FuNGI

A0A1B8D262

Protein Details

Accession

A0A1B8D262

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
388-411	DSSSADKKTKSKDKKAAAKPKEAS	Hydrophilic
461-488	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
145-166	PAKKEVAPKKAEAKKTKEKLKP
394-414	KKTKSKDKKAAAKPKEASPPL
467-480	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MNPNLVPVAKRKPKAPVGEKPDWLFGNGASKPAATPQVSLSQPKAGKKTTVKGAKATTTEKSTKTPPSPELLDLVGEFLTEFGFNNTGNLFASERKDRTKSEGWQGRSAAAVKTTSVTLGNIYEKFRETTNGNTADKPKDNQAAPAKKEVAPKKAEAKKTKEKLKPVAAKESSSSSGDSDVEMGDAKAVTTKASKKSSSSSSSSGSSSSESSDSDADDEKEVPAAKAAAPKAKVNALKRKASSDSSSSSSSDSSSDSDSSSEDEAPKRKKSKTAPAAAESTSSSDSDSDSSDSDSSSSESDSASKKSAKSSSDSSSSDSDSSSSDSDSDSSSDSDSSTQSAAAKVPLPDSGSDSSSDSDSDSSSDEELGEAAAKSDSTATLASSDSDDSSSADKKTKSKDKKAAAKPKEASPPLPPLPPNPVPKKTNVPFSRIPKDIVVDERLKSNAFVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGKKGIRFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.71
3	0.7
4	0.71
5	0.76
6	0.77
7	0.7
8	0.68
9	0.58
10	0.5
11	0.4
12	0.32
13	0.32
14	0.27
15	0.26
16	0.21
17	0.2
18	0.19
19	0.22
20	0.28
21	0.2
22	0.21
23	0.22
24	0.29
25	0.32
26	0.35
27	0.33
28	0.35
29	0.38
30	0.43
31	0.46
32	0.41
33	0.48
34	0.51
35	0.56
36	0.58
37	0.63
38	0.6
39	0.6
40	0.62
41	0.6
42	0.58
43	0.54
44	0.49
45	0.46
46	0.49
47	0.45
48	0.44
49	0.45
50	0.49
51	0.51
52	0.52
53	0.48
54	0.49
55	0.5
56	0.47
57	0.43
58	0.34
59	0.29
60	0.23
61	0.21
62	0.14
63	0.1
64	0.09
65	0.06
66	0.06
67	0.05
68	0.06
69	0.06
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.13
79	0.18
80	0.24
81	0.27
82	0.32
83	0.36
84	0.36
85	0.43
86	0.47
87	0.49
88	0.53
89	0.57
90	0.56
91	0.58
92	0.57
93	0.5
94	0.44
95	0.4
96	0.3
97	0.24
98	0.2
99	0.14
100	0.15
101	0.14
102	0.12
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.11
107	0.14
108	0.16
109	0.17
110	0.18
111	0.19
112	0.19
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.22
117	0.28
118	0.33
119	0.33
120	0.35
121	0.39
122	0.42
123	0.43
124	0.39
125	0.37
126	0.37
127	0.36
128	0.41
129	0.46
130	0.49
131	0.48
132	0.52
133	0.5
134	0.47
135	0.55
136	0.53
137	0.5
138	0.45
139	0.47
140	0.5
141	0.55
142	0.6
143	0.6
144	0.63
145	0.66
146	0.71
147	0.77
148	0.74
149	0.75
150	0.74
151	0.76
152	0.76
153	0.69
154	0.71
155	0.63
156	0.57
157	0.5
158	0.46
159	0.38
160	0.3
161	0.27
162	0.17
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.11
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.1
178	0.15
179	0.22
180	0.26
181	0.28
182	0.28
183	0.32
184	0.38
185	0.39
186	0.38
187	0.34
188	0.32
189	0.32
190	0.31
191	0.27
192	0.22
193	0.18
194	0.14
195	0.13
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.08
207	0.1
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.16
217	0.17
218	0.18
219	0.23
220	0.26
221	0.29
222	0.38
223	0.39
224	0.43
225	0.43
226	0.45
227	0.43
228	0.42
229	0.38
230	0.31
231	0.29
232	0.27
233	0.27
234	0.24
235	0.22
236	0.19
237	0.17
238	0.14
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.13
251	0.19
252	0.23
253	0.3
254	0.34
255	0.35
256	0.41
257	0.47
258	0.55
259	0.57
260	0.62
261	0.59
262	0.57
263	0.57
264	0.5
265	0.44
266	0.33
267	0.26
268	0.18
269	0.14
270	0.11
271	0.08
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.1
288	0.11
289	0.12
290	0.15
291	0.17
292	0.18
293	0.22
294	0.26
295	0.25
296	0.27
297	0.31
298	0.31
299	0.34
300	0.34
301	0.32
302	0.3
303	0.29
304	0.26
305	0.21
306	0.18
307	0.13
308	0.14
309	0.12
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.1
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.14
335	0.13
336	0.16
337	0.17
338	0.15
339	0.16
340	0.16
341	0.16
342	0.15
343	0.15
344	0.11
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.15
378	0.15
379	0.2
380	0.23
381	0.28
382	0.37
383	0.47
384	0.54
385	0.62
386	0.7
387	0.75
388	0.82
389	0.88
390	0.89
391	0.86
392	0.85
393	0.78
394	0.76
395	0.76
396	0.68
397	0.61
398	0.55
399	0.56
400	0.49
401	0.51
402	0.44
403	0.38
404	0.43
405	0.48
406	0.52
407	0.52
408	0.56
409	0.55
410	0.59
411	0.66
412	0.62
413	0.65
414	0.6
415	0.58
416	0.59
417	0.64
418	0.67
419	0.59
420	0.57
421	0.49
422	0.48
423	0.45
424	0.41
425	0.39
426	0.35
427	0.33
428	0.34
429	0.33
430	0.3
431	0.27
432	0.26
433	0.25
434	0.23
435	0.22
436	0.23
437	0.24
438	0.3
439	0.3
440	0.27
441	0.23
442	0.24
443	0.25
444	0.22
445	0.22
446	0.18
447	0.18
448	0.25
449	0.29
450	0.27
451	0.27
452	0.3
453	0.31
454	0.36
455	0.4
456	0.43
457	0.49
458	0.59
459	0.68
460	0.75
461	0.82
462	0.84
463	0.9
464	0.91
465	0.9
466	0.91
467	0.88
468	0.86
469	0.84
470	0.79
471	0.68
472	0.58
473	0.57
474	0.46
475	0.42
476	0.34
477	0.27
478	0.23

A0A1B8D262

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer