Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8DFR2

Protein Details
Accession A0A1B8DFR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46SSRRNESSYRRMKKKLNVKPHydrophilic
179-201VKERWGPKRRMAREDRVKRREAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-198AVKERWGPKRRMAREDRVKRR
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.666, nucl 12, mito 12, cyto_nucl 8.166, cyto_mito 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024388  Ribosomal_L20_mt  
Pfam View protein in Pfam  
PF12824  MRP-L20  
Amino Acid Sequences MDLRVLRRPIFDLLAGRGQCLLSGTVSSRRNESSYRRMKKKLNVKPDASFGFSKDSPSTDHIIFNPPSSAPSVLHTPLKFLPKEDKRRQLYSVAKNSTLGIDEEAKLPPAILKQNAGYQRYHLTQEDVAEIRRLRSSDPETWTRLKLARKFNCTSLFIGICCEATAEKVALEKAKLEAVKERWGPKRRMAREDRVKRREAAYRDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.29
4 0.26
5 0.24
6 0.21
7 0.19
8 0.16
9 0.09
10 0.11
11 0.13
12 0.2
13 0.24
14 0.25
15 0.27
16 0.28
17 0.3
18 0.35
19 0.4
20 0.43
21 0.5
22 0.59
23 0.64
24 0.69
25 0.74
26 0.77
27 0.81
28 0.8
29 0.8
30 0.78
31 0.75
32 0.71
33 0.69
34 0.62
35 0.55
36 0.46
37 0.36
38 0.33
39 0.29
40 0.28
41 0.23
42 0.22
43 0.2
44 0.23
45 0.25
46 0.2
47 0.22
48 0.2
49 0.25
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.11
58 0.13
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.19
63 0.2
64 0.22
65 0.27
66 0.25
67 0.23
68 0.32
69 0.37
70 0.48
71 0.53
72 0.59
73 0.6
74 0.63
75 0.63
76 0.61
77 0.61
78 0.59
79 0.59
80 0.52
81 0.47
82 0.44
83 0.42
84 0.34
85 0.26
86 0.17
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.17
102 0.22
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.23
107 0.24
108 0.25
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.16
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.13
122 0.19
123 0.24
124 0.27
125 0.32
126 0.35
127 0.37
128 0.4
129 0.4
130 0.36
131 0.36
132 0.37
133 0.4
134 0.46
135 0.49
136 0.54
137 0.56
138 0.59
139 0.59
140 0.54
141 0.49
142 0.43
143 0.36
144 0.29
145 0.28
146 0.22
147 0.17
148 0.14
149 0.13
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.25
165 0.26
166 0.34
167 0.39
168 0.45
169 0.5
170 0.58
171 0.61
172 0.63
173 0.7
174 0.69
175 0.74
176 0.75
177 0.76
178 0.79
179 0.86
180 0.88
181 0.84
182 0.81
183 0.74
184 0.72
185 0.7