Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NEK0

Protein Details
Accession A0A1B7NEK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-223ILAQRKEEKALKKSKKSKKPKKSKTEKTSKKRHRIDDRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-223RKEEKALKKSKKSKKPKKSKTEKTSKKRHRIDDRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MTYRNFEFRGACEFGLHPPTAMNVVREINKINERELELGISGSWHDEYKDSAYVFIGGLHFDLTEGDVITIFSQFGEVMDVNLPRDKTTGKTKGFAFLMYEDQRSTVLAVDNLNGATVLGKTLRVDHVKNYKQPKVKGEDGEWEEPEEQSLNAKPETVMDEGPASDSDASSVISLDPEDPMREYILAQRKEEKALKKSKKSKKPKKSKTEKTSKKRHRIDDRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.27
4 0.21
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.16
11 0.2
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.27
16 0.32
17 0.32
18 0.31
19 0.31
20 0.31
21 0.31
22 0.29
23 0.24
24 0.18
25 0.17
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.13
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.11
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.12
71 0.1
72 0.12
73 0.12
74 0.14
75 0.22
76 0.3
77 0.3
78 0.34
79 0.34
80 0.37
81 0.37
82 0.34
83 0.26
84 0.18
85 0.22
86 0.2
87 0.2
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.06
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.19
114 0.29
115 0.33
116 0.39
117 0.45
118 0.48
119 0.52
120 0.55
121 0.55
122 0.52
123 0.53
124 0.5
125 0.45
126 0.46
127 0.44
128 0.43
129 0.38
130 0.33
131 0.28
132 0.24
133 0.23
134 0.15
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.13
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.19
172 0.27
173 0.29
174 0.3
175 0.36
176 0.37
177 0.44
178 0.5
179 0.5
180 0.5
181 0.58
182 0.66
183 0.7
184 0.79
185 0.82
186 0.87
187 0.9
188 0.92
189 0.93
190 0.94
191 0.94
192 0.95
193 0.96
194 0.96
195 0.96
196 0.96
197 0.96
198 0.95
199 0.95
200 0.95
201 0.95
202 0.93
203 0.93