FuNGI

A0A1B8CYY6

Protein Details

Accession

A0A1B8CYY6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-123	SSSSRRPRGGLSPNNRRSNQKNPRPRRLQIQRVVSV	Hydrophilic
140-159	DTMPKARKFRAKSSKYPTTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-113	RPRGGLSPNNRRSNQKNPRPR

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036612 KH_dom_type_1_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50084 KH_TYPE_1 PS51375 PPR
CDD	cd00105 KH-I

Amino Acid Sequences

MVPGSRSISICKAAVSRCSPTLHRDIREPLLFLYPTWARGFSSSAAEVLRNEQSTLHSRLAPESQQACSSSASSFDTHALDTRPVAPSSSSRRPRGGLSPNNRRSNQKNPRPRRLQIQRVVSVNDDLDIRLRRVKIEEGDTMPKARKFRAKSSKYPTTSEQQGDTGATMMRNIVKAYPRPIIKGDSFRKVPYGQKVRMILSTTERAEMRWWYQDEVRRLQHENMNEDRGFPQKGPPEVLKTLIRYTPKRVENTLLRISVPDNAVDSLLVGPGNNIIDIKNLTGCDIELLEAEEGKSTRSLLLSGPPICISAAAAHIFRIVPAAVSNSTNRAFTFSQYNTRSSTTGVAQTTDARGSAHITTQYYLASSKVDDIPRRADSIPKPKRLTEKSLELYIRSLTGIKMTSPLHKMLYRKNEDHVEIVAERLLEVFAYDECMDVMTITALNEAVSFLAKYGRVAATREIFDKARRVRFPLTPETYNILLRGCAKTQNINTFAALLGVMIHSGYRPNSGTWRAFMMVLRNPKAILHVYEAMQGRGLFHEEGLLSDVCELLLPHEMTFCLNKNQLVAPFIEHMSSRYGDGWLSVSGANKVLEELGKRGLLSECWSLVDYMVEQNILPNAVTINTIFTHSTDARDFRNNIRALDRVSEQARFRPDGTTYEILFKLAWRWRLYSTARVIWQRACLDACARFEMRQRVSTSLQSTFMFQSTALPSLPGPSAPADSVWDLTAGVFVVREICPPAPKDESQTPDESSLSQWKAFHHAVETVKSELLIFKEWRAVGSLTKLLVAAVKTDETVSKQMDNNFEKGMEHLLQYAPVVRIKRRSWGVDEESRRLKWELGTNCIKILEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.37
3	0.38
4	0.39
5	0.43
6	0.43
7	0.45
8	0.52
9	0.52
10	0.5
11	0.52
12	0.54
13	0.57
14	0.57
15	0.52
16	0.44
17	0.42
18	0.39
19	0.32
20	0.33
21	0.26
22	0.27
23	0.27
24	0.26
25	0.21
26	0.22
27	0.25
28	0.2
29	0.23
30	0.21
31	0.21
32	0.21
33	0.21
34	0.2
35	0.22
36	0.24
37	0.21
38	0.2
39	0.2
40	0.23
41	0.29
42	0.33
43	0.31
44	0.29
45	0.29
46	0.32
47	0.36
48	0.34
49	0.35
50	0.33
51	0.32
52	0.33
53	0.34
54	0.32
55	0.28
56	0.27
57	0.2
58	0.19
59	0.2
60	0.17
61	0.17
62	0.18
63	0.17
64	0.17
65	0.19
66	0.19
67	0.18
68	0.19
69	0.21
70	0.22
71	0.21
72	0.22
73	0.21
74	0.26
75	0.33
76	0.42
77	0.47
78	0.49
79	0.53
80	0.54
81	0.56
82	0.58
83	0.6
84	0.6
85	0.62
86	0.68
87	0.74
88	0.8
89	0.79
90	0.77
91	0.73
92	0.74
93	0.75
94	0.74
95	0.76
96	0.77
97	0.85
98	0.87
99	0.85
100	0.85
101	0.85
102	0.85
103	0.82
104	0.81
105	0.76
106	0.7
107	0.67
108	0.57
109	0.49
110	0.38
111	0.3
112	0.21
113	0.16
114	0.18
115	0.18
116	0.19
117	0.22
118	0.22
119	0.24
120	0.26
121	0.32
122	0.32
123	0.34
124	0.37
125	0.36
126	0.42
127	0.41
128	0.41
129	0.4
130	0.39
131	0.37
132	0.38
133	0.42
134	0.43
135	0.52
136	0.6
137	0.63
138	0.69
139	0.76
140	0.8
141	0.75
142	0.73
143	0.67
144	0.63
145	0.62
146	0.54
147	0.47
148	0.37
149	0.34
150	0.3
151	0.26
152	0.2
153	0.14
154	0.11
155	0.09
156	0.1
157	0.11
158	0.11
159	0.12
160	0.14
161	0.19
162	0.22
163	0.27
164	0.32
165	0.32
166	0.34
167	0.36
168	0.38
169	0.37
170	0.44
171	0.45
172	0.46
