FuNGI

A0A1B7TCY8

Protein Details

Accession

A0A1B7TCY8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
165-199	KQEEFEKRKKKLQQQYKKNRKKQFKQRIFIEKDGR	Basic
280-301	LKVSKDKQSKDKKEPTRNIRMP	Hydrophilic
519-542	AKGKTFRQTKFKLRAPKHKYTTIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-190	FEKRKKKLQQQYKKNRKKQFKQ

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002675 Ribosomal_L38e IPR038464 Ribosomal_L38e_sf IPR003196 TFIIF_beta IPR040450 TFIIF_beta_HTH IPR040504 TFIIF_beta_N IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01781 Ribosomal_L38e PF02270 TFIIF_beta PF17683 TFIIF_beta_N
CDD	cd07980 TFIIF_beta

Amino Acid Sequences

MSDFKEGFNKFTKPRNDDYEEDNIDDHILKEDDDIIDGNDIENNEDKIYEESLDLDMASVEKKVWLVRLPLFLAQKWRDEQTLKGQDLGKIRIHKKTQKIQLILNEDVEGLEDMPHSYEIDLTQKYVENEYIFTEQNLKKYEQRAQQLEQNPELQKQLYILKKEKQEEFEKRKKKLQQQYKKNRKKQFKQRIFIEKDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVAHECQVVPSIKDPNYNKIIEQRKQMIKFQHKRSITVLDEGVGKTLGRAAGLSLLGDNSNFLKVSKDKQSKDKKEPTRNIRMPKKELLNLLFKLFDEYNYWSLKGLKERTKQPEVYLKECLDHVALLIKKGPYALKYTLKSEYKKLQQNERIQKLGTITNDSDSASQEPVSQTPQATLGTTTTVNNNLTADDQIANNNQIKTAEDIEKEKHDQQVRLQRMQQRAQETGHVPSLNNNADDYFDEDIEMEDIIFIKNIKSKPSTPITYTMAQQIELKEFLELVKKEYATKAQITIKTNLKVNAKGKTFRQTKFKLRAPKHKYTTIVDSATRAKQVKQVLTDKNVVEIK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.66
4	0.63
5	0.63
6	0.64
7	0.56
8	0.51
9	0.44
10	0.35
11	0.3
12	0.28
13	0.22
14	0.16
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.16
19	0.14
20	0.15
21	0.15
22	0.12
23	0.13
24	0.12
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.12
29	0.14
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.15
34	0.15
35	0.16
36	0.15
37	0.12
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.1
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.07
47	0.06
48	0.07
49	0.09
50	0.1
51	0.14
52	0.17
53	0.22
54	0.26
55	0.3
56	0.31
57	0.35
58	0.37
59	0.35
60	0.4
61	0.38
62	0.39
63	0.37
64	0.38
65	0.37
66	0.36
67	0.38
68	0.4
69	0.47
70	0.42
71	0.44
72	0.43
73	0.43
74	0.46
75	0.47
76	0.41
77	0.41
78	0.45
79	0.49
80	0.56
81	0.6
82	0.64
83	0.69
84	0.74
85	0.73
86	0.73
87	0.7
88	0.69
89	0.67
90	0.59
91	0.5
92	0.4
93	0.31
94	0.27
95	0.23
96	0.15
97	0.09
98	0.07
99	0.07
100	0.06
101	0.07
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.08
106	0.08
107	0.13
108	0.14
109	0.13
110	0.14
111	0.17
112	0.18
113	0.19
114	0.2
115	0.16
116	0.16
117	0.19
118	0.2
119	0.18
120	0.17
121	0.24
122	0.23
123	0.27
124	0.3
125	0.3
126	0.32
127	0.37
128	0.44
129	0.43
130	0.5
131	0.5
132	0.5
133	0.56
134	0.58
135	0.57
136	0.51
137	0.5
138	0.43
139	0.39
140	0.37
141	0.3
142	0.23
143	0.2
144	0.25
145	0.24
146	0.29
147	0.33
148	0.37
149	0.44
150	0.49
151	0.51
152	0.5
153	0.54
154	0.58
155	0.63
156	0.67
157	0.69
158	0.69
159	0.73
160	0.76
161	0.76
162	0.76
163	0.78
164	0.78
165	0.81
166	0.88
167	0.91
168	0.93
169	0.93
170	0.92
171	0.92
172	0.91
173	0.91
174	0.92
175	0.91
176	0.88
177	0.88
178	0.89
179	0.84
180	0.8
181	0.78
182	0.7
183	0.68
184	0.63
185	0.56
186	0.46
187	0.41
188	0.38
189	0.38
190	0.34
191	0.29
192	0.34
193	0.38
194	0.45
195	0.47
196	0.45
197	0.41
198	0.42
199	0.4
200	0.36
