Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NCR0

Protein Details
Accession A0A1B7NCR0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-258PTTRTHLRPSKAPKRTRKPNVVKRDWAHVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-248PSKAPKRTRKP
519-519R
523-538RGVAPARGGQRGAGPN
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADSEIMDSREYVMDQIINPRRENADQILEDLGLAGFPTREQVHREIEAKLLLPPDRIPEHWLPTYQIHWQPDISIQSLLTSEPSPPPTSLTFLRAGLEGRVIGYTEAPNAPLSTALTSTSMDRAPAPVANFVRGKSGYVPFKPGGLDDVILAANHTTGQSIKGLRTVPPGFSRGLRLPGDDAEEEALASLDDAADTKEDKHADESHVVDEERDFLPNGDSFGEVDELLPTTRTHLRPSKAPKRTRKPNVVKRDWAHVVDINKPMTNFHELVPDMAHQYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEASCLVMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNSKEFADWVGRTKKKDIYVISTAQRPVPLEHYIYAGRDMFKIVDASRNWLSNGYKDAGEALRRKQDKERDAAGLPPVQRVGARGAARGVQRGVAPARGGQRGAGPNGSAPRGRGGGQSRIIHTGADKNLYVHLLNHLQKKGLLPVVVFTLSKKRCEENASTLTNADLCTSVEKSEVHVAIEKALSRLKGSDKKLPQITRMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPARCVVFSNIRKHDGRSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVAGDTLPEQTSLLKMMLGTPGKLQSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSSQRLLPEHQKQVADHERTLSKMPKLECDVCLGDIERYYDFSLGFVGLNNKLCNMVASSPSNANLISSGRVVVLRDGHFKRGNVGVLLKPDLRQASSSAGKLYFVLAMVDQETKAGDKDVDDQAVPPRWPLNPTSLQLENLTYDLRSVTLNSISMVTSETMKVDATGIVDLHKKSLMLEIINSLQILVEKWVSTGSIPEANWGRVRTLDFQDTLRTRNDLDKHREGLSCTLCGEFDDHYLILHGQKTLRANIDNLKMAISDQNLDLIPDYEQRIEVLKELKFIDENSTIQLKGRVACEINSANELVLTELILENTLANYEPEEVVALLSCFVFQEKTEVEPVVPTKLEEGRDAILAISRRVESVQDRHKVSVENFKSNLKFGLMEVVYEWAKGMPFDQITALTDVPEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDMDLFKKLEEAQVKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.26
4 0.32
5 0.35
6 0.36
7 0.39
8 0.41
9 0.41
10 0.45
11 0.41
12 0.4
13 0.37
14 0.38
15 0.35
16 0.3
17 0.28
18 0.23
19 0.17
20 0.08
21 0.08
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.1
26 0.12
27 0.15
28 0.2
29 0.25
30 0.3
31 0.36
32 0.38
33 0.35
34 0.36
35 0.35
36 0.31
37 0.29
38 0.28
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.27
43 0.29
44 0.29
45 0.34
46 0.35
47 0.39
48 0.41
49 0.41
50 0.39
51 0.38
52 0.4
53 0.41
54 0.42
55 0.38
56 0.37
57 0.35
58 0.33
59 0.35
60 0.36
61 0.29
62 0.24
63 0.2
64 0.19
65 0.2
66 0.18
67 0.15
68 0.12
69 0.13
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.26
75 0.25
76 0.29
77 0.29
78 0.29
79 0.28
80 0.26
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.2
85 0.19
86 0.15
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.18
114 0.18
115 0.23
116 0.24
117 0.28
118 0.29
119 0.28
120 0.32
121 0.29
122 0.3
123 0.27
124 0.33
125 0.36
126 0.36
127 0.42
128 0.36
129 0.38
130 0.36
131 0.32
132 0.27
133 0.21
134 0.19
135 0.13
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.12
148 0.14
149 0.15
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.3
154 0.31
155 0.31
156 0.32
157 0.34
158 0.31
159 0.31
160 0.35
161 0.3
162 0.35
163 0.31
164 0.29
165 0.29
166 0.29
