.66
404 0.65
405 0.68
406 0.65
407 0.63
408 0.57
409 0.57
410 0.56
411 0.52
412 0.48
413 0.39
414 0.36
415 0.32
416 0.33
417 0.33
418 0.32
419 0.32
420 0.29
421 0.27
422 0.27
423 0.28
424 0.3
425 0.29
426 0.25
427 0.25
428 0.24
429 0.24
430 0.22
431 0.2
432 0.15
433 0.16
434 0.19
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.25
439 0.24
440 0.22
441 0.19
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.07
450 0.06
451 0.09
452 0.16
453 0.21
454 0.29
455 0.32
456 0.41
457 0.48
458 0.54
459 0.58
460 0.61
461 0.67
462 0.66
463 0.73
464 0.65
465 0.58
466 0.52
467 0.46
468 0.38
469 0.33
470 0.26
471 0.18
472 0.17
473 0.17
474 0.15
475 0.17
476 0.16
477 0.13
478 0.16
479 0.17
480 0.24
481 0.22
482 0.23
483 0.23
484 0.24
485 0.26
486 0.29
487 0.31
488 0.3
489 0.34
490 0.39
491 0.4
492 0.38
493 0.36
494 0.35
495 0.34
496 0.33
497 0.33
498 0.33
499 0.32
500 0.35
501 0.4
502 0.39
503 0.39
504 0.38
505 0.41
506 0.46
507 0.55
508 0.62
509 0.66
510 0.7
511 0.77
512 0.83
513 0.84
514 0.84
515 0.8
516 0.73
517 0.64