Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NF80

Protein Details
Accession A0A1B7NF80    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-78STVGAKKTTKKAVAKKPVAKKTAAKKAAPKKAKAKPRPKAKVKKTVEKPALPHydrophilic
167-192KINARRTSDGKKKIHRPRQESDHPRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-84AKKTTKKAVAKKPVAKKTAAKKAAPKKAKAKPRPKAKVKKTVEKPALPKRVPKS
170-184ARRTSDGKKKIHRPR
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22011  HMG-box_IXR1-like_rpt1  
cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLCLPQFWLCLHSPRRVLPVAASKSASTVGAKKTTKKAVAKKPVAKKTAAKKAAPKKAKAKPRPKAKVKKTVEKPALPKRVPKSEQPPSRPPNAYILFFTKLAQNNKENYKSIEDTQAASKQAAATWKGFTLAEKQPYYDEVEVLKKQYDEKLHEYWKNAPPQIVRKINARRTSDGKKKIHRPRQESDHPRPMVPFFRFAQDFRQSPDGRAIKDAGVTSTGQPTVNIAREAGTRWRTMSDSEKAPYVNAYQTAYADWAANRPKTTSASASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.44
4 0.43
5 0.4
6 0.46
7 0.44
8 0.43
9 0.41
10 0.35
11 0.34
12 0.34
13 0.29
14 0.21
15 0.21
16 0.23
17 0.3
18 0.33
19 0.38
20 0.45
21 0.52
22 0.57
23 0.62
24 0.67
25 0.69
26 0.77
27 0.81
28 0.82
29 0.84
30 0.85
31 0.8
32 0.75
33 0.72
34 0.71
35 0.72
36 0.69
37 0.64
38 0.65
39 0.71
40 0.77
41 0.76
42 0.73
43 0.73
44 0.75
45 0.81
46 0.82
47 0.82
48 0.81
49 0.85
50 0.88
51 0.89
52 0.91
53 0.9
54 0.9
55 0.88
56 0.89
57 0.86
58 0.86
59 0.83
60 0.79
61 0.78
62 0.77
63 0.79
64 0.7
65 0.69
66 0.65
67 0.67
68 0.63
69 0.62
70 0.62
71 0.62
72 0.69
73 0.68
74 0.72
75 0.66
76 0.7
77 0.65
78 0.56
79 0.55
80 0.49
81 0.43
82 0.35
83 0.35
84 0.29
85 0.27
86 0.26
87 0.22
88 0.25
89 0.27
90 0.29
91 0.3
92 0.32
93 0.38
94 0.41
95 0.37
96 0.34
97 0.35
98 0.33
99 0.3
100 0.31
101 0.26
102 0.24
103 0.25
104 0.25
105 0.21
106 0.19
107 0.18
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.15
119 0.17
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.22
125 0.24
126 0.19
127 0.16
128 0.12
129 0.15
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.25
139 0.29
140 0.35
141 0.37
142 0.38
143 0.41
144 0.43
145 0.43
146 0.39
147 0.37
148 0.35
149 0.39
150 0.46
151 0.44
152 0.4
153 0.43
154 0.51
155 0.56
156 0.61
157 0.58
158 0.53
159 0.54
160 0.62
161 0.63
162 0.64
163 0.64
164 0.65
165 0.71
166 0.78
167 0.81
168 0.81
169 0.79
170 0.78
171 0.79
172 0.81
173 0.81
174 0.79
175 0.79
176 0.71
177 0.64
178 0.58
179 0.52
180 0.48
181 0.4
182 0.36
183 0.27
184 0.31
185 0.32
186 0.31
187 0.35
188 0.35
189 0.34
190 0.33
191 0.41
192 0.36
193 0.36
194 0.44
195 0.4
196 0.35
197 0.36
198 0.34
199 0.26
200 0.27
201 0.26
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.18
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.17
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222 0.26
223 0.26
224 0.29
225 0.33
226 0.31
227 0.33
228 0.33
229 0.35
230 0.33
231 0.32
232 0.3
233 0.26
234 0.24
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.19
245 0.25
246 0.28
247 0.28
248 0.29
249 0.32
250 0.34
251 0.38