Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8DBJ3

Protein Details
Accession A0A1B8DBJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
418-439TPSKNGRYSNGRRRRGRGRAVTHydrophilic
555-579RAPAAKGRARSRSRSPERNREEEMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-435GRRRRGRG
548-572PPPKKGGRAPAAKGRARSRSRSPER
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.5, nucl 6, mito 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
IPR033744  RRM_RBM8  
IPR005097  Sacchrp_dh_NADP  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0016491  F:oxidoreductase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03435  Sacchrp_dh_NADP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12324  RRM_RBM8  
Amino Acid Sequences MTTEQSPQYEVVLFGATGYTGKLCAEHIHAKLPSDLRWAIAGRSRAKLEALRKELQSKDSSRALPAIEVCGLEADQLELLARKTKVIIATVGPYQDFGEPMLAACAKNGTHYLDCTGETPWILDMIKKYHETAQKTGAIIIPSCGFDSVPADISAFTVVNYIRTKLSSPTARVDYSVHEIKGGISGGTVNSAIRMFDQYSLSQLLKLLAPFSLSPRHPKRSHPQKRLSLLSQIFGLRKMPRLGWMGVNPQGLVDKCYINRSWGLAADSETETYGENFDYHAWMRVPGPVSAVIWHFTMLTAMFLFCIPPFRWLIKKIAFKQGDGPSLGFREKCSFVVRTSAIADNTKGQQVIANLTVGIDPYTFTGVCLGEAALLLSRDTSIQTRLKGGILTTSMMGRTFLESLERNGAKMEANYSTTPSKNGRYSNGRRRRGRGRAVTDTAAASEEPKNASMQTLTNATAVRSIEGWIIIVSNVHEEANEEDITDKFADFGEIKNLHLNLDRRTGYVKGYALIEYPTRDEARAAINGANGTKLLDQTVTVDFVFVRPPPKKGGRAPAAKGRARSRSRSPERNREEEMAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.11
12 0.18
13 0.24
14 0.26
15 0.33
16 0.34
17 0.35
18 0.4
19 0.4
20 0.35
21 0.35
22 0.33
23 0.27
24 0.29
25 0.29
26 0.26
27 0.3
28 0.35
29 0.32
30 0.37
31 0.38
32 0.35
33 0.37
34 0.41
35 0.44
36 0.47
37 0.49
38 0.5
39 0.51
40 0.57
41 0.57
42 0.55
43 0.54
44 0.47
45 0.47
46 0.48
47 0.47
48 0.42
49 0.41
50 0.36
51 0.32
52 0.29
53 0.26
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.15
58 0.14
59 0.11
60 0.1
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.18
72 0.2
73 0.2
74 0.22
75 0.18
76 0.21
77 0.22
78 0.23
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.2
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.18
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.16
113 0.19
114 0.2
115 0.22
116 0.27
117 0.33
118 0.36
119 0.37
120 0.4
121 0.4
122 0.39
123 0.38
124 0.34
125 0.29
126 0.24
127 0.21
128 0.16
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.24
154 0.25
155 0.27
156 0.32
157 0.34
158 0.34
159 0.33
160 0.32
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.23
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.17
170 0.1
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.08
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.16
200 0.16
201 0.26
202 0.32
203 0.41
204 0.42
205 0.49
206 0.57
207 0.62
208 0.72
209 0.73
210 0.76
211 0.76
212 0.79
213 0.78
214 0.69
215 0.66
216 0.56
217 0.46
218 0.38
219 0.32
220 0.26
221 0.22
222 0.23
223 0.16
224 0.18
225 0.19
226 0.17
227 0.19
228 0.22
229 0.23
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.26
234 0.26
235 0.21
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.17
299 0.19
300 0.25
301 0.29
302 0.36
303 0.38
304 0.46
305 0.45
306 0.42
307 0.48
308 0.46
309 0.41
310 0.34
311 0.31
312 0.22
313 0.23
314 0.24
315 0.16
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.22
324 0.22
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.12
369 0.15
370 0.16
371 0.18
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.21
392 0.21
393 0.19
394 0.19
395 0.2
396 0.18
397 0.17
398 0.18
399 0.12
400 0.15
401 0.15
402 0.18
403 0.2
404 0.2
405 0.23
406 0.24
407 0.28
408 0.3
409 0.33
410 0.37
411 0.44
412 0.53
413 0.61
414 0.68
415 0.72
416 0.74
417 0.78
418 0.82
419 0.81
420 0.81
421 0.8
422 0.77
423 0.76
424 0.74
425 0.67
426 0.58
427 0.49
428 0.39
429 0.3
430 0.21
431 0.16
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.15
443 0.15
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.17
448 0.16
449 0.15
450 0.12
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.1
466 0.13
467 0.12
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.14
472 0.14
473 0.12
474 0.09
475 0.09
476 0.12
477 0.11
478 0.12
479 0.18
480 0.19
481 0.2
482 0.24
483 0.24
484 0.23
485 0.29
486 0.32
487 0.27
488 0.34
489 0.34
490 0.3
491 0.33
492 0.33
493 0.29
494 0.31
495 0.28
496 0.22
497 0.23
498 0.22
499 0.2
500 0.21
501 0.2
502 0.17
503 0.18
504 0.21
505 0.21
506 0.21
507 0.2
508 0.2
509 0.22
510 0.22
511 0.22
512 0.19
513 0.2
514 0.21
515 0.21
516 0.19
517 0.15
518 0.15
519 0.14
520 0.13
521 0.12
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.15
526 0.15
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.22
534 0.23
535 0.26
536 0.35
537 0.43
538 0.5
539 0.55
540 0.64
541 0.65
542 0.71
543 0.75
544 0.76
545 0.77
546 0.74
547 0.73
548 0.71
549 0.71
550 0.69
551 0.7
552 0.71
553 0.73
554 0.78
555 0.82
556 0.83
557 0.84
558 0.86
559 0.86
560 0.81