Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8D5L3

Protein Details
Accession A0A1B8D5L3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
764-791SQHLREPRVAVRRKKKRRVVNVIETSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-577KERKK
772-782RVAVRRKKKRR
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014144  LigD_PE_domain  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR024088  Tyr-tRNA-ligase_bac-type  
IPR032005  TyrRSs_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PF16714  TyrRSs_C  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MASSSLLRSASQHRFCQCARTAARSTRPRGAPDRRYIGMKYLAKVADAEKAWAEKAKDIRGGNQKSMLSILEERGLVHQTTGNRDTIDNLMIDKRVGAYVGIDPTASSLHVGHLLPLMSLFWMYLHGYHSVSLLGGATAKIGDPTGRLTTRTKEHSAVRTANMVNMHYQLKKLWVNVEQYGRQLGYNWEWAWHRELVNNNTWTNKLTVIELLQIIGPGMRLGTMLARDTVKNKLSKGDGMSYAEFSYPVLQAWDWWHMYNTKDIQMQIGGADQYGNIVAGLNAVKYISSNHPDPDVRQGKDADIAQPFGFTVPLLTTAAGDKFGKSAGNAVWLDKELTSTFELYGFWMRQSDADMPRYLRYFTFLPSPEIDALVEEHNQAPHERKAQHVLARNFVELIHGPAEAKAAEANHRLLFGKPSLSSLMETPKDNTTAELEKKGPTPITLNNAPSINITLPRSVLTKSIGKIVYAAGLAESASEGHRLVSNGSLYISGPSSQKKQAMDEAELKFTQIKNWLIADTKKFLVGDEMLVLRRGKHNIRIVKIVEDNEWAEGGKKYPGEGXTAELGAKDAGKERKKKSFWSEFAPEVDPNERKSVLYKPAPSGQRKTIIRRSPTKPYDEKEEGSSLEFFGGYILVSLRHVIVATGRNVDHQISFSATSSLSWAIPFGVPGDPNSKRRLRLATETRVHTVDGPERDPGSAEGSQSSGLGVVENGEMAEENRDTGDGLSENSKLVESFGRRKIRIRLHGARLPEGYTLDMFVAPGSQHLREPRVAVRRKKKRRVVNVIETSSEGEENDPAIPIADAVAAEWALEWERKEVEKREVRRVNAYLGAENTIGSLYQRKWFLCLDREGSGFCKADRDGVWERRKGEGGVLEGFEPFYVRGVEEERSVVTGMKAEHVMRDAGIVGFVRRKGWRAILD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.57
4 0.52
5 0.52
6 0.5
7 0.51
8 0.56
9 0.58
10 0.67
11 0.68
12 0.7
13 0.69
14 0.7
15 0.69
16 0.72
17 0.74
18 0.73
19 0.73
20 0.74
21 0.68
22 0.67
23 0.62
24 0.58
25 0.57
26 0.51
27 0.44
28 0.44
29 0.41
30 0.37
31 0.37
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.26
36 0.21
37 0.22
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.25
42 0.3
43 0.34
44 0.39
45 0.39
46 0.46
47 0.52
48 0.56
49 0.54
50 0.54
51 0.49
52 0.43
53 0.43
54 0.35
55 0.29
56 0.26
57 0.23
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.2
62 0.22
63 0.18
64 0.16
65 0.18
66 0.18
67 0.26
68 0.28
69 0.27
70 0.26
71 0.26
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.13
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.11
132 0.17
133 0.18
134 0.21
135 0.24
136 0.29
137 0.36
138 0.41
139 0.42
140 0.41
141 0.46
142 0.5
143 0.54
144 0.52
145 0.47
146 0.47
147 0.43
148 0.41
149 0.36
150 0.3
151 0.25
152 0.24
153 0.26
154 0.21
155 0.21
156 0.19
157 0.24
158 0.26
159 0.26
160 0.28
161 0.29
162 0.33
163 0.37
164 0.42
165 0.37
166 0.36
167 0.37
168 0.32
169 0.27
170 0.24
171 0.22
172 0.19
173 0.23
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.28
179 0.27
180 0.25
181 0.24
182 0.32
183 0.33
184 0.39
185 0.41
186 0.39
187 0.37
188 0.37
189 0.34
190 0.28
191 0.25
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.21
217 0.24
218 0.26
219 0.26
220 0.29
221 0.3
222 0.33
223 0.34
224 0.32
225 0.3
226 0.31
227 0.31
228 0.27
229 0.25
230 0.21
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.2
254 0.14
255 0.14
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.08
274 0.12
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.22
279 0.23
280 0.24
281 0.32
282 0.34
283 0.32
284 0.33
285 0.33
286 0.29
287 0.32
288 0.32
289 0.25
290 0.2
291 0.2
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.12
296 0.11
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.09
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.13
322 0.14
323 0.08
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.17
339 0.18
340 0.2
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.25
345 0.23
346 0.17
347 0.17
348 0.15
349 0.15
350 0.2
351 0.19
352 0.21
353 0.21
354 0.23
355 0.19
356 0.19
357 0.17
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.13
368 0.15
369 0.2
370 0.2
371 0.22
372 0.27
373 0.31
374 0.35
375 0.4
376 0.38
377 0.38
378 0.38
379 0.36
380 0.31
381 0.26
382 0.22
383 0.14
384 0.14
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.08
395 0.1
396 0.12
397 0.11
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.12
403 0.13
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.17
414 0.17
