FuNGI

A0A1B8CXP3

Protein Details

Accession

A0A1B8CXP3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-72	TEEGRKKAARRERAEAQRPV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
58-63	KKAARR

Subcellular Location(s)

cyto 12, mito 10, cyto_nucl 9, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007646 RNA_pol_Rpb2_4 IPR007647 RNA_pol_Rpb2_5
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF04566 RNA_pol_Rpb2_4 PF04567 RNA_pol_Rpb2_5

Amino Acid Sequences

MPPRKRAAAAPPAAPAVPPAPEVRDAAPRKESWGGGLMDEQVEKIREEFDLSTEEGRKKAARRERAEAQRPVGNDGFEALLEPFYGGKSLTDPIDTAKDKWNLLPAFLKVKGLVKQHIDSFNYFVDHEIKDILKANKFVRSDVDNTFWLEYTDIRVGAPERLDYDDRKPLNDVTPNECRLRDLTYAAPIFVDIKYVRGKRIVARRGIPIGRMPIMLKSSKCRLTGRNDGQLAYMNECALDPGGYFIVNGTEKVILVQEQLSKNRVIVETDAKKSMVSASVTSSTHERKSKSYVVLKKERIYLQHNVLTEAVPIVIALKAMGVQSDHEMLLLVAGTDATYQDDFAVNFEEAAKLGIFSQQQALEWIGGRVKMGKSRFGQPQRRNFAQDGLEALANIVITHVPVVGLDFRPKALYVCFMVRRVLMAMHDPKLVDDRDYVGNKRLELAGQLLSLLFEDLFKKFNSDLKMNIDKVLKKPNRTNEFDAYQHMQSHGNYITQGMNRAISTGNWSLKRFKMERAGVTHVLSRLSYIAALGMMTRISSQFEKTRKVSGPRALQPSQFGMLCPSDTPEGEACGLVKNLALMTHITTNDDEEPVRKLVFVLGAEDIVSMSGKEIYDDGAYVIFINGTPLALTRKPKAFLAGFKTFRRTGRVSEFVSCYINHHTSSVHIATDEGRICRPLIIVTNGVPRIKDHHLAALRDGSMEFDDFLYRGLVEYIDCNEENDAMIALYENAITPATTHLEIEPFTILGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.3
3	0.22
4	0.18
5	0.18
6	0.17
7	0.18
8	0.2
9	0.23
10	0.23
11	0.31
12	0.34
13	0.38
14	0.41
15	0.39
16	0.41
17	0.44
18	0.41
19	0.34
20	0.37
21	0.32
22	0.27
23	0.28
24	0.25
25	0.21
26	0.21
27	0.19
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.13
34	0.16
35	0.16
36	0.15
37	0.17
38	0.18
39	0.22
40	0.27
41	0.29
42	0.26
43	0.29
44	0.33
45	0.35
46	0.44
47	0.49
48	0.53
49	0.58
50	0.65
51	0.72
52	0.78
53	0.81
54	0.78
55	0.73
56	0.66
57	0.6
58	0.58
59	0.5
60	0.39
61	0.3
62	0.24
63	0.2
64	0.16
65	0.16
66	0.1
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.07
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.13
80	0.15
81	0.23
82	0.24
83	0.25
84	0.3
85	0.33
86	0.33
87	0.35
88	0.41
89	0.33
90	0.34
91	0.36
92	0.31
93	0.33
94	0.33
95	0.32
96	0.25
97	0.3
98	0.32
99	0.33
100	0.36
101	0.35
102	0.37
103	0.42
104	0.46
105	0.43
106	0.4
107	0.38
108	0.34
109	0.3
110	0.27
111	0.23
112	0.21
113	0.18
114	0.17
115	0.17
116	0.16
117	0.16
118	0.23
119	0.26
120	0.26
121	0.31
122	0.32
123	0.37
124	0.37
125	0.36
126	0.34
127	0.34
128	0.34
129	0.33
130	0.34
131	0.28
132	0.29
133	0.29
134	0.25
135	0.21
136	0.18
137	0.14
138	0.15
139	0.15
140	0.13
141	0.12
142	0.13
143	0.14
144	0.16
145	0.17
146	0.13
147	0.14
148	0.18
149	0.2
150	0.22
151	0.26
152	0.32
153	0.31
154	0.32
155	0.32
156	0.31
157	0.34
158	0.38
159	0.37
160	0.35
161	0.42
162	0.44
163	0.44
164	0.42
165	0.37
166	0.32
167	0.32
168	0.28
169	0.23
170	0.21
171	0.25
172	0.26
173	0.24
174	0.22
175	0.18
176	0.18
177	0.15
178	0.16
179	0.1
180	0.12
181	0.2
182	0.21
183	0.23
184	0.25
185	0.28
186	0.31
187	0.41
188	0.45
189	0.44
190	0.46
191	0.49
192	0.52
193	0.51
194	0.46
195	0.39
196	0.35
197	0.3
198	0.28
199	0.24
200	0.2
201	0.22
202	0.24
203	0.22
204	0.23
205	0.29
206	0.33
207	0.36
208	0.37
209	0.4
210	0.44
211	0.54
212	0.55
213	0.57
214	0.53
215	0.5
216	0.46
217	0.46
218	0.39
219	0.3
220	0.24
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.13
225	0.08
226	0.07
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.09
244	0.13
245	0.16
246	0.18
247	0.2
248	0.2
249	0.2
250	0.22
251	0.2
252	0.16
253	0.16
254	0.23
255	0.26
256	0.28
257	0.29
258	0.26
259	0.25
260	0.24
261	0.23
262	0.17
263	0.13
264	0.12
265	0.13
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.19
270	0.19
271	0.23
272	0.27
273	0.26
274	0.26
275	0.32
276	0.37
277	0.4
278	0.46
279	0.48
280	0.52
281	0.59
