FuNGI

A0A1B7NF29

Protein Details

Accession

A0A1B7NF29

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	AESLLFHKKKSIKKEPSTPSTAS	Hydrophilic
165-191	LSKEKDKGKGPGRKKFQKKTRQVFLVP	Basic
243-262	VPANRWYKFQKKPKHYVPGL	Hydrophilic
602-627	AVNGMTAPPKPKKRKPLPSGPAPDGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
167-184	KEKDKGKGPGRKKFQKKT
610-617	PKPKKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPPKSAESLLFHKKKSIKKEPSTPSTASQGSQPSQSQSQSQSSLRKSTTPRIQPTPPDADVDDSSKLPEGEFAEYKLMSSALNGWKYDVMKFDSRKTVDISTWEEPIKLNRKELRREESGPSTQVPAAPMQGADGKPVVGSDGKIVMVDADGRPIANNNNGGEPLSKEKDKGKGPGRKKFQKKTRQVFLVPEATRQLRREERYPWVMEDAKQNEMWVGKLEEVAKAETHALFMPAAQEVFKFVPANRWYKFQKKPKHYVPGLEEAEALMAKIQKNKDPERWLLHRRKGQAPSAATTEMFKAEAENRVVSGSSSLVYSSGQSRAMGGRTLRTTNRGPQGGGDDDDEGAPRKKEENDMEGDLDEQLFDDEFADDEEAGPADMDEEEAKELEERLKREYKSANKTREGYVDESESEDGDSQLTKDGKSLKKLMRKLEKNAAYDSDEERNPYASSNEEEEEEEEPVVTTGAIQEQPAQNKSRSASQQPTPKPSQPSTSATQNGSGVGSRATSPAPTSMGGHSIVAKRATSPKAPKLKSTPTNGSRATIGQSTGSRATSPVTGSRATSPAAPAKGPGSPTPNGQSTSSNKRKATDDLGGGAVSPGAAVNGMTAPPKPKKRKPLPSGPAPDGELEEKMLVEWLQNTPNATTRDCIQYFTPYLTTDAKKAKFTAMVKEVAQLKGGILVLRNRDASAAASPAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.66
3	0.68
4	0.69
5	0.72
6	0.82
7	0.84
8	0.84
9	0.83
10	0.76
11	0.68
12	0.64
13	0.57
14	0.47
15	0.42
16	0.4
17	0.35
18	0.37
19	0.35
20	0.33
21	0.36
22	0.38
23	0.37
24	0.36
25	0.39
26	0.4
27	0.43
28	0.47
29	0.47
30	0.52
31	0.49
32	0.51
33	0.52
34	0.57
35	0.61
36	0.63
37	0.66
38	0.66
39	0.71
40	0.7
41	0.72
42	0.69
43	0.6
44	0.54
45	0.47
46	0.44
47	0.39
48	0.35
49	0.3
50	0.23
51	0.23
52	0.21
53	0.2
54	0.16
55	0.17
56	0.17
57	0.2
58	0.21
59	0.21
60	0.23
61	0.22
62	0.23
63	0.2
64	0.18
65	0.12
66	0.12
67	0.17
68	0.2
69	0.24
70	0.24
71	0.24
72	0.28
73	0.29
74	0.3
75	0.27
76	0.26
77	0.31
78	0.34
79	0.38
80	0.43
81	0.44
82	0.45
83	0.44
84	0.42
85	0.36
86	0.38
87	0.39
88	0.32
89	0.34
90	0.32
91	0.29
92	0.27
93	0.33
94	0.38
95	0.34
96	0.4
97	0.44
98	0.51
99	0.6
100	0.67
101	0.66
102	0.63
103	0.65
104	0.63
105	0.64
106	0.6
107	0.53
108	0.46
109	0.41
110	0.35
111	0.32
112	0.27
113	0.2
114	0.17
115	0.15
116	0.14
117	0.12
118	0.16
119	0.15
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.1
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.11
142	0.13
143	0.15
144	0.18
145	0.17
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.24
155	0.28
156	0.34
157	0.37
158	0.44
159	0.47
160	0.52
161	0.6
162	0.68
163	0.74
164	0.77
165	0.83
166	0.85
167	0.86
168	0.87
169	0.89
170	0.89
171	0.88
172	0.85
173	0.78
174	0.73
175	0.68
176	0.66
177	0.56
178	0.48
179	0.42
180	0.38
181	0.38
182	0.34
183	0.36
184	0.34
185	0.38
186	0.41
187	0.42
188	0.46
189	0.49
190	0.49
191	0.43
192	0.41
193	0.39
194	0.36
195	0.39
196	0.35
197	0.3
198	0.28
199	0.27
200	0.23
201	0.21
202	0.2
203	0.14
204	0.12
205	0.1
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.14
210	0.14
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.18
231	0.23
232	0.29
233	0.28
234	0.33
235	0.37
236	0.45
237	0.55
238	0.56
239	0.62
240	0.65
241	0.74
242	0.77
243	0.82
244	0.75
245	0.72
246	0.67
247	0.66
248	0.58
249	0.48
250	0.39
251	0.29
252	0.27
253	0.2
254	0.15
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.13
259	0.15
260	0.18
261	0.25
262	0.3
263	0.36
264	0.39
265	0.44
266	0.46
267	0.52
268	0.58
269	0.61
270	0.64
271	0.62
272	0.62