167 0.31
168 0.25
169 0.23
170 0.18
171 0.16
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.19
189 0.22
190 0.24
191 0.28
192 0.28
193 0.25
194 0.27
195 0.26
196 0.22
197 0.19
198 0.19
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.11
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.11
219 0.19
220 0.2
221 0.27
222 0.34
223 0.37
224 0.45
225 0.56
226 0.62
227 0.65
228 0.74
229 0.77
230 0.81
231 0.88
232 0.9
233 0.9
234 0.91
235 0.92
236 0.93
237 0.9
238 0.89
239 0.8
240 0.79
241 0.72
242 0.62
243 0.55
244 0.47
245 0.41
246 0.38
247 0.4
248 0.33
249 0.29
250 0.28
251 0.26
252 0.25
253 0.28
254 0.24
255 0.19
256 0.24
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.14
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.2
279 0.16
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.08
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.18
317 0.2
318 0.2
319 0.2
320 0.22
321 0.23
322 0.26
323 0.34
324 0.36
325 0.44
326 0.45
327 0.51
328 0.54
329 0.55
330 0.61
331 0.53
332 0.47
333 0.46
334 0.47
335 0.42
336 0.41
337 0.41
338 0.29
339 0.29
340 0.26
341 0.17
342 0.13
343 0.11
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.12
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.07
383 0.06
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.09
391 0.1
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.11
425 0.15
426 0.15
427 0.21
428 0.29
429 0.33
430 0.35
431 0.38
432 0.4
433 0.39
434 0.44
435 0.4
436 0.37
437 0.39
438 0.41
439 0.4
440 0.39
441 0.36
442 0.31
443 0.3
444 0.24
445 0.21
446 0.2
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.18
451 0.18
452 0.17
453 0.17
454 0.15
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.14
463 0.14
464 0.19
465 0.2
466 0.2
467 0.2
468 0.22
469 0.22
470 0.18
471 0.21
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.19
478 0.2
479 0.2
480 0.27
481 0.29
482 0.31
483 0.36
484 0.43
485 0.43
486 0.46
487 0.46
488 0.41
489 0.4
490 0.4
491 0.35
492 0.3
493 0.25
494 0.21
495 0.18
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.15
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.17
508 0.13
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.12
513 0.11
514 0.13
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.14
519 0.18
520 0.18
521 0.19
522 0.17
523 0.13
524 0.14
525 0.16
526 0.17
527 0.13
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.16
533 0.18
534 0.22
535 0.27
536 0.28
537 0.28
538 0.29
539 0.29
540 0.24
541 0.21
542 0.21
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.13
547 0.13
548 0.14
549 0.13
550 0.09
551 0.11
552 0.16
553 0.19
554 0.24
555 0.23
556 0.23
557 0.24
558 0.24
559 0.24
560 0.19
561 0.16
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.11
567 0.09
568 0.16
569 0.17
570 0.2
571 0.21
572 0.22
573 0.24
574 0.28
575 0.31
576 0.3
577 0.35
578 0.33
579 0.32
580 0.3
581 0.27
582 0.23
583 0.19
584 0.12
585 0.07
586 0.06