282	0.61
283	0.58
284	0.58
285	0.53
286	0.48
287	0.47
288	0.43
289	0.39
290	0.39
291	0.36
292	0.31
293	0.3
294	0.25
295	0.2
296	0.15
297	0.1
298	0.06
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.04
319	0.03
320	0.02
321	0.03
322	0.02
323	0.03
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.06
339	0.04
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.13
358	0.14
359	0.19
360	0.21
361	0.27
362	0.35
363	0.42
364	0.52
365	0.55
366	0.64
367	0.65
368	0.65
369	0.63
370	0.55
371	0.5
372	0.41
373	0.34
374	0.25
375	0.19
376	0.17
377	0.13
378	0.12
379	0.08
380	0.06
381	0.06
382	0.04
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.05
391	0.06
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.1
400	0.1
401	0.14
402	0.15
403	0.16
404	0.17
405	0.16
406	0.16
407	0.14
408	0.13
409	0.09
410	0.13
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.16
415	0.16
416	0.18
417	0.18
418	0.14
419	0.11
420	0.12
421	0.17
422	0.19
423	0.2
424	0.23
425	0.24
426	0.23
427	0.24
428	0.21
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.15
448	0.18
449	0.19
450	0.21
451	0.27
452	0.33
453	0.31
454	0.34
455	0.34
456	0.33
457	0.35
458	0.43
459	0.4
460	0.41
461	0.47
462	0.53
463	0.57
464	0.6
465	0.62
466	0.57
467	0.57
468	0.52
469	0.49
470	0.42
471	0.36
472	0.3
473	0.26
474	0.22
475	0.19
476	0.21
477	0.18
478	0.15
479	0.13
480	0.14
481	0.16
482	0.15
483	0.17
484	0.14
485	0.14
486	0.13
487	0.14
488	0.13
489	0.1
490	0.15
491	0.17
492	0.21
493	0.23
494	0.26
495	0.29
496	0.32
497	0.38
498	0.35
499	0.35
500	0.4
501	0.41
502	0.44
503	0.45
504	0.49
505	0.44
506	0.43
507	0.4
508	0.32
509	0.28
510	0.23
511	0.18
512	0.12
513	0.1
514	0.09
515	0.07
516	0.06
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.08
526	0.09
527	0.12
528	0.19
529	0.23
530	0.3
531	0.31
532	0.38
533	0.41
534	0.47
535	0.51
536	0.52
537	0.57
538	0.57
539	0.63
540	0.59
541	0.54
542	0.5
543	0.45
544	0.4
545	0.31
546	0.24
547	0.19
548	0.18
549	0.17
550	0.15
551	0.14
552	0.13
553	0.13
554	0.15
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.12
560	0.12
561	0.12
562	0.09
563	0.09
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.08
568	0.07
569	0.09
570	0.12
571	0.12
572	0.14
573	0.14
574	0.16
575	0.16
576	0.17
577	0.16
578	0.13
579	0.16
580	0.16
581	0.16
582	0.14
583	0.13
584	0.13
585	0.15
586	0.14
587	0.13
588	0.11
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.09
593	0.07
594	0.07
595	0.05
596	0.05
597	0.07
598	0.06
599	0.07
600	0.07
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.07
616	0.12
617	0.16
618	0.2
619	0.25
620	0.3
621	0.32
622	0.33
623	0.39
624	0.38
625	0.41
626	0.45
627	0.49
628	0.49
629	0.5
630	0.55
631	0.53
632	0.51
633	0.51
634	0.46
635	0.44
636	0.47
637	0.5
638	0.48
639	0.49
640	0.49
641	0.44
642	0.43
643	0.36
644	0.31
645	0.31
646	0.3
647	0.25
648	0.23
649	0.22
650	0.21
651	0.27
652	0.26
653	0.19
654	0.16
655	0.17
656	0.17
657	0.22
658	0.24
659	0.19
660	0.19
661	0.2
662	0.21
663	0.21
664	0.2
665	0.18
666	0.19
667	0.21
668	0.22
669	0.24
670	0.31
671	0.34
672	0.34
673	0.31
674	0.28
675	0.3
676	0.33
677	0.35
678	0.29
679	0.34
680	0.39
681	0.41
682	0.43
683	0.42
684	0.36
685	0.32
686	0.31
687	0.23
688	0.19
689	0.18
690	0.15
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.12
695	0.11
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.1
702	0.12
703	0.16
704	0.16
705	0.17
706	0.17
707	0.17
708	0.17
709	0.15
710	0.13
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.06
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.1
723	0.13
724	0.13
725	0.14
726	0.15
727	0.17
728	0.18
729	0.19
730	0.17

A0A1B8CXP3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer