Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CTX1

Protein Details
Accession A0A1B8CTX1    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44TPTFSSPSKSIRQSRVRRSQQMYGSSHydrophilic
118-160DSPAAPPKRGRGRPRKSIGTPVPAKTRNVTPGKSPRRRRTLGSHydrophilic
924-948SSLERPRRSKLPSPWRQNSRRLVYSHydrophilic
1074-1093WDLPQKQNFKPRITPRQSNIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-156PPKRGRGRPRKSIGTPVPAKTRNVTPGKSPRRRR
184-189KGRSRS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSYNMADILSSSPDPLNDTPTFSSPSKSIRQSRVRRSQQMYGSSPTKQTFELDVGNGISPQKIRVTVEAENNKENSYPEFSDLRSPSPSPYYASSRRRNTRTTTTTVPLKGLSDSEEDSPAAPPKRGRGRPRKSIGTPVPAKTRNVTPGKSPRRRRTLGSLVDGDDEEDWDFAIGKSVEVGRGKGRSRSRSVKSVTRKTTAAKSTGPSSDLPESSVANKRGRRQSLLPQEIPILEDLTGHSSPAEESFEEVHPEDDMPLRAVEQNAIGSHSEHSTIRSTSTAFGEDVTVAQFDREITPEAEGWSSPRVVSAIPRHLQAAASSRRGSPLVHQAVEEVPRSSLSANEIGSGDDRYQQEEEHNYDDEAEDGLGDLQEFDTILESEGFSMISVDSVPSLREHFSSPSIQGKPFESVSSFEEREVDHRRSDSRPSSSGMSSLAQASSSKRQSFDNVQSTQQSLVEDSTSNSSARFQPAATSSPRDQDHEADASEHSQAGSSVTGSALLAQPVEATTTSNSDSEHPTGPLLPTPEETPSPDNDSAGSSAQEPSQGKAASVTNRESVHVESTADSSVNMTQMRSSPPSFAAPRYTYTAHLRQRQSLGLTETPSIIFSSPSLPPPKQRPAPREQLPSTTDINGAPKPHLSSSVIAGRALQEILVPNSASTHSSFLRSPFKSPNARRHPLSPTEEPTKEKEPVVQSSRLDSSVPGLGPMSWRNLSRSRTLSGAASDEVRRPGFMKNIPLIVDDPFLAEASEQLRSPSPEEKDDYSLGLPTPGQARNTQIVNLVAHDTDTVRYSDEMSWQAEYPAMRTPPRDDSEGSGSGKAMAGSSRTAERQMESQKQKQRDEWQVDKVETTQHLGLDLTQVYVVPSDLPTINSTPLLTQAQPAPKANVVEDVFDDEDIWLAEARSNSSPSIGKHVDIAPKQSSLERPRRSKLPSPWRQNSRRLVYSDELATQDSSPLSKNEPSVVAPPVEARSATLPAPPAFAPRATLVPKDDIKATSVLARLTSQLAPKAVLLSKSTSKPSGLVSDAPQLGPLRRSIELSKPQPKPFMAPVERPQAPPVTEDYDQTELSTWDLPQKQNFKPRITPRQSNILGISALLASSPVKKPEPFYAEDETIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.25
4 0.23
5 0.27
6 0.28
7 0.3
8 0.35
9 0.31
10 0.33
11 0.29
12 0.35
13 0.38
14 0.45
15 0.51
16 0.55
17 0.65
18 0.73
19 0.8
20 0.85
21 0.87
22 0.88
23 0.85
24 0.84
25 0.81
26 0.79
27 0.72
28 0.69
29 0.62
30 0.56
31 0.55
32 0.48
33 0.43
34 0.35
35 0.34
36 0.3
37 0.29
38 0.3
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.19
45 0.17
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.19
50 0.21
51 0.24
52 0.29
53 0.32
54 0.41
55 0.47
56 0.48
57 0.5
58 0.49
59 0.46
60 0.41
61 0.37
62 0.31
63 0.29
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.28
68 0.36
69 0.36
70 0.36
71 0.34
72 0.33
73 0.33
74 0.35
75 0.35
76 0.3
77 0.33
78 0.38
79 0.44
80 0.52
81 0.58
82 0.64
83 0.72
84 0.75
85 0.76
86 0.75
87 0.76
88 0.73
89 0.7
90 0.66
91 0.62
92 0.64
93 0.59
94 0.53
95 0.44
96 0.38
97 0.33
98 0.27
99 0.23
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.24
108 0.23
109 0.25
110 0.25
111 0.33
112 0.43
113 0.52
114 0.6
115 0.65
116 0.72
