Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8D816

Protein Details
Accession A0A1B8D816    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-350LSSRAKPSSSRKPTRKQELSDHydrophilic
441-468GPKAPSKPTTPQKKSPPKPAAKAAKKGGHydrophilic
541-562TSEERAQRKREELKRQLEEKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-571APSKPTTPQKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKSDPPPVPASPPKEDAPDAQKTEAPPKATKSRLGRIGHKPPKEEPGADEESRGRTEVKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAVSWRPFMISAIDSRMPPLLISTTFTTDSYKIYLTDLAHLWCEDLDRRSILRRSLAEDTSIDPSEDAGQLKLFLDKVSLGLEGGKDVDLLLGLGAHAAKEGSTGTANLEINMSIALPKPLQPLNWTIRLSSCSQSDFATHFTLPLLYAQNARLKELDSLVGLLRDKDNVIQKLVDKLEATGAELGHLFPGVAGKGGRKIPRRVVEEKVKGLEVFSQEQWRAAMRNAEAETEHAGVKTIIQGAFTKNSPVGSHTHGAELLGRFEKWWDQLKDGAIPLSTPKDGGSVADAGAEDVKAEPAAVDMDTTEDEGTDGHADGFQVAATPPRQQILSSRAKPSSSRKPTRKQELSDDSTDDSDDLSASQSQHVTIRDSFPAPKEELRPETKKIGAIGGSKKVAKTATKMKPEAEPEPDPEPEPVTRATRSHKQDDADDDETETEDEGPKAPSKPTTPQKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKSDPPPVPASPPKEDAPDAQKTEAPPKATKSRLGRIGHKPPKEEPGADEESRGRTEVKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.23
5 0.2
6 0.2
7 0.17
8 0.15
9 0.19
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.23
16 0.24
17 0.23
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.22
22 0.19
23 0.23
24 0.23
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.2
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.3
37 0.35
38 0.36
39 0.39
40 0.39
41 0.42
42 0.46
43 0.45
44 0.39
45 0.36
46 0.34
47 0.32
48 0.31
49 0.25
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.17
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.06
102 0.07
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.15
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.26
111 0.29
112 0.36
113 0.34
114 0.31
115 0.32
116 0.33
117 0.34
118 0.3
119 0.26
120 0.21
121 0.22
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.21
138 0.21
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.19
144 0.17
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.21
156 0.2
157 0.22
158 0.22
159 0.23
160 0.28
161 0.28
162 0.26
163 0.19
164 0.17
165 0.19
166 0.17
167 0.17
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.11
183 0.16
184 0.23
185 0.28
186 0.33
187 0.4
188 0.48
189 0.54
190 0.53
191 0.56
192 0.6
193 0.59
194 0.57
195 0.51
196 0.43
197 0.37
198 0.33
199 0.28
200 0.21
201 0.19
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.14
210 0.16
211 0.13
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.14
219 0.14
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.2
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.24
258 0.25
259 0.23
260 0.2
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.06
309 0.07
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.15
316 0.21
317 0.29
318 0.31
319 0.35
320 0.36
321 0.37
322 0.4
323 0.44
324 0.47
325 0.48
326 0.55
327 0.59
328 0.68
329 0.76
330 0.83
331 0.83
332 0.75
333 0.74
334 0.73
335 0.69
336 0.61
337 0.53
338 0.43
339 0.36
340 0.33
341 0.23
342 0.14
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.17
357 0.18
358 0.19
359 0.21
360 0.2
361 0.22
362 0.21
363 0.23
364 0.25
365 0.28
366 0.32
367 0.38
368 0.4
369 0.4
370 0.42
371 0.41
372 0.39
373 0.34
374 0.31
375 0.26
376 0.28
377 0.28
378 0.28
379 0.29
380 0.29
381 0.28
382 0.28
383 0.28
384 0.24
385 0.26
386 0.32
387 0.38
388 0.44
389 0.46
390 0.46
391 0.48
392 0.51
393 0.5
394 0.46
395 0.4
396 0.35
397 0.37
398 0.36
399 0.32
400 0.28
401 0.26
402 0.2
403 0.2
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.22
408 0.28
409 0.34
410 0.4
411 0.44
412 0.46
413 0.44
414 0.46
415 0.48
416 0.49
417 0.43
418 0.37
419 0.32
420 0.28
421 0.26
422 0.22
423 0.17
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.11
429 0.14
430 0.15
431 0.17
432 0.2
433 0.24
434 0.33
435 0.42
436 0.51
437 0.56
438 0.63
439 0.72
440 0.8
441 0.83
442 0.84
443 0.85
444 0.83
445 0.82
446 0.83
447 0.83
448 0.8
449 0.81
450 0.76
451 0.71
452 0.66
453 0.64
454 0.58
455 0.52
456 0.45
457 0.44
458 0.46
459 0.44
460 0.42
461 0.38
462 0.41
463 0.41
464 0.49
465 0.44
466 0.4
467 0.43
468 0.45
469 0.51
470 0.52
471 0.54
472 0.49
473 0.51
474 0.48
475 0.46
476 0.43
477 0.41
478 0.4
479 0.42
480 0.39
481 0.37
482 0.38
483 0.36
484 0.43
485 0.42
486 0.4
487 0.36
488 0.4
489 0.47
490 0.48
491 0.54
492 0.54
493 0.58
494 0.62
495 0.65
496 0.67
497 0.68
498 0.76
499 0.77
500 0.74
501 0.7
502 0.65
503 0.68
504 0.64
505 0.56
506 0.48
507 0.47
508 0.48
509 0.43
510 0.42
511 0.37
512 0.35
513 0.35
514 0.33
515 0.26
516 0.2
517 0.24
518 0.29
519 0.34
520 0.4
521 0.44
522 0.51
523 0.56
524 0.58
525 0.57
526 0.57
527 0.52
528 0.49
529 0.55
530 0.56
531 0.59
532 0.66
533 0.68
534 0.66
535 0.73
536 0.76
537 0.75
538 0.76
539 0.78
540 0.79
541 0.83
542 0.81
543 0.81
544 0.79
545 0.74
546 0.68
547 0.68
548 0.65
549 0.62
550 0.67
551 0.69