Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NDT2

Protein Details
Accession A0A1B7NDT2    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-133IAKPAEQKDKEKKEKRAKRRPNRRGAKAVPGBasic
156-182GTDEAAKPKKRKKKSNRKYGRRATVVEBasic
196-218AAVPAKRQPRIRRPRARPVGQDPHydrophilic
253-273VSARVVRRRWGNPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-129QKDKEKKEKRAKRRPNRRGAK
161-177AKPKKRKKKSNRKYGRR
201-212KRQPRIRRPRAR
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 13.333, nucl 7, mito_nucl 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAAPVTENGVPSAAHEYVIEEAPAFKVFVGNLAYSTTDEGLEIFFAPVKSDIIATQVIMRGHKPAGYGFVTMSSAEAATQAVELLDSQELDGRPVIVQIAKPAEQKDKEKKEKRAKRRPNRRGAKAVPGEVTDAEANGDVKAEDTAAADAPGTDEAAKPKKRKKKSNRKYGRRATVVEGGEAPATESAPEDAAVPAKRQPRIRRPRARPVGQDPDGEPSKNMLFVANLGFSVDDESLSKLFTDAGISVVSARVVRRRWGNPRKSKGYGFVDVGSEEEQTRAMAALQGMEVNGRPIAVKVAVNSTSAPQEADADAAETAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.15
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.11
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.12
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.14
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.14
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.1
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.2
94 0.26
95 0.29
96 0.37
97 0.44
98 0.51
99 0.6
100 0.67
101 0.75
102 0.79
103 0.85
104 0.89
105 0.9
106 0.9
107 0.91
108 0.94
109 0.94
110 0.93
111 0.93
112 0.9
113 0.88
114 0.8
115 0.79
116 0.71
117 0.63
118 0.53
119 0.43
120 0.36
121 0.27
122 0.24
123 0.14
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.08
147 0.16
148 0.21
149 0.26
150 0.35
151 0.44
152 0.53
153 0.64
154 0.72
155 0.76
156 0.82
157 0.88
158 0.91
159 0.92
160 0.93
161 0.92
162 0.89
163 0.82
164 0.74
165 0.67
166 0.63
167 0.52
168 0.42
169 0.32
170 0.24
171 0.19
172 0.16
173 0.13
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.15
187 0.19
188 0.24
189 0.3
190 0.4
191 0.48
192 0.58
193 0.68
194 0.74
195 0.78
196 0.85
197 0.88
198 0.85
199 0.81
200 0.79
201 0.78
202 0.69
203 0.63
204 0.52
205 0.49
206 0.44
207 0.37
208 0.28
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.17
213 0.11
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.14
244 0.16
245 0.22
246 0.29
247 0.37
248 0.48
249 0.57
250 0.67
251 0.72
252 0.8
253 0.83
254 0.81
255 0.76
256 0.74
257 0.7
258 0.64
259 0.55
260 0.47
261 0.4
262 0.34
263 0.32
264 0.24
265 0.18
266 0.14
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.11
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.2
291 0.21
292 0.21
293 0.22
294 0.21
295 0.21
296 0.21
297 0.2
298 0.14
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.13
303 0.11