117 0.79
118 0.86
119 0.86
120 0.8
121 0.81
122 0.78
123 0.77
124 0.73
125 0.68
126 0.69
127 0.63
128 0.61
129 0.55
130 0.53
131 0.52
132 0.53
133 0.49
134 0.49
135 0.56
136 0.65
137 0.71
138 0.76
139 0.77
140 0.8
141 0.82
142 0.79
143 0.78
144 0.77
145 0.74
146 0.7
147 0.63
148 0.54
149 0.52
150 0.45
151 0.36
152 0.26
153 0.19
154 0.13
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.19
169 0.26
170 0.28
171 0.35
172 0.42
173 0.45
174 0.52
175 0.6
176 0.62
177 0.64
178 0.68
179 0.69
180 0.72
181 0.74
182 0.72
183 0.67
184 0.64
185 0.59
186 0.62
187 0.58
188 0.51
189 0.45
190 0.41
191 0.42
192 0.41
193 0.39
194 0.31
195 0.3
196 0.3
197 0.27
198 0.25
199 0.22
200 0.21
201 0.24
202 0.3
203 0.3
204 0.33
205 0.38
206 0.45
207 0.53
208 0.57
209 0.58
210 0.56
211 0.61
212 0.65
213 0.69
214 0.62
215 0.54
216 0.51
217 0.45
218 0.4
219 0.3
220 0.2
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.08
233 0.1
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.15
297 0.2
298 0.27
299 0.28
300 0.28
301 0.29
302 0.29
303 0.29
304 0.25
305 0.26
306 0.23
307 0.26
308 0.26
309 0.26
310 0.27
311 0.28
312 0.26
313 0.22
314 0.28
315 0.28
316 0.27
317 0.27
318 0.26
319 0.28
320 0.3
321 0.27
322 0.17
323 0.13
324 0.12
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.11
337 0.13
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.18
343 0.21
344 0.23
345 0.21
346 0.21
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.15
351 0.11
352 0.08
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.13
386 0.15
387 0.17
388 0.18
389 0.24
390 0.25
391 0.26
392 0.25
393 0.25
394 0.25
395 0.24
396 0.22
397 0.16
398 0.16
399 0.17
400 0.21
401 0.2
402 0.17
403 0.18
404 0.17
405 0.22
406 0.26
407 0.25
408 0.21
409 0.23
410 0.26
411 0.27
412 0.34
413 0.35
414 0.33
415 0.33
416 0.34
417 0.35
418 0.32
419 0.3
420 0.25
421 0.19
422 0.15
423 0.14
424 0.11
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.17
429 0.21
430 0.21
431 0.22
432 0.23
433 0.27
434 0.33
435 0.38
436 0.39
437 0.36
438 0.36
439 0.36
440 0.36
441 0.33
442 0.27
443 0.19
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.13
459 0.15
460 0.18
461 0.18
462 0.21
463 0.19
464 0.24
465 0.25
466 0.25
467 0.25
468 0.23
469 0.24
470 0.21
471 0.2
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.13
476 0.11
477 0.08
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.05
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.12
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.18
521 0.17
522 0.16
523 0.15
524 0.16
525 0.15
526 0.13
527 0.12
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.12
532 0.11
533 0.11
