Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7TD20

Protein Details
Accession A0A1B7TD20    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MFQKKKVNKLKLTNSSHNKEVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MFQKKKVNKLKLTNSSHNKEVTSNKNIHETQKRKLELSLNKTDSLTKNTDINNDKDSLVNKSDNEKKIYMDYEPLLCKEFKLKGYCGYGDTCKFIHSRDDYINDKKLVRKHWKKSLEDKAENYDDKELKDDIDSVSISDNCLLCDNPFETIKDQKFVQLQCKHVFCKKCFLNSLKNENQNCKKCGIDSKGIMKPFKFIKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.81
3 0.76
4 0.68
5 0.59
6 0.53
7 0.53
8 0.5
9 0.48
10 0.47
11 0.44
12 0.5
13 0.51
14 0.54
15 0.56
16 0.53
17 0.54
18 0.59
19 0.6
20 0.53
21 0.55
22 0.56
23 0.54
24 0.57
25 0.59
26 0.52
27 0.51
28 0.5
29 0.51
30 0.45
31 0.41
32 0.36
33 0.28
34 0.3
35 0.3
36 0.37
37 0.36
38 0.36
39 0.33
40 0.31
41 0.3
42 0.27
43 0.28
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.21
48 0.27
49 0.34
50 0.35
51 0.38
52 0.35
53 0.33
54 0.33
55 0.34
56 0.27
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.18
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.2
68 0.23
69 0.23
70 0.26
71 0.29
72 0.29
73 0.26
74 0.25
75 0.24
76 0.21
77 0.22
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.18
83 0.17
84 0.19
85 0.19
86 0.24
87 0.26
88 0.3
89 0.32
90 0.29
91 0.28
92 0.29
93 0.31
94 0.35
95 0.42
96 0.48
97 0.53
98 0.61
99 0.68
100 0.7
101 0.75
102 0.77
103 0.76
104 0.7
105 0.65
106 0.6
107 0.57
108 0.52
109 0.43
110 0.38
111 0.29
112 0.25
113 0.25
114 0.2
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.26
141 0.27
142 0.32
143 0.34
144 0.4
145 0.38
146 0.42
147 0.46
148 0.5
149 0.51
150 0.52
151 0.57
152 0.49
153 0.54
154 0.53
155 0.53
156 0.57
157 0.58
158 0.61
159 0.62
160 0.69
161 0.68
162 0.72
163 0.7
164 0.73
165 0.77
166 0.74
167 0.68
168 0.62
169 0.55
170 0.5
171 0.55
172 0.51
173 0.5
174 0.49
175 0.56
176 0.59
177 0.63
178 0.62
179 0.53
180 0.52