Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7MSV8

Protein Details
Accession A0A1B7MSV8    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26SFQCHKCSDVVKKPKLNQHHGFCHHydrophilic
145-168TGEVKSKKKSKSESKPKDKKMSEDBasic
177-206APSSPSPQKTEKKKKDKKHKKSTDDQTNAVHydrophilic
219-242EISGEKEKKSKKKEKRKVAVVEADBasic
272-299AGAGGDDKKDKKRKRKKDKVEETSTNGVBasic
307-332VEGEGKIKAKKRKRDKSETSPKDAMDBasic
337-361PTDAVAPTEKKKKKHEKLAPCVEASHydrophilic
365-392VDAPPSHDEKKEKKKEKKSKKSSKASESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-164KSKKKSKSESKPKDKK
184-197QKTEKKKKDKKHKK
224-235KEKKSKKKEKRK
260-266SKKRKRD
275-290GGDDKKDKKRKRKKDK
311-322GKIKAKKRKRDK
346-351KKKKKH
374-389KKEKKKEKKSKKSSKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFQCHKCSDVVKKPKLNQHHGFCHAPFDCIDCSTTFHTPAEYQGHTTCITEAEKYQKTLYKGPKTGGGWGAAPRENGRGGFQGRGGYQARPTRYQATGANGTPLGTPQRMSPITTPPEPEPEQSAVPIKPMEVQPSKNSVPETGEVKSKKKSKSESKPKDKKMSEDTILVELPPAPSSPSPQKTEKKKKDKKHKKSTDDQTNAVESAVDPNTPVPVEISGEKEKKSKKKEKRKVAVVEADAPESQVVDGEGDDENVKSKKRKRDDGIVDAGAGGDDKKDKKRKRKKDKVEETSTNGVSTDPSAAVEGEGKIKAKKRKRDKSETSPKDAMDVDVTPTDAVAPTEKKKKKHEKLAPCVEASPVDVDAPPSHDEKKEKKKEKKSKKSSKASES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.82
4 0.84
5 0.83
6 0.82
7 0.81
8 0.8
9 0.77
10 0.75
11 0.66
12 0.64
13 0.54
14 0.47
15 0.37
16 0.32
17 0.28
18 0.23
19 0.24
20 0.17
21 0.19
22 0.22
23 0.25
24 0.24
25 0.22
26 0.24
27 0.23
28 0.27
29 0.29
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.27
34 0.25
35 0.25
36 0.21
37 0.18
38 0.18
39 0.17
40 0.19
41 0.25
42 0.28
43 0.3
44 0.33
45 0.35
46 0.38
47 0.45
48 0.52
49 0.53
50 0.53
51 0.53
52 0.56
53 0.52
54 0.54
55 0.47
56 0.39
57 0.31
58 0.31
59 0.34
60 0.28
61 0.28
62 0.24
63 0.24
64 0.24
65 0.22
66 0.21
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.21
73 0.26
74 0.26
75 0.22
76 0.27
77 0.31
78 0.34
79 0.35
80 0.38
81 0.37
82 0.37
83 0.39
84 0.35
85 0.35
86 0.36
87 0.33
88 0.31
89 0.26
90 0.26
91 0.22
92 0.21
93 0.17
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.19
98 0.19
99 0.22
100 0.23
101 0.27
102 0.31
103 0.32
104 0.35
105 0.29
106 0.35
107 0.34
108 0.32
109 0.29
110 0.26
111 0.25
112 0.23
113 0.26
114 0.19
115 0.19
116 0.18
117 0.14
118 0.16
119 0.16
120 0.22
121 0.22
122 0.25
123 0.26
124 0.32
125 0.33
126 0.32
127 0.31
128 0.25
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.19
133 0.24
134 0.25
135 0.28
136 0.33
137 0.38
138 0.41
139 0.45
140 0.53
141 0.57
142 0.66
143 0.74
144 0.78
145 0.83
146 0.87
147 0.89
148 0.9
149 0.81
150 0.76
151 0.71
152 0.67
153 0.57
154 0.5
155 0.43
156 0.34
157 0.32
158 0.26
159 0.19
160 0.13
161 0.11
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.11
167 0.18
168 0.22
169 0.26
170 0.33
171 0.41
172 0.51
173 0.62
174 0.69
175 0.73
176 0.78
177 0.84
178 0.88
179 0.92
180 0.92
181 0.92
182 0.92
183 0.88
184 0.89
185 0.89
186 0.89
187 0.81
188 0.72
189 0.62
190 0.52
191 0.45
192 0.34
193 0.24
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.12
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.25
212 0.32
213 0.39
214 0.48
215 0.55
216 0.6
217 0.7
218 0.79
219 0.85
220 0.88
221 0.89
222 0.86
223 0.83
224 0.78
225 0.69
226 0.64
227 0.54
228 0.45
229 0.35
230 0.28
231 0.2
232 0.14
233 0.11
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.11
245 0.14
246 0.2
247 0.27
248 0.37
249 0.45
250 0.55
251 0.58
252 0.67
253 0.72
254 0.73
255 0.71
256 0.62
257 0.53
258 0.43
259 0.37
260 0.26
261 0.18
262 0.1
263 0.05
264 0.08
265 0.12
266 0.22
267 0.32
268 0.41
269 0.52
270 0.64
271 0.74
272 0.82
273 0.9
274 0.92
275 0.94
276 0.96
277 0.95
278 0.94
279 0.88
280 0.83
281 0.78
282 0.67
283 0.55
284 0.44
285 0.34
286 0.25
287 0.2
288 0.15
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.17
300 0.25
301 0.34
302 0.42
303 0.51
304 0.6
305 0.7
306 0.78
307 0.85
308 0.88
309 0.9
310 0.92
311 0.9
312 0.87
313 0.81
314 0.7
315 0.62
316 0.53
317 0.43
318 0.34
319 0.27
320 0.21
321 0.17
322 0.17
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.16
330 0.23
331 0.34
332 0.4
333 0.47
334 0.57
335 0.68
336 0.74
337 0.8
338 0.84
339 0.84
340 0.9
341 0.93
342 0.87
343 0.78
344 0.68
345 0.58
346 0.49
347 0.39
348 0.3
349 0.2
350 0.16
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.18
355 0.18
356 0.2
357 0.22
358 0.27
359 0.35
360 0.43
361 0.54
362 0.61
363 0.7
364 0.78
365 0.85
366 0.91
367 0.94
368 0.95
369 0.95
370 0.96
371 0.96
372 0.96