273	0.64
274	0.62
275	0.59
276	0.55
277	0.48
278	0.42
279	0.4
280	0.35
281	0.28
282	0.23
283	0.19
284	0.13
285	0.12
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.12
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.11
313	0.12
314	0.14
315	0.17
316	0.17
317	0.2
318	0.21
319	0.25
320	0.3
321	0.28
322	0.27
323	0.25
324	0.27
325	0.24
326	0.22
327	0.17
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.16
339	0.19
340	0.21
341	0.23
342	0.24
343	0.24
344	0.22
345	0.21
346	0.15
347	0.12
348	0.08
349	0.05
350	0.04
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.1
376	0.13
377	0.14
378	0.19
379	0.25
380	0.25
381	0.29
382	0.36
383	0.41
384	0.48
385	0.55
386	0.58
387	0.57
388	0.58
389	0.56
390	0.53
391	0.47
392	0.39
393	0.32
394	0.26
395	0.22
396	0.21
397	0.19
398	0.15
399	0.12
400	0.09
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.12
409	0.2
410	0.22
411	0.27
412	0.34
413	0.37
414	0.44
415	0.5
416	0.57
417	0.59
418	0.62
419	0.64
420	0.66
421	0.66
422	0.6
423	0.57
424	0.5
425	0.41
426	0.38
427	0.34
428	0.28
429	0.23
430	0.22
431	0.2
432	0.19
433	0.17
434	0.16
435	0.14
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.09
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.1
457	0.13
458	0.17
459	0.21
460	0.23
461	0.22
462	0.25
463	0.26
464	0.3
465	0.32
466	0.35
467	0.38
468	0.41
469	0.5
470	0.52
471	0.58
472	0.57
473	0.57
474	0.57
475	0.53
476	0.52
477	0.48
478	0.48
479	0.44
480	0.46
481	0.44
482	0.39
483	0.38
484	0.33
485	0.28
486	0.24
487	0.2
488	0.13
489	0.1
490	0.09
491	0.08
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.12
498	0.12
499	0.13
500	0.12
501	0.14
502	0.14
503	0.14
504	0.16
505	0.16
506	0.19
507	0.18
508	0.17
509	0.18
510	0.24
511	0.28
512	0.32
513	0.37
514	0.44
515	0.53
516	0.54
517	0.58
518	0.59
519	0.66
520	0.65
521	0.65
522	0.66
523	0.61
524	0.67
525	0.61
526	0.55
527	0.46
528	0.41
529	0.35
530	0.27
531	0.23
532	0.18
533	0.18
534	0.2
535	0.2
536	0.2
537	0.17
538	0.16
539	0.17
540	0.16
541	0.17
542	0.17
543	0.18
544	0.18
545	0.2
546	0.22
547	0.22
548	0.21
549	0.2
550	0.2
551	0.23
552	0.24
553	0.22
554	0.21
555	0.21
556	0.23
557	0.24
558	0.24
559	0.24
560	0.24
561	0.28
562	0.31
563	0.33
564	0.32
565	0.32
566	0.34
567	0.35
568	0.45
569	0.5
570	0.53
571	0.51
572	0.52
573	0.54
574	0.54
575	0.54
576	0.49
577	0.42
578	0.36
579	0.36
580	0.32
581	0.28
582	0.23
583	0.16
584	0.09
585	0.07
586	0.04
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.04
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.09
595	0.16
596	0.25
597	0.36
598	0.46
599	0.54
600	0.65
601	0.75
602	0.84
603	0.87
604	0.89
605	0.88
606	0.89
607	0.88
608	0.81
609	0.73
610	0.63
611	0.54
612	0.46
613	0.38
614	0.28
615	0.21
616	0.17
617	0.14
618	0.13
619	0.13
620	0.1
621	0.09
622	0.11
623	0.13
624	0.15
625	0.17
626	0.18
627	0.19
628	0.25
629	0.27
630	0.26
631	0.25
632	0.26
633	0.34
634	0.33
635	0.33
636	0.29
637	0.33
638	0.33
639	0.35
640	0.33
641	0.25
642	0.28
643	0.32
644	0.33
645	0.33
646	0.4
647	0.4
648	0.42
649	0.42
650	0.43
651	0.44
652	0.45
653	0.47
654	0.43
655	0.44
656	0.41
657	0.45
658	0.46
659	0.39
660	0.37
661	0.28
662	0.23
663	0.22
664	0.23
665	0.18
666	0.17
667	0.21
668	0.25
669	0.29
670	0.29
671	0.26
672	0.26
673	0.25
674	0.24
675	0.22

A0A1B7NF29

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer