Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YHF7

Protein Details
Accession C7YHF7    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-265ALSAEEQKKKKKKSYGTKGPNPLAVQKSKKKQEGQSRKPAGSHydrophilic
267-294KKEDTQEAPAKRKRRRKNKAATSTAGEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-205RAELKNGLGKRKR
230-286QKKKKKKSYGTKGPNPLAVQKSKKKQEGQSRKPAGSEKKEDTQEAPAKRKRRRKNKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 13, mito 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG nhe:NECHADRAFT_74956  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRSKQYRKLMEQFSMTFGFREPYQVLVDAEMVQDSSRFKMDLEPALSRTVHGKVKPSTSATKATPERVLTTPVITQCEIRKLYAKRTEPGVSAAIDLAKTLERRRCGHHPDEYPEPLSTQECLRSVVDPKSTNQNKHRYVVASQDQEVRRMLRGIRGVPLIYIKRSVMILEPMADESVQVRAREERSKFRAELKNGLGKRKREDEDSDDEKDKAKAGDGEALSAEEQKKKKKKSYGTKGPNPLAVQKSKKKQEGQSRKPAGSEKKEDTQEAPAKRKRRRKNKAATSTAGEGEAKAEPVEATGEAES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.66
3 0.59
4 0.52
5 0.42
6 0.33
7 0.27
8 0.24
9 0.18
10 0.22
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.19
18 0.15
19 0.15
20 0.12
21 0.1
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.17
30 0.21
31 0.26
32 0.29
33 0.3
34 0.3
35 0.33
36 0.33
37 0.28
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.31
43 0.33
44 0.37
45 0.41
46 0.43
47 0.43
48 0.41
49 0.45
50 0.39
51 0.44
52 0.43
53 0.42
54 0.42
55 0.38
56 0.38
57 0.34
58 0.36
59 0.28
60 0.26
61 0.26
62 0.24
63 0.25
64 0.22
65 0.23
66 0.21
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.3
71 0.3
72 0.39
73 0.46
74 0.47
75 0.43
76 0.47
77 0.48
78 0.41
79 0.41
80 0.34
81 0.25
82 0.21
83 0.19
84 0.14
85 0.11
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.14
91 0.18
92 0.23
93 0.25
94 0.32
95 0.39
96 0.45
97 0.49
98 0.52
99 0.53
100 0.53
101 0.56
102 0.52
103 0.46
104 0.39
105 0.33
106 0.26
107 0.22
108 0.18
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.19
117 0.23
118 0.22
119 0.22
120 0.31
121 0.35
122 0.4
123 0.45
124 0.51
125 0.49
126 0.5
127 0.51
128 0.42
129 0.39
130 0.39
131 0.38
132 0.3
133 0.28
134 0.33
135 0.31
136 0.3
137 0.3
138 0.23
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.14
143 0.17
144 0.16
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.19
150 0.16
151 0.14
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.14
172 0.18
173 0.25
174 0.28
175 0.32
176 0.35
177 0.4
178 0.4
179 0.46
180 0.51
181 0.47
182 0.51
183 0.47
184 0.5
185 0.48
186 0.56
187 0.53
188 0.49
189 0.51
190 0.52
191 0.5
192 0.46
193 0.49
194 0.46
195 0.49
196 0.5
197 0.49
198 0.43
199 0.41
200 0.38
201 0.33
202 0.28
203 0.2
204 0.17
205 0.15
206 0.14
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.22
217 0.31
218 0.4
219 0.47
220 0.55
221 0.62
222 0.71
223 0.76
224 0.83
225 0.85
226 0.87
227 0.88
228 0.89
229 0.82
230 0.77
231 0.67
232 0.63
233 0.57
234 0.55
235 0.54
236 0.54
237 0.61
238 0.65
239 0.7
240 0.71
241 0.74
242 0.78
243 0.81
244 0.81
245 0.82
246 0.81
247 0.75
248 0.7
249 0.7
250 0.68
251 0.66
252 0.64
253 0.59
254 0.59
255 0.61
256 0.6
257 0.54
258 0.54
259 0.53
260 0.52
261 0.56
262 0.55
263 0.61
264 0.69
265 0.77
266 0.78
267 0.82
268 0.86
269 0.87
270 0.91
271 0.93
272 0.94
273 0.92
274 0.86
275 0.81
276 0.74
277 0.64
278 0.54
279 0.43
280 0.32
281 0.26
282 0.22
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.09