Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YHH9

Protein Details
Accession C7YHH9    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28GDSPRGKRRKTHGDSSPPYABasic
77-104YDEQSRRTSRSRSRSRSRSRSTTRSDSRHydrophilic
112-131PSVSRSRSPRSSRSRSRSQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-17KRR
85-124SRSRSRSRSRSRSTTRSDSRMRSRLSSPSVSRSRSPRSSR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR046851  NBCH_WD40  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG nhe:NECHADRAFT_122274  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20426  NBCH_WD40  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MASDDERVGDSPRGKRRKTHGDSSPPYAPRRDGEEDDASRSPSAHQGIRKLSIREHRRNSRTMSPSPGDEGTDRKYYDEQSRRTSRSRSRSRSRSRSTTRSDSRMRSRLSSPSVSRSRSPRSSRSRSRSQSSSTRSRTDSLSPRAPQPTPPPEPFKPNYRARLVLHGHTKPISQVRISPNGRFIASASADATVKIWDAATGAHMDTLFGHMAGVSCLAWTPDSNTIASGSDDKAIRLWDRVTGRPKTTARKTEAGQEMAPLKGHHNYIHCLAFSPKGNILASGSYDEAVFLWDVRAGRLMRQCLRTLVHEDNPAVTNVCFSPNGRFVLAFNLDNCIRLWDYVAGSVKKTYQGHLNEKFAVGGCFGVLDGAPFIASASEDGSIVLWDVVSKNVLQRVEGHAGVCFWVDVHEETMVSGGQDNTVRVYRHIRDAPVTNGTTVKEDPSSTDELPMKQEDVDMAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.62
3 0.69
4 0.75
5 0.76
6 0.77
7 0.77
8 0.78
9 0.81
10 0.8
11 0.78
12 0.72
13 0.68
14 0.62
15 0.55
16 0.47
17 0.49
18 0.48
19 0.43
20 0.45
21 0.5
22 0.48
23 0.5
24 0.48
25 0.43
26 0.36
27 0.32
28 0.27
29 0.25
30 0.27
31 0.27
32 0.3
33 0.36
34 0.41
35 0.48
36 0.51
37 0.47
38 0.5
39 0.55
40 0.61
41 0.64
42 0.69
43 0.72
44 0.73
45 0.77
46 0.76
47 0.76
48 0.73
49 0.67
50 0.65
51 0.57
52 0.53
53 0.51
54 0.46
55 0.38
56 0.32
57 0.32
58 0.28
59 0.3
60 0.28
61 0.27
62 0.28
63 0.31
64 0.39
65 0.44
66 0.45
67 0.5
68 0.58
69 0.61
70 0.64
71 0.69
72 0.68
73 0.7
74 0.75
75 0.76
76 0.78
77 0.84
78 0.89
79 0.91
80 0.9
81 0.89
82 0.87
83 0.86
84 0.84
85 0.84
86 0.8
87 0.77
88 0.76
89 0.74
90 0.74
91 0.73
92 0.67
93 0.61
94 0.57
95 0.56
96 0.55
97 0.53
98 0.47
99 0.49
100 0.52
101 0.51
102 0.52
103 0.52
104 0.54
105 0.57
106 0.6
107 0.61
108 0.65
109 0.72
110 0.78
111 0.78
112 0.81
113 0.78
114 0.79
115 0.74
116 0.7
117 0.69
118 0.66
119 0.68
120 0.63
121 0.6
122 0.56
123 0.52
124 0.49
125 0.47
126 0.48
127 0.45
128 0.48
129 0.45
130 0.47
131 0.5
132 0.48
133 0.45
134 0.45
135 0.47
136 0.46
137 0.48
138 0.51
139 0.49
140 0.56
141 0.54
142 0.54
143 0.54
144 0.54
145 0.56
146 0.52
147 0.55
148 0.48
149 0.54
150 0.49
151 0.46
152 0.47
153 0.41
154 0.39
155 0.35
156 0.34
157 0.28
158 0.29
159 0.26
160 0.19
161 0.24
162 0.27
163 0.36
164 0.38
165 0.36
166 0.35
167 0.35
168 0.34
169 0.28
170 0.24
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.13
226 0.16
227 0.21
228 0.27
229 0.3
230 0.31
231 0.36
232 0.4
233 0.43
234 0.48
235 0.5
236 0.48
237 0.48
238 0.48
239 0.49
240 0.5
241 0.43
242 0.36
243 0.31
244 0.27
245 0.23
246 0.23
247 0.15
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.2
255 0.21
256 0.19
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.16
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.13
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.11
283 0.11
284 0.16
285 0.2
286 0.25
287 0.28
288 0.31
289 0.32
290 0.31
291 0.32
292 0.31
293 0.32
294 0.31
295 0.3
296 0.3
297 0.29
298 0.28
299 0.28
300 0.25
301 0.21
302 0.16
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.16
309 0.18
310 0.2
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.23
315 0.25
316 0.21
317 0.17
318 0.2
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.14
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.22
330 0.2
331 0.2
332 0.22
333 0.21
334 0.25
335 0.26
336 0.23
337 0.26
338 0.33
339 0.41
340 0.46
341 0.49
342 0.44
343 0.43
344 0.42
345 0.35
346 0.27
347 0.18
348 0.12
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.11
378 0.16
379 0.16
380 0.16
381 0.19
382 0.24
383 0.28
384 0.28
385 0.26
386 0.22
387 0.22
388 0.21
389 0.18
390 0.12
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.1
405 0.12
406 0.12
407 0.15
408 0.19
409 0.2
410 0.21
411 0.29
412 0.3
413 0.38
414 0.42
415 0.42
416 0.44
417 0.47
418 0.49
419 0.48
420 0.46
421 0.38
422 0.36
423 0.34
424 0.32
425 0.28
426 0.26
427 0.21
428 0.21
429 0.22
430 0.25
431 0.3
432 0.26
433 0.32
434 0.33
435 0.32
436 0.36
437 0.35
438 0.32
439 0.26
440 0.26
441 0.21