Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YUP2

Protein Details
Accession C7YUP2    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MNEANEPRRRRRHRIDAPQAQAVTHydrophilic
172-213ASKPRISRRKHHQQQQQHHQQQAAVPKKKERKKLEVDKRQMNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-12RRRR
197-204PKKKERKK
362-384GRGVGLARGRATVSRARAGGRGR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR034099  SmD3  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG nhe:NECHADRAFT_84991  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01721  Sm_D3  
Amino Acid Sequences MNEANEPRRRRRHRIDAPQAQAVTTLKPPAAGAFRGTPTTQWSEWVLHASSSYYYRARYISYDEMLRVIPDGRNSIVSDNVGGHIHYQFMGLNDAAMRNHYTTPTQTPELSTCSGTTPTTAEPSPFQPLPRIHHKERDYISGPPAIEDRKMLMSGALLPPKPDNTYGKALVASKPRISRRKHHQQQQQHHQQQAAVPKKKERKKLEVDKRQMNSNVKLTEHSSRTGSTFPHLPLPQPPSLANFHDIPKLQLQPGPPQLHELERNHTSTATMTSTIGIPIKLLNEAQGHIVTLEITSGQTYRGKLLDAEDNMNVQLKDITVTARDGRVSHLDQVYIRGSHVRFFIVPDMLRNAPMFRSRNVRGRGVGLARGRATVSRARAGGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.91
4 0.88
5 0.85
6 0.74
7 0.63
8 0.55
9 0.44
10 0.36
11 0.29
12 0.25
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.2
17 0.22
18 0.21
19 0.21
20 0.23
21 0.25
22 0.28
23 0.28
24 0.25
25 0.26
26 0.31
27 0.27
28 0.25
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.29
33 0.25
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.2
40 0.18
41 0.18
42 0.2
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.26
47 0.27
48 0.29
49 0.3
50 0.28
51 0.28
52 0.26
53 0.24
54 0.19
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.18
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.17
90 0.22
91 0.25
92 0.25
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.28
97 0.26
98 0.22
99 0.18
100 0.17
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.17
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.23
115 0.27
116 0.31
117 0.4
118 0.46
119 0.44
120 0.52
121 0.54
122 0.55
123 0.54
124 0.55
125 0.47
126 0.42
127 0.4
128 0.35
129 0.32
130 0.25
131 0.24
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.13
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.19
152 0.23
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.27
159 0.25
160 0.24
161 0.29
162 0.36
163 0.43
164 0.46
165 0.51
166 0.55
167 0.64
168 0.69
169 0.73
170 0.75
171 0.77
172 0.83
173 0.85
174 0.86
175 0.79
176 0.72
177 0.63
178 0.55
179 0.48
180 0.46
181 0.45
182 0.39
183 0.36
184 0.41
185 0.5
186 0.56
187 0.62
188 0.61
189 0.61
190 0.66
191 0.75
192 0.79
193 0.8
194 0.81
195 0.8
196 0.74
197 0.7
198 0.65
199 0.59
200 0.52
201 0.46
202 0.4
203 0.33
204 0.32
205 0.3
206 0.3
207 0.27
208 0.25
209 0.21
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.19
214 0.15
215 0.17
216 0.16
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.29
222 0.28
223 0.26
224 0.26
225 0.23
226 0.25
227 0.26
228 0.23
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.22
235 0.22
236 0.2
237 0.21
238 0.21
239 0.24
240 0.32
241 0.33
242 0.29
243 0.31
244 0.31
245 0.33
246 0.37
247 0.33
248 0.3
249 0.31
250 0.32
251 0.29
252 0.28
253 0.24
254 0.19
255 0.19
256 0.15
257 0.13
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.1
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.23
293 0.22
294 0.24
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.25
299 0.21
300 0.15
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.1
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.2
313 0.25
314 0.26
315 0.29
316 0.28
317 0.28
318 0.27
319 0.3
320 0.3
321 0.24
322 0.23
323 0.23
324 0.22
325 0.23
326 0.24
327 0.23
328 0.2
329 0.22
330 0.25
331 0.24
332 0.24
333 0.24
334 0.28
335 0.26
336 0.28
337 0.26
338 0.23
339 0.22
340 0.3
341 0.3
342 0.29
343 0.37
344 0.42
345 0.5
346 0.54
347 0.55
348 0.5
349 0.5
350 0.53
351 0.48
352 0.49
353 0.43
354 0.43
355 0.39
356 0.37
357 0.35
358 0.29
359 0.3
360 0.3
361 0.31
362 0.31
363 0.32
364 0.33