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.13
597 0.13
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.1
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.1
606 0.15
607 0.22
608 0.25
609 0.32
610 0.34
611 0.4
612 0.46
613 0.45
614 0.47
615 0.48
616 0.48
617 0.45
618 0.44
619 0.39
620 0.34
621 0.35
622 0.29
623 0.22
624 0.19
625 0.14
626 0.13
627 0.11
628 0.1
629 0.09
630 0.07
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.04
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.1
672 0.16
673 0.22
674 0.3
675 0.33
676 0.37
677 0.38
678 0.4
679 0.45
680 0.45
681 0.43
682 0.42
683 0.43
684 0.39
685 0.44
686 0.42
687 0.35
688 0.31
689 0.27
690 0.21
691 0.17
692 0.17
693 0.11
694 0.12
695 0.11
696 0.08
697 0.09
698 0.1
699 0.1
700 0.11
701 0.12
702 0.13
703 0.13
704 0.14
705 0.13
706 0.12
707 0.13
708 0.11
709 0.1
710 0.08
711 0.07
712 0.06
713 0.05
714 0.04
715 0.02
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.05
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.11
729 0.11
730 0.11
731 0.11
732 0.14
733 0.15
734 0.17
735 0.17
736 0.15
737 0.2
738 0.21
739 0.21
740 0.24
741 0.23
742 0.26
743 0.27
744 0.25
745 0.21
746 0.19
747 0.18
748 0.13
749 0.13
750 0.08
751 0.07
752 0.06
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.08
758 0.1
759 0.13
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.15
764 0.17
765 0.17
766 0.23
767 0.25
768 0.28
769 0.31
770 0.3
771 0.29
772 0.31
773 0.33
774 0.32
775 0.35
776 0.36
777 0.36
778 0.38
779 0.37
780 0.42
781 0.47
782 0.43
783 0.36
784 0.34
785 0.31
786 0.31
787 0.35
788 0.31
789 0.24
790 0.26
791 0.26
792 0.27
793 0.32
794 0.33
795 0.3
796 0.3
797 0.29
798 0.24
799 0.24
800 0.2
801 0.15
802 0.13
803 0.14
804 0.1
805 0.11
806 0.11
807 0.11
808 0.1
809 0.09
810 0.09
811 0.08
812 0.08
813 0.07
814 0.09
815 0.11
816 0.13
817 0.13
818 0.13
819 0.13
820 0.13
821 0.12
822 0.12
823 0.11
824 0.12
825 0.14
826 0.16
827 0.16
828 0.17
829 0.17
830 0.15
831 0.13
832 0.11
833 0.1
834 0.09
835 0.09
836 0.08
837 0.08
838 0.09
839 0.09
840 0.1
841 0.13
842 0.14
843 0.22
844 0.23
845 0.29
846 0.31
847 0.31
848 0.32
849 0.31
850 0.3
851 0.24
852 0.25
853 0.21
854 0.21
855 0.24
856 0.21
857 0.19
858 0.21
859 0.2
860 0.18
861 0.17
862 0.16
863 0.19
864 0.21
865 0.22
866 0.21
867 0.2
868 0.19
869 0.18
870 0.17
871 0.12
872 0.09
873 0.09
874 0.06
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.08
883 0.08
884 0.07
885 0.07
886 0.12
887 0.14
888 0.15
889 0.15
890 0.16
891 0.2
892 0.24
893 0.23
894 0.2
895 0.2
896 0.2
897 0.22
898 0.22
899 0.25
900 0.25
901 0.27
902 0.31
903 0.3
904 0.3
905 0.29
906 0.28
907 0.22
908 0.17
909 0.16
910 0.11
911 0.1
912 0.09
913 0.08
914 0.08
915 0.08
916 0.09
917 0.1
918 0.1
919 0.11
920 0.11
921 0.11
922 0.1
923 0.11
924 0.09
925 0.09
926 0.09
927 0.09
928 0.09
929 0.09
930 0.09
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.08
936 0.09