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.14
538 0.17
539 0.16
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.19
544 0.2
545 0.19
546 0.18
547 0.16
548 0.14
549 0.12
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.09
562 0.11
563 0.13
564 0.14
565 0.13
566 0.14
567 0.18
568 0.19
569 0.19
570 0.21
571 0.2
572 0.21
573 0.23
574 0.23
575 0.22
576 0.25
577 0.32
578 0.34
579 0.4
580 0.4
581 0.39
582 0.4
583 0.39
584 0.35
585 0.29
586 0.27
587 0.21
588 0.2
589 0.18
590 0.16
591 0.15
592 0.14
593 0.12
594 0.08
595 0.07
596 0.06
597 0.08
598 0.09
599 0.13
600 0.16
601 0.17
602 0.22
603 0.28
604 0.36
605 0.4
606 0.46
607 0.49
608 0.52
609 0.61
610 0.62
611 0.63
612 0.57
613 0.54
614 0.49
615 0.46
616 0.41
617 0.32
618 0.27
619 0.19
620 0.21
621 0.17
622 0.17
623 0.14
624 0.13
625 0.14
626 0.13
627 0.15
628 0.14
629 0.13
630 0.15
631 0.19
632 0.19
633 0.17
634 0.17
635 0.15
636 0.14
637 0.13
638 0.1
639 0.06
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.06
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.1
650 0.1
651 0.12
652 0.13
653 0.16
654 0.24
655 0.24
656 0.27
657 0.3
658 0.36
659 0.44
660 0.5
661 0.56
662 0.58
663 0.62
664 0.6
665 0.59
666 0.58
667 0.56
668 0.56
669 0.49
670 0.45
671 0.47
672 0.47
673 0.45
674 0.43
675 0.41
676 0.36
677 0.32
678 0.32
679 0.29
680 0.33
681 0.36
682 0.35
683 0.31
684 0.33
685 0.34
686 0.29
687 0.26
688 0.19
689 0.16
690 0.15
691 0.14
692 0.11
693 0.1
694 0.09
695 0.11
696 0.12
697 0.14
698 0.13
699 0.14
700 0.18
701 0.24
702 0.26
703 0.3
704 0.32
705 0.29
706 0.29
707 0.29
708 0.27
709 0.22
710 0.21
711 0.16
712 0.15
713 0.15
714 0.15
715 0.17
716 0.16
717 0.15
718 0.15
719 0.17
720 0.2
721 0.22
722 0.25
723 0.24
724 0.26
725 0.26
726 0.26
727 0.24
728 0.2
729 0.17
730 0.12
731 0.11
732 0.09
733 0.09
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.08
739 0.08
740 0.09
741 0.1
742 0.12
743 0.15
744 0.19
745 0.21
746 0.23
747 0.26
748 0.28
749 0.29
750 0.29
751 0.27
752 0.22
753 0.2
754 0.17
755 0.14
756 0.12
757 0.1
758 0.13
759 0.14
760 0.15
761 0.16
762 0.19
763 0.22
764 0.23
765 0.23
766 0.2
767 0.2
768 0.19
769 0.18
770 0.16
771 0.12
772 0.11
773 0.11
774 0.1
775 0.08
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.11
781 0.12
782 0.14
783 0.16
784 0.16
785 0.17
786 0.16
787 0.16
788 0.16
789 0.15
790 0.13
791 0.16
792 0.18
793 0.18
794 0.19
795 0.23
796 0.29
797 0.32
798 0.33
799 0.29
800 0.3
801 0.34
802 0.37
803 0.34
804 0.27
805 0.24
806 0.22
807 0.21
808 0.17
809 0.12
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.1
814 0.12
815 0.12
816 0.15
817 0.15
818 0.16
819 0.21
