Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YIN5

Protein Details
Accession C7YIN5    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-110RPAISRSGSLKQKKKPKKASRLSFGGDHydrophilic
280-302LSLGKRAEKERRKHDRQKMAELIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-103SLKQKKKPKKAS
227-233KKERRAR
285-293RAEKERRKH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG nhe:NECHADRAFT_75386  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSSFAGKRKAKVIKVADEEDTAESVSAPSGDTGSSDEPSKPLFGAKAGRKPFRQSGLRKSFNPADAENLRDDNNDEDDGPVVVRPAISRSGSLKQKKKPKKASRLSFGGDDGVAGDEDATEVFTPKKGPLGRALENSAIKRGLGTKGLPMRTLGDEDDRPRYSKEYLEELQSSTPNTPQNVSTLPPDDTDMMDLDASELEGAVIVESSDFNQPQATTILSEAEIREKKERRARLAKEKDFLSVEDDEGPFGKKKKDDTRLIAEDEDLGEGFDNYVEDGGLSLGKRAEKERRKHDRQKMAELINAAEGHTSDSSSDSDAERRIAYEAAQTRAGMDGLKKPRKDPGQEILQVPPKIAPLPSLTECLARLQTTLKGMEEEMKGKQARVEKLKREREEIVKREGEVQALLDDTGRKYQEAMGQGKVADAPANAPAELAGARGLETLGTPSRKPEEEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.6
4 0.52
5 0.49
6 0.41
7 0.33
8 0.24
9 0.17
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.11
20 0.13
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.19
31 0.27
32 0.33
33 0.41
34 0.48
35 0.55
36 0.57
37 0.63
38 0.66
39 0.66
40 0.68
41 0.67
42 0.7
43 0.73
44 0.76
45 0.7
46 0.7
47 0.68
48 0.63
49 0.58
50 0.48
51 0.45
52 0.41
53 0.42
54 0.37
55 0.32
56 0.28
57 0.25
58 0.25
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.11
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.1
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.46
80 0.51
81 0.56
82 0.66
83 0.75
84 0.81
85 0.85
86 0.87
87 0.88
88 0.91
89 0.92
90 0.9
91 0.86
92 0.79
93 0.69
94 0.59
95 0.49
96 0.38
97 0.28
98 0.19
99 0.13
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.26
117 0.33
118 0.36
119 0.38
120 0.41
121 0.39
122 0.41
123 0.39
124 0.33
125 0.27
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.2
133 0.25
134 0.27
135 0.26
136 0.24
137 0.25
138 0.23
139 0.24
140 0.19
141 0.17
142 0.19
143 0.21
144 0.27
145 0.25
146 0.26
147 0.25
148 0.27
149 0.24
150 0.25
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.28
155 0.28
156 0.26
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.16
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.02
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.22
213 0.24
214 0.31
215 0.38
216 0.43
217 0.45
218 0.53
219 0.58
220 0.62
221 0.7
222 0.68
223 0.64
224 0.6
225 0.54
226 0.45
227 0.38
228 0.3
229 0.2
230 0.17
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.11
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.23
241 0.32
242 0.4
243 0.46
244 0.5
245 0.56
246 0.56
247 0.56
248 0.49
249 0.4
250 0.31
251 0.24
252 0.19
253 0.1
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.07
270 0.08
271 0.1
272 0.14
273 0.24
274 0.32
275 0.41
276 0.51
277 0.6
278 0.7
279 0.79
280 0.85
281 0.85
282 0.82
283 0.83
284 0.79
285 0.7
286 0.62
287 0.52
288 0.43
289 0.35
290 0.29
291 0.2
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.17
312 0.19
313 0.2
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.13
320 0.12
321 0.18
322 0.27
323 0.34
324 0.35
325 0.36
326 0.44
327 0.51
328 0.55
329 0.54
330 0.52
331 0.54
332 0.58
333 0.58
334 0.56
335 0.56
336 0.5
337 0.43
338 0.36
339 0.28
340 0.25
341 0.23
342 0.19
343 0.14
344 0.2
345 0.21
346 0.23
347 0.22
348 0.22
349 0.23
350 0.23
351 0.22
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.18
356 0.2
357 0.21
358 0.18
359 0.17
360 0.18
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.21
365 0.27
366 0.27
367 0.26
368 0.3
369 0.31
370 0.37
371 0.45
372 0.53
373 0.56
374 0.66
375 0.76
376 0.75
377 0.74
378 0.72
379 0.72
380 0.73
381 0.68
382 0.66
383 0.59
384 0.56
385 0.55
386 0.49
387 0.4
388 0.3
389 0.26
390 0.18
391 0.16
392 0.15
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.17
400 0.21
401 0.25
402 0.31
403 0.32
404 0.3
405 0.31
406 0.3
407 0.3
408 0.27
409 0.22
410 0.16
411 0.13
412 0.12
413 0.14
414 0.15
415 0.15
416 0.14
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.11
429 0.16
430 0.2
431 0.2
432 0.25
433 0.31
434 0.33