Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7TDL8

Protein Details
Accession A0A1B7TDL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-54MQSKNKIKTKSGDMKKKPQTKNKKYRYKKRSINFSETSSRKLVRLERRLAKRNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-31KIKTKSGDMKKKPQTKNKKYRYKKRS
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MQSKNKIKTKSGDMKKKPQTKNKKYRYKKRSINFSETSSRKLVRLERRLAKRNDMLNELKQNKRFFIEKSTGLDITKDNKTSILQEQRNHINELISIYKIDTNSEAFLLNLLKYNTCKKFLINETCSNDCRMDHDSVLRYYYINHFKDVLLQLQKQFEIDDFNLYKPIIFKDTADRNVFISLIVYYYKNLLHLVSDYESKIDEYQSSLNIKIPETSGDEDNKKIITKKEINKMMDQALRQNARLRQYKNLIVKFDEKYSVGLSNYTKFINMDTDDIKIQTIGKYLKRILSMEFDNKQKQQFTNSTKKHSFFLCNECGFSLSLKDNDQRLLKHFQGKTHLKYVELWEELARINTIFKILKIDPENYLPIEPSDALVSNTNQGYNNKNYRRNRYTTERTQNYQNNITYEDDKYSHKIKTYNSRRFNEKREDDAVRFTSGRAIDITRPLQSSLKSNPSLTKNINNQGADENRGAARRSRRPITPSIEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.87
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.9
7 0.91
8 0.93
9 0.93
10 0.94
11 0.94
12 0.95
13 0.95
14 0.95
15 0.93
16 0.92
17 0.93
18 0.9
19 0.88
20 0.82
21 0.77
22 0.76
23 0.69
24 0.64
25 0.58
26 0.51
27 0.43
28 0.45
29 0.48
30 0.48
31 0.55
32 0.6
33 0.64
34 0.73
35 0.8
36 0.79
37 0.79
38 0.75
39 0.73
40 0.67
41 0.65
42 0.6
43 0.58
44 0.63
45 0.62
46 0.61
47 0.61
48 0.59
49 0.55
50 0.53
51 0.49
52 0.42
53 0.43
54 0.42
55 0.4
56 0.42
57 0.44
58 0.41
59 0.38
60 0.37
61 0.32
62 0.31
63 0.32
64 0.28
65 0.25
66 0.25
67 0.26
68 0.28
69 0.34
70 0.39
71 0.39
72 0.41
73 0.47
74 0.54
75 0.56
76 0.54
77 0.46
78 0.36
79 0.31
80 0.31
81 0.27
82 0.19
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.25
102 0.27
103 0.3
104 0.31
105 0.29
106 0.37
107 0.44
108 0.52
109 0.49
110 0.53
111 0.55
112 0.58
113 0.57
114 0.51
115 0.43
116 0.33
117 0.3
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.24
122 0.26
123 0.25
124 0.27
125 0.23
126 0.19
127 0.19
128 0.25
129 0.3
130 0.27
131 0.27
132 0.27
133 0.27
134 0.33
135 0.32
136 0.31
137 0.27
138 0.28
139 0.29
140 0.3
141 0.3
142 0.24
143 0.23
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.2
159 0.27
160 0.32
161 0.33
162 0.32
163 0.29
164 0.3
165 0.28
166 0.2
167 0.14
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.22
213 0.29
214 0.35
215 0.43
216 0.5
217 0.51
218 0.5
219 0.5
220 0.46
221 0.4
222 0.34
223 0.29
224 0.28
225 0.27
226 0.26
227 0.28
228 0.27
229 0.31
230 0.37
231 0.35
232 0.35
233 0.39
234 0.44
235 0.47
236 0.47
237 0.41
238 0.38
239 0.4
240 0.36
241 0.33
242 0.28
243 0.21
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.11
268 0.14
269 0.15
270 0.19
271 0.21
272 0.23
273 0.24
274 0.25
275 0.23
276 0.23
277 0.24
278 0.27
279 0.28
280 0.3
281 0.32
282 0.34
283 0.35
284 0.34
285 0.32
286 0.32
287 0.38
288 0.41
289 0.48
290 0.5
291 0.55
292 0.57
293 0.58
294 0.54
295 0.49
296 0.47
297 0.4
298 0.44
299 0.42
300 0.37
301 0.36
302 0.34
303 0.31
304 0.26
305 0.21
306 0.17
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.19
311 0.19
312 0.22
313 0.25
314 0.24
315 0.26
316 0.3
317 0.31
318 0.37
319 0.37
320 0.37
321 0.44
322 0.5
323 0.49
324 0.51
325 0.48
326 0.4
327 0.41
328 0.42
329 0.38
330 0.32
331 0.28
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.19
336 0.15
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.16
344 0.16
345 0.23
346 0.25
347 0.27
348 0.26
349 0.28
350 0.3
351 0.25
352 0.25
353 0.19
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.11
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.18
367 0.19
368 0.24
369 0.3
370 0.4
371 0.44
372 0.53
373 0.6
374 0.68
375 0.73
376 0.74
377 0.73
378 0.73
379 0.75
380 0.76
381 0.79
382 0.75
383 0.7
384 0.74
385 0.73
386 0.69
387 0.67
388 0.59
389 0.49
390 0.46
391 0.46
392 0.39
393 0.34
394 0.31
395 0.26
396 0.26
397 0.29
398 0.3
399 0.3
400 0.31
401 0.34
402 0.38
403 0.47
404 0.55
405 0.62
406 0.67
407 0.69
408 0.75
409 0.78
410 0.8
411 0.8
412 0.75
413 0.71
414 0.68
415 0.69
416 0.61
417 0.61
418 0.55
419 0.48
420 0.42
421 0.35
422 0.34
423 0.28
424 0.27
425 0.21
426 0.22
427 0.22
428 0.28
429 0.31
430 0.28
431 0.29
432 0.31
433 0.32
434 0.31
435 0.34
436 0.34
437 0.4
438 0.4
439 0.41
440 0.46
441 0.48
442 0.54
443 0.53
444 0.54
445 0.54
446 0.59
447 0.64
448 0.57
449 0.54
450 0.54
451 0.52
452 0.47
453 0.39
454 0.34
455 0.29
456 0.31
457 0.31
458 0.31
459 0.38
460 0.43
461 0.51
462 0.55
463 0.6
464 0.63
465 0.7