173	0.47
174	0.45
175	0.46
176	0.45
177	0.46
178	0.46
179	0.5
180	0.45
181	0.49
182	0.52
183	0.49
184	0.49
185	0.45
186	0.37
187	0.33
188	0.35
189	0.3
190	0.29
191	0.27
192	0.25
193	0.24
194	0.25
195	0.23
196	0.24
197	0.25
198	0.25
199	0.3
200	0.36
201	0.4
202	0.44
203	0.45
204	0.42
205	0.44
206	0.46
207	0.45
208	0.42
209	0.42
210	0.39
211	0.41
212	0.37
213	0.35
214	0.32
215	0.32
216	0.29
217	0.23
218	0.26
219	0.25
220	0.28
221	0.3
222	0.31
223	0.33
224	0.33
225	0.36
226	0.33
227	0.3
228	0.3
229	0.31
230	0.35
231	0.32
232	0.38
233	0.43
234	0.45
235	0.47
236	0.46
237	0.49
238	0.49
239	0.53
240	0.51
241	0.43
242	0.37
243	0.34
244	0.33
245	0.29
246	0.24
247	0.17
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.12
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.17
293	0.17
294	0.16
295	0.15
296	0.11
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.1
313	0.13
314	0.13
315	0.14
316	0.13
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.22
321	0.2
322	0.28
323	0.3
324	0.32
325	0.29
326	0.3
327	0.29
328	0.24
329	0.24
330	0.17
331	0.19
332	0.18
333	0.16
334	0.15
335	0.16
336	0.16
337	0.14
338	0.12
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.12
356	0.15
357	0.17
358	0.19
359	0.23
360	0.23
361	0.26
362	0.24
363	0.26
364	0.29
365	0.39
366	0.45
367	0.48
368	0.5
369	0.5
370	0.59
371	0.58
372	0.58
373	0.52
374	0.52
375	0.46
376	0.49
377	0.46
378	0.37
379	0.34
380	0.27
381	0.22
382	0.14
383	0.12
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.1
389	0.11
390	0.14
391	0.16
392	0.17
393	0.18
394	0.21
395	0.23
396	0.26
397	0.35
398	0.37
399	0.36
400	0.38
401	0.39
402	0.37
403	0.36
404	0.29
405	0.21
406	0.16
407	0.15
408	0.12
409	0.08
410	0.07
411	0.06
412	0.05
413	0.03
414	0.03
415	0.04
416	0.03
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.05
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.07
441	0.09
442	0.09
443	0.11
444	0.13
445	0.15
446	0.16
447	0.17
448	0.17
449	0.17
450	0.18
451	0.24
452	0.27
453	0.31
454	0.32
455	0.35
456	0.37
457	0.39
458	0.43
459	0.45
460	0.44
461	0.38
462	0.39
463	0.37
464	0.35
465	0.31
466	0.26
467	0.18
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.12
472	0.14
473	0.15
474	0.19
475	0.22
476	0.28
477	0.28
478	0.27
479	0.26
480	0.23
481	0.22
482	0.17
483	0.13
484	0.07
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.05
492	0.05
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.13
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.2
501	0.19
502	0.19
503	0.19
504	0.19
505	0.19
506	0.24
507	0.25
508	0.24
509	0.23
510	0.22
511	0.24
512	0.21
513	0.18
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.21
518	0.22
519	0.19
520	0.19
521	0.17
522	0.13
523	0.12
524	0.14
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.1
531	0.09