415 0.18
416 0.17
417 0.16
418 0.14
419 0.17
420 0.18
421 0.19
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.21
426 0.18
427 0.14
428 0.16
429 0.15
430 0.2
431 0.22
432 0.21
433 0.22
434 0.22
435 0.21
436 0.18
437 0.17
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.14
450 0.19
451 0.18
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.14
456 0.11
457 0.1
458 0.05
459 0.05
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.09
481 0.1
482 0.13
483 0.16
484 0.19
485 0.19
486 0.21
487 0.24
488 0.26
489 0.27
490 0.31
491 0.29
492 0.28
493 0.27
494 0.26
495 0.23
496 0.2
497 0.19
498 0.17
499 0.17
500 0.16
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.2
505 0.21
506 0.19
507 0.18
508 0.17
509 0.17
510 0.15
511 0.15
512 0.13
513 0.1
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.12
521 0.16
522 0.17
523 0.23
524 0.31
525 0.35
526 0.37
527 0.41
528 0.4
529 0.39
530 0.4
531 0.34
532 0.27
533 0.23
534 0.21
535 0.16
536 0.15
537 0.11
538 0.1
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.13
547 0.13
548 0.14
549 0.15
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.14
554 0.11
555 0.11
556 0.14
557 0.18
558 0.24
559 0.33
560 0.38
561 0.47
562 0.5
563 0.57
564 0.61
565 0.64
566 0.6
567 0.6
568 0.59
569 0.52
570 0.52
571 0.47
572 0.37
573 0.29
574 0.31
575 0.25
576 0.22
577 0.23
578 0.21
579 0.19
580 0.21
581 0.25
582 0.27
583 0.31
584 0.32
585 0.33
586 0.4
587 0.47
588 0.49
589 0.49
590 0.45
591 0.48
592 0.49
593 0.54
594 0.56
595 0.57
596 0.59
597 0.62
598 0.63
599 0.65
600 0.66
601 0.66
602 0.62
603 0.58
604 0.6
605 0.55
606 0.51
607 0.44
608 0.41
609 0.34
610 0.3
611 0.27
612 0.18
613 0.14
614 0.12
615 0.09
616 0.07
617 0.06
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.08
629 0.11
630 0.13
631 0.15
632 0.15
633 0.16
634 0.17
635 0.18
636 0.15
637 0.13
638 0.12
639 0.12
640 0.13
641 0.12
642 0.12
643 0.11
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.09
655 0.09
656 0.11
657 0.18
658 0.21
659 0.24
660 0.31
661 0.34
662 0.35
663 0.39
664 0.45
665 0.43
666 0.49
667 0.55
668 0.58
669 0.6
670 0.61
671 0.58
672 0.52
673 0.47
674 0.39
675 0.34
676 0.3
677 0.27
678 0.25
679 0.25
680 0.24
681 0.24
682 0.23
683 0.2
684 0.19
685 0.17
686 0.16
687 0.14
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.12
692 0.08
693 0.06
694 0.06
695 0.05
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.04
701 0.05
702 0.05
703 0.08
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.09
711 0.08
712 0.09
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.09
719 0.1
720 0.15
721 0.18
722 0.26
723 0.34
724 0.42
725 0.44
726 0.49
727 0.57
728 0.61
729 0.65
730 0.67
731 0.67
732 0.68
733 0.7
734 0.68
735 0.63
736 0.54
737 0.46
738 0.38
739 0.29
740 0.22
741 0.18
742 0.16
743 0.12
744 0.11
745 0.09
746 0.08
747 0.08
748 0.07
749 0.09
750 0.11
751 0.12
752 0.15
753 0.19
754 0.23
755 0.24
756 0.27
757 0.32
758 0.4
759 0.48
760 0.55
761 0.62
762 0.7
763 0.79
764 0.87
765 0.88
766 0.89
767 0.91
768 0.92
769 0.91
770 0.91
771 0.89
772 0.81
773 0.73
774 0.63
775 0.54
776 0.44
777 0.34
778 0.23
779 0.14
780 0.12
781 0.12
782 0.11
783 0.1
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.07
788 0.07
789 0.06
790 0.05
791 0.05
792 0.06
793 0.05
794 0.05
795 0.05
796 0.06
797 0.07
798 0.09
799 0.1
800 0.11
801 0.14
802 0.18
803 0.24
804 0.29
805 0.37
806 0.45
807 0.5
808 0.59
809 0.63
810 0.64
811 0.66
812 0.63
813 0.57
814 0.54
815 0.51
816 0.43
817 0.37
818 0.35
819 0.27
820 0.24
821 0.2
822 0.14
823 0.12
824 0.1
825 0.14
826 0.14
827 0.19
828 0.24
829 0.24
830 0.27
831 0.32
832 0.37
833 0.38
834 0.42
835 0.41
836 0.4
837 0.41
838 0.4
839 0.38
840 0.37
841 0.31
842 0.25
843 0.26
844 0.22
845 0.27
846 0.26
847 0.31
848 0.34
849 0.43
850 0.51
851 0.52
852 0.54
853 0.53
854 0.55
855 0.48
856 0.44
857 0.39
858 0.34
859 0.32
860 0.31
861 0.27
862 0.24
863 0.23
864 0.18
865 0.15
866 0.11
867 0.09
868 0.09
869 0.09
870 0.11
871 0.14
872 0.16
873 0.16
874 0.18
875 0.17
876 0.17
877 0.18
878 0.16
879 0.14
880 0.16
881 0.15
882 0.16
883 0.19
884 0.18
885 0.2
886 0.21
887 0.21
888 0.17
889 0.18
890 0.16
891 0.13
892 0.14
893 0.12
894 0.13
895 0.18
896 0.19
897 0.23
898 0.24
899 0.28
900 0.31