820 0.28
821 0.36
822 0.41
823 0.49
824 0.54
825 0.61
826 0.63
827 0.64
828 0.65
829 0.66
830 0.67
831 0.64
832 0.65
833 0.62
834 0.58
835 0.53
836 0.44
837 0.38
838 0.3
839 0.28
840 0.21
841 0.16
842 0.16
843 0.15
844 0.15
845 0.14
846 0.13
847 0.09
848 0.08
849 0.08
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.06
854 0.06
855 0.08
856 0.09
857 0.1
858 0.12
859 0.13
860 0.14
861 0.14
862 0.14
863 0.12
864 0.15
865 0.17
866 0.15
867 0.15
868 0.2
869 0.25
870 0.28
871 0.29
872 0.29
873 0.29
874 0.3
875 0.28
876 0.3
877 0.24
878 0.22
879 0.21
880 0.22
881 0.2
882 0.18
883 0.18
884 0.11
885 0.11
886 0.09
887 0.09
888 0.06
889 0.06
890 0.08
891 0.09
892 0.12
893 0.14
894 0.15
895 0.15
896 0.17
897 0.2
898 0.19
899 0.27
900 0.25
901 0.23
902 0.25
903 0.29
904 0.34
905 0.33
906 0.38
907 0.31
908 0.31
909 0.32
910 0.32
911 0.36
912 0.38
913 0.47
914 0.51
915 0.56
916 0.6
917 0.66
918 0.7
919 0.71
920 0.72
921 0.73
922 0.75
923 0.78
924 0.83
925 0.86
926 0.86
927 0.86
928 0.85
929 0.82
930 0.77
931 0.69
932 0.65
933 0.57
934 0.53
935 0.46
936 0.38
937 0.31
938 0.26
939 0.25
940 0.19
941 0.18
942 0.14
943 0.13
944 0.13
945 0.14
946 0.16
947 0.18
948 0.19
949 0.21
950 0.22
951 0.24
952 0.25
953 0.26
954 0.23
955 0.2
956 0.21
957 0.2
958 0.19
959 0.17
960 0.15
961 0.15
962 0.17
963 0.17
964 0.17
965 0.19
966 0.18
967 0.21
968 0.2
969 0.21
970 0.21
971 0.21
972 0.21
973 0.19
974 0.24
975 0.24
976 0.27
977 0.26
978 0.31
979 0.33
980 0.32
981 0.33
982 0.29
983 0.28
984 0.26
985 0.24
986 0.22
987 0.22
988 0.2
989 0.18
990 0.18
991 0.17
992 0.19
993 0.21
994 0.2
995 0.22
996 0.22
997 0.22
998 0.22
999 0.25
1000 0.24
1001 0.24
1002 0.23
1003 0.24
1004 0.29
1005 0.33
1006 0.37
1007 0.34
1008 0.33
1009 0.32
1010 0.33
1011 0.33
1012 0.3
1013 0.29
1014 0.27
1015 0.32
1016 0.33
1017 0.31
1018 0.31
1019 0.28
1020 0.28
1021 0.26
1022 0.26
1023 0.23
1024 0.23
1025 0.27
1026 0.28
1027 0.35
1028 0.43
1029 0.5
1030 0.57
1031 0.61
1032 0.65
1033 0.67
1034 0.65
1035 0.61
1036 0.58
1037 0.59
1038 0.56
1039 0.56
1040 0.58
1041 0.61
1042 0.62
1043 0.58
1044 0.54
1045 0.49
1046 0.43
1047 0.37
1048 0.35
1049 0.32
1050 0.3
1051 0.3
1052 0.32
1053 0.3
1054 0.29
1055 0.28
1056 0.24
1057 0.18
1058 0.2
1059 0.2
1060 0.15
1061 0.2
1062 0.26
1063 0.29
1064 0.36
1065 0.44
1066 0.5
1067 0.58
1068 0.64
1069 0.63
1070 0.68
1071 0.74
1072 0.77
1073 0.79
1074 0.8
1075 0.76
1076 0.79
1077 0.74
1078 0.68
1079 0.6
1080 0.51
1081 0.42
1082 0.32
1083 0.28
1084 0.17
1085 0.15
1086 0.1
1087 0.09
1088 0.07
1089 0.13
1090 0.16
1091 0.2
1092 0.25
1093 0.27
1094 0.32
1095 0.41
1096 0.46
1097 0.45
1098 0.47
1099 0.49