Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8DDJ8

Protein Details
Accession A0A1B8DDJ8    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53ADERRKVGRKAGGSRRQMKTBasic
110-130SESNRRSRYFREKKIKGYYNDHydrophilic
396-415INSHDFWKRCPRRNNLQVFQHydrophilic
434-460DELNKQTPKQRARSRSRSRSRSRSISGHydrophilic
619-645EDKFAVNQRNARKRRKLVREESESDGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-50RRKVGRKAGGSRRQ
443-454QRARSRSRSRSR
631-632KR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MDFEDSDTGGHGYDVAPVDSDDSGSSYRASSESADERRKVGRKAGGSRRQMKTAVTAKRGDSEKSIPAPAISPSEHTEGPAAPEGNYDGEERSITASPRKRRASSTRYESESNRRSRYFREKKIKGYYNDGYRQLLNNDIKDAASCSLPSDYPPLPSSQIGSSMWTTAEKGSLFTALGRLGKDNIAGIATRIGSKSKLQVQEYLGLLQRNRGTKKPLVLTDLPVAFEVSQECSQALDEAAEALAMRQERHEESLEKAKWGDDSWLLTKGVNESVESHLSEPNGEHALAEVLPAAQLLNLGNWLELSTRVFMNPAGRNDENWRYLIEEGDEHGIRATAFSDFQNLAISVTKRLISATLFCAMSRMRAKDMDTQKKHRQEDVIGADVEAAAQMIGLSINSHDFWKRCPRRNNLQVFQRLTLSHGNRPPMEYDAVEDELNKQTPKQRARSRSRSRSRSRSISGSASGSRASSVSTINASDIDMSSDEEREYLSIAPSEASHGDSAMETDYDSEAQLQQGQGDYPPLSPRPAASEPMGHQATTISPESQELAYADKFDMVASMDEETRLWALLDQHPPILVKDEVDVLEKPKIKTRAKDDMVDWREKVEFWSPWEIHETLPGEDKFAVNQRNARKRRKLVREESESDGGDVDAVETEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.13
18 0.18
19 0.26
20 0.34
21 0.41
22 0.41
23 0.43
24 0.51
25 0.55
26 0.53
27 0.53
28 0.53
29 0.54
30 0.63
31 0.71
32 0.72
33 0.75
34 0.81
35 0.78
36 0.75
37 0.68
38 0.59
39 0.58
40 0.57
41 0.55
42 0.51
43 0.51
44 0.47
45 0.52
46 0.53
47 0.46
48 0.43
49 0.39
50 0.4
51 0.4
52 0.4
53 0.33
54 0.31
55 0.3
56 0.27
57 0.26
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.25
62 0.24
63 0.24
64 0.23
65 0.2
66 0.22
67 0.24
68 0.21
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.24
83 0.31
84 0.39
85 0.49
86 0.56
87 0.56
88 0.62
89 0.7
90 0.71
91 0.72
92 0.73
93 0.7
94 0.68
95 0.69
96 0.65
97 0.66
98 0.66
99 0.64
100 0.61
101 0.57
102 0.56
103 0.6
104 0.66
105 0.66
106 0.68
107 0.71
108 0.72
109 0.77
110 0.85
111 0.85
112 0.77
113 0.76
114 0.72
115 0.7
116 0.7
117 0.63
118 0.55
119 0.48
120 0.46
121 0.39
122 0.4
123 0.35
124 0.29
125 0.28
126 0.26
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.15
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.17
146 0.2
147 0.17
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.11
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.13
182 0.18
183 0.24
184 0.29
185 0.3
186 0.34
187 0.35
188 0.38
189 0.37
190 0.34
191 0.29
192 0.25
193 0.24
194 0.23
195 0.25
196 0.26
197 0.28
198 0.3
199 0.33
200 0.35
201 0.41
202 0.43
203 0.42
204 0.42
205 0.4
206 0.4
207 0.38
208 0.35
209 0.29
210 0.24
211 0.22
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.15
238 0.15
239 0.18
240 0.27
241 0.27
242 0.25
243 0.25
244 0.22
245 0.21
246 0.2
247 0.19
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.11
259 0.11
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.13
299 0.16
300 0.17
301 0.22
302 0.22
303 0.23
304 0.28
305 0.31
306 0.27
307 0.24
308 0.22
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.12
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.13
347 0.12
348 0.16
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.21
354 0.28
355 0.38
356 0.44
357 0.46
358 0.53
359 0.6
360 0.67
361 0.67
362 0.61
363 0.54
364 0.45
365 0.47
366 0.42
367 0.37
368 0.28
369 0.26
370 0.23
371 0.19
372 0.17
373 0.09
374 0.05
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.09
387 0.09
388 0.14
389 0.25
390 0.34
391 0.42
392 0.51
393 0.58
394 0.66
395 0.76
396 0.81
397 0.77
398 0.77
399 0.76
400 0.7
401 0.63
402 0.54
403 0.44
404 0.38
405 0.37
406 0.32
407 0.31
408 0.31
409 0.34
410 0.32
411 0.33
412 0.32
413 0.27
414 0.25
415 0.19
416 0.17
417 0.16
418 0.17
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.19
427 0.28
428 0.35
429 0.43
430 0.49
431 0.58
432 0.68
433 0.78
434 0.82
435 0.85
436 0.88
437 0.89
438 0.89
439 0.89
440 0.87
441 0.84
442 0.77
443 0.72
444 0.65
445 0.58
446 0.51
447 0.44
448 0.37
449 0.3
450 0.26
451 0.2
452 0.17
453 0.13
454 0.11
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.16
509 0.16
510 0.18
511 0.18
512 0.18
513 0.23
514 0.25
515 0.26
516 0.24
517 0.28
518 0.28
519 0.36
520 0.36
521 0.28
522 0.25
523 0.23
524 0.22
525 0.21
526 0.2
527 0.13
528 0.12
529 0.13
530 0.15
531 0.14
532 0.15
533 0.11
534 0.13
535 0.13
536 0.14
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.11
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.13
555 0.2
556 0.25
557 0.25
558 0.25
559 0.26
560 0.27
561 0.26
562 0.26
563 0.19
564 0.15
565 0.15
566 0.17
567 0.17
568 0.19
569 0.19
570 0.18
571 0.24
572 0.29
573 0.29
574 0.35
575 0.43
576 0.47
577 0.54
578 0.6
579 0.64
580 0.64
581 0.68
582 0.63
583 0.65
584 0.64
585 0.61
586 0.53
587 0.44
588 0.41
589 0.36
590 0.36
591 0.32
592 0.29
593 0.28
594 0.37
595 0.34
596 0.35
597 0.4
598 0.37
599 0.3
600 0.34
601 0.32
602 0.24
603 0.31
604 0.29
605 0.26
606 0.27
607 0.27
608 0.24
609 0.29
610 0.33
611 0.3
612 0.38
613 0.45
614 0.55
615 0.65
616 0.71
617 0.74
618 0.8
619 0.86
620 0.9
621 0.9
622 0.9
623 0.91
624 0.9
625 0.84
626 0.81
627 0.75
628 0.65
629 0.54
630 0.44
631 0.33
632 0.24
633 0.19
634 0.12