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.04
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.12
546	0.13
547	0.14
548	0.15
549	0.15
550	0.16
551	0.18
552	0.19
553	0.18
554	0.17
555	0.15
556	0.15
557	0.15
558	0.14
559	0.12
560	0.12
561	0.13
562	0.13
563	0.12
564	0.11
565	0.11
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.09
570	0.09
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.12
575	0.11
576	0.1
577	0.1
578	0.09
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.15
589	0.15
590	0.13
591	0.14
592	0.14
593	0.13
594	0.12
595	0.12
596	0.09
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.08
602	0.08
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.07
609	0.06
610	0.08
611	0.08
612	0.09
613	0.1
614	0.1
615	0.15
616	0.15
617	0.17
618	0.18
619	0.2
620	0.22
621	0.28
622	0.3
623	0.29
624	0.37
625	0.36
626	0.35
627	0.36
628	0.35
629	0.31
630	0.32
631	0.29
632	0.25
633	0.26
634	0.29
635	0.27
636	0.3
637	0.32
638	0.31
639	0.31
640	0.28
641	0.28
642	0.26
643	0.32
644	0.3
645	0.27
646	0.29
647	0.28
648	0.26
649	0.24
650	0.22
651	0.22
652	0.23
653	0.28
654	0.25
655	0.28
656	0.29
657	0.37
658	0.39
659	0.4
660	0.4
661	0.4
662	0.43
663	0.45
664	0.46
665	0.41
666	0.43
667	0.37
668	0.34
669	0.3
670	0.26
671	0.26
672	0.27
673	0.27
674	0.26
675	0.26
676	0.26
677	0.31
678	0.39
679	0.39
680	0.4
681	0.41
682	0.41
683	0.43
684	0.46
685	0.44
686	0.37
687	0.36
688	0.31
689	0.31
690	0.27
691	0.25
692	0.2
693	0.15
694	0.17
695	0.16
696	0.18
697	0.15
698	0.14
699	0.14
700	0.16
701	0.17
702	0.12
703	0.12
704	0.11
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.13
709	0.14
710	0.15
711	0.13
712	0.12
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.07
717	0.06
718	0.05
719	0.05
720	0.08
721	0.08
722	0.09
723	0.12
724	0.14
725	0.18
726	0.2
727	0.25
728	0.28
729	0.29
730	0.35
731	0.39
732	0.42
733	0.43
734	0.44
735	0.41
736	0.38
737	0.38
738	0.31
739	0.28
740	0.31
741	0.29
742	0.28
743	0.27
744	0.26
745	0.33
746	0.33
747	0.31
748	0.26
749	0.29
750	0.3
751	0.32
752	0.33
753	0.28
754	0.27
755	0.25
756	0.23
757	0.2
758	0.19
759	0.2
760	0.19
761	0.19
762	0.24
763	0.24
764	0.25
765	0.25
766	0.24
767	0.22
768	0.25
769	0.27
770	0.21
771	0.22
772	0.21
773	0.18
774	0.19
775	0.17
776	0.14
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.14
781	0.16
782	0.17
783	0.21
784	0.22
785	0.24
786	0.28
787	0.32
788	0.41
789	0.43
790	0.42
791	0.39
792	0.36
793	0.32
794	0.3
795	0.3
796	0.23
797	0.2
798	0.19
799	0.18
800	0.18
801	0.18
802	0.21
803	0.18
804	0.21
805	0.24
806	0.27
807	0.36
808	0.37
809	0.46
810	0.49
811	0.53
812	0.54
813	0.59
814	0.62
815	0.63
816	0.67
817	0.66
818	0.66
819	0.61
820	0.59
821	0.51
822	0.46
823	0.41
824	0.44
825	0.41
826	0.43
827	0.5
828	0.47
829	0.47

A0A1B8CYY6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer