Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YT48

Protein Details
Accession C7YT48    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-242VDDEKKDKSRRREERHERHRRRHRHRSADSEDRHHRRRRSYSRSRSPRRHDDSREDRQRRRRERDDHSPERRSRBasic
251-271EASRRHRRSRDDRRYDDDRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-288KKDKSRRREERHERHRRRHRHRSADSEDRHHRRRRSYSRSRSPRRHDDSREDRQRRRRERDDHSPERRSRRRHDSEDEEASRRHRRSRDDRRYDDDRRRDSRRSYSGEARDRKPRH
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG nhe:NECHADRAFT_100723  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNLKKSFHPALRRNQQAVYEEEQKALAERKRTQQRINEIKEERAKEEVQRQLEAAGGKKRIDRVDWMYQGPNDGQTGTTEETEAYLLGKRRIDNLIKGTEHKKLEKQAGEESFMALQNANTARDTAAKIRDDPLLAIKRQEQAAYEAMMNDPIKRRQLLASMGVDDEKKDKSRRREERHERHRRRHRHRSADSEDRHHRRRRSYSRSRSPRRHDDSREDRQRRRRERDDHSPERRSRRRHDSEDEEASRRHRRSRDDRRYDDDRRRDSRRSYSGEARDRKPRHNEEDDKAKEEERQRKLAAMQSAASELDEDREKRLAALEERERALREADDKARERGGDRGFVNRLHQQAGNKGLAERMGGARRGYQRDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.57
3 0.67
4 0.75
5 0.72
6 0.69
7 0.67
8 0.6
9 0.57
10 0.52
11 0.5
12 0.43
13 0.4
14 0.37
15 0.31
16 0.31
17 0.33
18 0.31
19 0.3
20 0.35
21 0.44
22 0.55
23 0.62
24 0.67
25 0.68
26 0.75
27 0.77
28 0.79
29 0.78
30 0.71
31 0.72
32 0.72
33 0.67
34 0.58
35 0.53
36 0.48
37 0.44
38 0.5
39 0.49
40 0.44
41 0.42
42 0.39
43 0.35
44 0.35
45 0.31
46 0.28
47 0.27
48 0.27
49 0.27
50 0.3
51 0.35
52 0.35
53 0.35
54 0.37
55 0.38
56 0.44
57 0.46
58 0.46
59 0.44
60 0.41
61 0.41
62 0.35
63 0.29
64 0.2
65 0.17
66 0.14
67 0.12
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.08
77 0.1
78 0.13
79 0.16
80 0.19
81 0.19
82 0.22
83 0.28
84 0.31
85 0.33
86 0.36
87 0.39
88 0.37
89 0.41
90 0.41
91 0.42
92 0.42
93 0.41
94 0.4
95 0.4
96 0.47
97 0.46
98 0.46
99 0.46
100 0.44
101 0.43
102 0.38
103 0.33
104 0.27
105 0.23
106 0.2
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.22
124 0.21
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.25
131 0.25
132 0.25
133 0.18
134 0.17
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.12
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.21
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.17
157 0.14
158 0.13
159 0.11
160 0.14
161 0.19
162 0.26
163 0.35
164 0.46
165 0.56
166 0.63
167 0.73
168 0.8
169 0.85
170 0.9
171 0.92
172 0.9
173 0.9
174 0.92
175 0.91
176 0.91
177 0.91
178 0.89
179 0.89
180 0.86
181 0.84
182 0.81
183 0.8
184 0.73
185 0.69
186 0.68
187 0.64
188 0.66
189 0.63
190 0.61
191 0.6
192 0.67
193 0.7
194 0.71
195 0.76
196 0.79
197 0.83
198 0.89
199 0.9
200 0.9
201 0.88
202 0.88
203 0.85
204 0.83
205 0.78
206 0.77
207 0.76
208 0.77
209 0.8
210 0.76
211 0.76
212 0.77
213 0.82
214 0.82
215 0.82
216 0.81
217 0.79
218 0.8
219 0.83
220 0.84
221 0.84
222 0.82
223 0.81
224 0.78
225 0.8
226 0.79
227 0.75
228 0.74
229 0.74
230 0.75
231 0.73
232 0.75
233 0.72
234 0.71
235 0.72
236 0.67
237 0.58
238 0.51
239 0.48
240 0.48
241 0.43
242 0.44
243 0.41
244 0.47
245 0.56
246 0.66
247 0.72
248 0.75
249 0.78
250 0.79
251 0.82
252 0.81
253 0.8
254 0.78
255 0.75
256 0.72
257 0.73
258 0.72
259 0.69
260 0.7
261 0.68
262 0.65
263 0.63
264 0.65
265 0.67
266 0.7
267 0.71
268 0.66
269 0.68
270 0.66
271 0.68
272 0.69
273 0.68
274 0.67
275 0.7
276 0.73
277 0.69
278 0.75
279 0.71
280 0.64
281 0.57
282 0.5
283 0.46
284 0.48
285 0.51
286 0.46
287 0.49
288 0.46
289 0.47
290 0.5
291 0.49
292 0.44
293 0.37
294 0.32
295 0.26
296 0.27
297 0.24
298 0.2
299 0.15
300 0.11
301 0.12
302 0.16
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.22
309 0.24
310 0.24
311 0.32
312 0.35
313 0.38
314 0.4
315 0.41
316 0.39
317 0.35
318 0.33
319 0.27
320 0.24
321 0.27
322 0.31
323 0.38
324 0.4
325 0.42
326 0.43
327 0.42
328 0.4
329 0.4
330 0.38
331 0.36
332 0.34
333 0.38
334 0.38
335 0.39
336 0.43
337 0.41
338 0.4
339 0.36
340 0.38
341 0.35
342 0.39
343 0.43
344 0.41
345 0.36
346 0.34
347 0.32
348 0.29
349 0.26
350 0.22
351 0.22
352 0.24
353 0.26
354 0.27
355 0.32
356 0.39
357 0.44