201	0.32
202	0.25
203	0.23
204	0.22
205	0.21
206	0.2
207	0.18
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.14
212	0.12
213	0.09
214	0.12
215	0.17
216	0.18
217	0.25
218	0.27
219	0.28
220	0.32
221	0.32
222	0.31
223	0.34
224	0.41
225	0.38
226	0.42
227	0.44
228	0.46
229	0.48
230	0.52
231	0.52
232	0.55
233	0.61
234	0.63
235	0.64
236	0.58
237	0.58
238	0.56
239	0.53
240	0.43
241	0.37
242	0.29
243	0.21
244	0.22
245	0.19
246	0.17
247	0.1
248	0.09
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.07
268	0.09
269	0.14
270	0.23
271	0.3
272	0.32
273	0.42
274	0.53
275	0.59
276	0.68
277	0.73
278	0.73
279	0.76
280	0.83
281	0.81
282	0.82
283	0.79
284	0.79
285	0.78
286	0.75
287	0.69
288	0.66
289	0.62
290	0.54
291	0.51
292	0.45
293	0.42
294	0.36
295	0.32
296	0.27
297	0.22
298	0.22
299	0.18
300	0.16
301	0.12
302	0.14
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.15
307	0.17
308	0.18
309	0.22
310	0.26
311	0.31
312	0.36
313	0.44
314	0.51
315	0.56
316	0.55
317	0.52
318	0.54
319	0.5
320	0.47
321	0.44
322	0.37
323	0.31
324	0.3
325	0.27
326	0.18
327	0.14
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.15
336	0.16
337	0.12
338	0.16
339	0.21
340	0.25
341	0.27
342	0.3
343	0.36
344	0.4
345	0.41
346	0.42
347	0.45
348	0.46
349	0.52
350	0.54
351	0.57
352	0.6
353	0.68
354	0.73
355	0.69
356	0.63
357	0.56
358	0.52
359	0.45
360	0.4
361	0.31
362	0.25
363	0.21
364	0.2
365	0.2
366	0.19
367	0.18
368	0.15
369	0.15
370	0.12
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.13
375	0.15
376	0.14
377	0.13
378	0.13
379	0.15
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.14
389	0.14
390	0.14
391	0.14
392	0.12
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.13
400	0.15
401	0.18
402	0.18
403	0.17
404	0.16
405	0.17
406	0.18
407	0.2
408	0.21
409	0.2
410	0.23
411	0.25
412	0.29
413	0.32
414	0.32
415	0.35
416	0.36
417	0.37
418	0.43
419	0.5
420	0.52
421	0.53
422	0.57
423	0.57
424	0.59
425	0.63
426	0.61
427	0.55
428	0.52
429	0.48
430	0.47
431	0.43
432	0.38
433	0.36
434	0.31
435	0.26
436	0.27
437	0.32
438	0.29
439	0.27
440	0.24
441	0.2
442	0.21
443	0.22
444	0.21
445	0.16
446	0.13
447	0.13
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.1
452	0.07
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.08
459	0.14
460	0.16
461	0.21
462	0.25
463	0.28
464	0.35
465	0.43
466	0.46
467	0.43
468	0.48
469	0.48
470	0.45
471	0.44
472	0.43
473	0.35
474	0.31
475	0.31
476	0.27
477	0.25
478	0.23
479	0.22
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.2
484	0.19
485	0.19
486	0.24
487	0.24
488	0.26
489	0.3
490	0.34
491	0.31
492	0.33
493	0.36
494	0.39
495	0.44
496	0.47
497	0.5
498	0.51
499	0.51
500	0.53
501	0.52
502	0.5
503	0.52
504	0.53
505	0.55
506	0.54
507	0.55
508	0.56
509	0.6
510	0.63
511	0.61
512	0.66
513	0.66
514	0.71
515	0.75
516	0.78
517	0.78
518	0.8
519	0.85
520	0.84
521	0.86
522	0.83
523	0.8
524	0.78
525	0.73
526	0.71
527	0.67
528	0.62
529	0.53
530	0.49
531	0.48
532	0.46
533	0.46
534	0.4
535	0.35
536	0.37
537	0.44
538	0.46
539	0.48
540	0.54
541	0.55
542	0.59
543	0.63
544	0.58

A0A1B7TCY8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer