Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8D6I1

Protein Details
Accession A0A1B8D6I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-146LEPVGRKVKQNTKRKIKKEVEQDTKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-138KKGGGLEPVGRKVKQNTKRKIKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009083  TFIIA_a-hlx  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
IPR003194  TFIIA_gsu  
IPR015871  TFIIA_gsu_C  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02751  TFIIA_gamma_C  
Amino Acid Sequences MASSNVESSAYFHTSICKTLCDTIDDLICAGRIEPHLGAKILKNFVPSVKKAFAEHVREVVNMKGRLQYYRNFENKWWWVVRDCTVKLRTGVDVEMMYVDKLRIVGYPPGDEPNGKKGGGLEPVGRKVKQNTKRKIKKEVEQDTKQDTTQDVKQDIKQETE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.24
4 0.21
5 0.21
6 0.26
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.19
14 0.15
15 0.14
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.15
24 0.15
25 0.17
26 0.18
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.26
33 0.3
34 0.28
35 0.28
36 0.29
37 0.29
38 0.28
39 0.34
40 0.36
41 0.36
42 0.36
43 0.33
44 0.31
45 0.3
46 0.31
47 0.27
48 0.27
49 0.21
50 0.21
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.25
55 0.27
56 0.26
57 0.34
58 0.37
59 0.34
60 0.34
61 0.39
62 0.39
63 0.38
64 0.33
65 0.26
66 0.24
67 0.25
68 0.28
69 0.26
70 0.25
71 0.27
72 0.27
73 0.27
74 0.26
75 0.26
76 0.22
77 0.18
78 0.17
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.22
106 0.25
107 0.24
108 0.23
109 0.25
110 0.32
111 0.36
112 0.35
113 0.35
114 0.39
115 0.47
116 0.52
117 0.58
118 0.62
119 0.7
120 0.79
121 0.83
122 0.86
123 0.84
124 0.83
125 0.84
126 0.84
127 0.83
128 0.79
129 0.78
130 0.73
131 0.67
132 0.59
133 0.5
134 0.41
135 0.36
136 0.35
137 0.36
138 0.33
139 0.35
140 0.38
141 0.44