937 0.13
938 0.13
939 0.14
940 0.14
941 0.13
942 0.12
943 0.16
944 0.17
945 0.14
946 0.14
947 0.16
948 0.16
949 0.17
950 0.16
951 0.12
952 0.1
953 0.09
954 0.09
955 0.08
956 0.08
957 0.08
958 0.08
959 0.08
960 0.08
961 0.08
962 0.09
963 0.1
964 0.13
965 0.13
966 0.18
967 0.2
968 0.22
969 0.25
970 0.25
971 0.23
972 0.21
973 0.25
974 0.25
975 0.27
976 0.29
977 0.27
978 0.27
979 0.34
980 0.34
981 0.33
982 0.3
983 0.27
984 0.25
985 0.31
986 0.37
987 0.38
988 0.45
989 0.49
990 0.5
991 0.52
992 0.52
993 0.47
994 0.47
995 0.41
996 0.34
997 0.28
998 0.25
999 0.21
1000 0.2
1001 0.19
1002 0.13
1003 0.12
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.11
1007 0.12
1008 0.13
1009 0.13
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.13
1013 0.17
1014 0.2
1015 0.23
1016 0.26
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.32
1020 0.36
1021 0.35
1022 0.32
1023 0.29
1024 0.25
1025 0.24
1026 0.24
1027 0.19
1028 0.15
1029 0.12
1030 0.15
1031 0.14
1032 0.14
1033 0.14
1034 0.11
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.13
1039 0.14
1040 0.14
1041 0.16
1042 0.16
1043 0.18
1044 0.2
1045 0.19
1046 0.22
1047 0.22
1048 0.23
1049 0.22
1050 0.22
1051 0.25
1052 0.23
1053 0.22
1054 0.23
1055 0.24
1056 0.23
1057 0.23
1058 0.26
1059 0.22
1060 0.22
1061 0.23
1062 0.23
1063 0.22
1064 0.23
1065 0.27
1066 0.26
1067 0.26
1068 0.24
1069 0.23
1070 0.19
1071 0.18
1072 0.17
1073 0.12
1074 0.09
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.06
1078 0.07
1079 0.07
1080 0.07
1081 0.06
1082 0.06
1083 0.07
1084 0.06
1085 0.06
1086 0.07
1087 0.09
1088 0.09
1089 0.09
1090 0.09
1091 0.09
1092 0.08
1093 0.09
1094 0.08
1095 0.07
1096 0.07
1097 0.06
1098 0.06
1099 0.07
1100 0.07
1101 0.07
1102 0.12
1103 0.13
1104 0.16
1105 0.18
1106 0.19
1107 0.18
1108 0.21
1109 0.23
1110 0.22
1111 0.21
1112 0.18
1113 0.2
1114 0.24
1115 0.25
1116 0.22
1117 0.24
1118 0.21
1119 0.21
1120 0.21
1121 0.17
1122 0.17
1123 0.17
1124 0.17
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.16
1128 0.16
1129 0.2
1130 0.22
1131 0.3
1132 0.38
1133 0.43
1134 0.46
1135 0.47
1136 0.49
1137 0.5
1138 0.48
1139 0.5
1140 0.46
1141 0.47
1142 0.46
1143 0.51
1144 0.5
1145 0.47
1146 0.45
1147 0.35
1148 0.3
1149 0.22
1150 0.3
1151 0.22
1152 0.21
1153 0.2
1154 0.22
1155 0.2
1156 0.19
1157 0.19
1158 0.11
1159 0.11
1160 0.11
1161 0.11
1162 0.13
1163 0.14
1164 0.15
1165 0.15
1166 0.16
1167 0.18
1168 0.2
1169 0.2
1170 0.14
1171 0.14
1172 0.13
1173 0.12
1174 0.13
1175 0.11
1176 0.09
1177 0.12
1178 0.11
1179 0.12
1180 0.14
1181 0.14
1182 0.15
1183 0.19
1184 0.2
1185 0.22
1186 0.26
1187 0.31
1188 0.34
1189 0.36
1190 0.37
1191 0.35
1192 0.34
1193 0.38
1194 0.37
1195 0.33
1196 0.3
1197 0.28
1198 0.26
1199 0.25
1200 0.24
1201 0.18
1202 0.16
1203 0.17
1204 0.16
1205 0.15
1206 0.16
1207 0.15
1208 0.21
1209 0.24
1210 0.27
1211 0.34
1212 0.43
1213 0.48
1214 0.49
1215 0.54
1216 0.48
1217 0.45
1218 0.44
1219 0.37
1220 0.32